More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00163 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002204  fumarate hydratase class II  91.97 
 
 		 461 aa  839    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00163  fumarate hydratase  100 
 
 		 461 aa  929    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1177  fumarate hydratase  78.52 
 
 		 461 aa  746    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.661179  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1650  fumarate hydratase  64.71 
 
 		 462 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  66.01 
 
 		 469 aa  601  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0951  fumarate hydratase  66.23 
 
 		 459 aa  589  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624822  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0944  fumarate hydratase  65.8 
 
 		 459 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0984  fumarate hydratase  66.01 
 
 		 459 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2108  fumarate hydratase  65.21 
 
 		 459 aa  587  1e-166  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.866969  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4271  fumarate hydratase  65.21 
 
 		 458 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58030  fumarate hydratase  63.24 
 
 		 458 aa  571  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0849  fumarate hydratase  63.39 
 
 		 448 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  64.59 
 
 		 456 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  63.08 
 
 		 462 aa  561  1.0000000000000001e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1738  fumarate hydratase  63.08 
 
 		 456 aa  561  1.0000000000000001e-159  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27180  fumarate hydratase  62.36 
 
 		 458 aa  560  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00136432  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5084  fumarate hydratase  62.58 
 
 		 458 aa  559  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209589  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  62.64 
 
 		 465 aa  557  1e-157  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4461  fumarate hydratase, class II  61.89 
 
 		 458 aa  552  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3686  fumarate lyase  60.61 
 
 		 463 aa  548  1e-154  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  61.67 
 
 		 475 aa  544  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  59.65 
 
 		 469 aa  539  9.999999999999999e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  58.3 
 
 		 469 aa  539  9.999999999999999e-153  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  60.8 
 
 		 460 aa  540  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4264  fumarate hydratase  63.26 
 
 		 458 aa  536  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  58.24 
 
 		 469 aa  535  1e-151  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0822  fumarate hydratase  59.65 
 
 		 457 aa  533  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0703  fumarate hydratase  63.48 
 
 		 458 aa  530  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00794329 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1384  fumarate hydratase  56.99 
 
 		 464 aa  524  1e-147  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01603  Fumarase  58.9 
 
 		 457 aa  524  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00674477  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3405  fumarate hydratase  56.89 
 
 		 458 aa  523  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0068  fumarate lyase  57.21 
 
 		 459 aa  502  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0229  fumarate lyase  56.02 
 
 		 457 aa  487  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1272  fumarate lyase  57.33 
 
 		 462 aa  472  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1441  fumarate lyase  54.47 
 
 		 461 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2056  fumarate hydratase  54.63 
 
 		 469 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  52.29 
 
 		 463 aa  455  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  52.07 
 
 		 464 aa  451  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  50.98 
 
 		 473 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  52.26 
 
 		 473 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  52.51 
 
 		 465 aa  444  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  50.76 
 
 		 472 aa  443  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  50.44 
 
 		 463 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  49.34 
 
 		 462 aa  440  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  50.98 
 
 		 463 aa  437  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  49.36 
 
 		 467 aa  431  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  48.58 
 
 		 471 aa  431  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  51.88 
 
 		 472 aa  429  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  48.25 
 
 		 475 aa  426  1e-118  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  50.43 
 
 		 465 aa  425  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  49.57 
 
 		 475 aa  423  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  47.37 
 
 		 459 aa  423  1e-117  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  47.15 
 
 		 459 aa  420  1e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  53.17 
 
 		 471 aa  419  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  46.85 
 
 		 480 aa  419  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  47.29 
 
 		 468 aa  420  1e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  52.22 
 
 		 464 aa  419  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  51.11 
 
 		 466 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  51.54 
 
 		 466 aa  416  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0935  fumarate lyase  50.66 
 
 		 476 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23010  fumarase  49.02 
 
 		 468 aa  415  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  50.35 
 
 		 464 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  50.11 
 
 		 473 aa  418  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  50.58 
 
 		 466 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  50.81 
 
 		 464 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1841  fumarate hydratase  46.27 
 
 		 462 aa  412  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194885  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  47.29 
 
 		 469 aa  414  1e-114  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  50.35 
 
 		 464 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  50.81 
 
 		 464 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1783  fumarate hydratase  46.27 
 
 		 462 aa  412  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  46.49 
 
 		 472 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  50.81 
 
 		 464 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  46.49 
 
 		 472 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  50.81 
 
 		 464 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  50.81 
 
 		 631 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  50.81 
 
 		 464 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  48.91 
 
 		 464 aa  414  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  50.81 
 
 		 464 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4243  fumarate hydratase  51.02 
 
 		 466 aa  412  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0560645 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3120  fumarate lyase  51.1 
 
 		 472 aa  412  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000941956  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01580  fumarate hydratase  47.47 
 
 		 467 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  47.47 
 
 		 467 aa  409  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1617  fumarate hydratase  46.27 
 
 		 462 aa  409  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1587  fumarate hydratase  46.05 
 
 		 462 aa  409  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2320  fumarate hydratase  47.47 
 
 		 467 aa  409  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  49.65 
 
 		 464 aa  411  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1796  fumarate hydratase  47.47 
 
 		 467 aa  409  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.114122  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  49.42 
 
 		 464 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  47.69 
 
 		 467 aa  410  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01570  hypothetical protein  47.47 
 
 		 467 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24852  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  49.42 
 
 		 464 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1895  fumarate hydratase  46.27 
 
 		 462 aa  411  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0261938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  49.42 
 
 		 464 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  46.89 
 
 		 459 aa  410  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  50.66 
 
 		 472 aa  410  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4649  fumarate hydratase  50.99 
 
 		 471 aa  409  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456115 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  48.78 
 
 		 469 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  48.83 
 
 		 467 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  46.94 
 
 		 463 aa  405  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  48.83 
 
 		 467 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>