More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1078 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  74.12 
 
 		 466 aa  662    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  74.78 
 
 		 464 aa  681    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4243  fumarate hydratase  74.78 
 
 		 466 aa  670    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0560645 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  76.09 
 
 		 463 aa  720    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  100 
 
 		 464 aa  929    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  73.09 
 
 		 473 aa  657    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3882  fumarate hydratase  75.05 
 
 		 463 aa  664    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.475519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0844  fumarate hydratase  75.27 
 
 		 463 aa  654    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  76.15 
 
 		 472 aa  689    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  75.22 
 
 		 464 aa  667    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  76.37 
 
 		 472 aa  664    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  76.52 
 
 		 462 aa  723    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  73.3 
 
 		 463 aa  670    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  71.74 
 
 		 465 aa  652    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  70.02 
 
 		 473 aa  631  1e-180  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0935  fumarate lyase  71.68 
 
 		 476 aa  625  1e-178  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  66.74 
 
 		 471 aa  625  1e-178  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  69.35 
 
 		 471 aa  617  1e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  68.76 
 
 		 465 aa  612  9.999999999999999e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  69.37 
 
 		 465 aa  611  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  65.23 
 
 		 473 aa  606  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0959  fumarate lyase  70.46 
 
 		 473 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  hitchhiker  0.000463461 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  64.3 
 
 		 475 aa  592  1e-168  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23010  fumarase  65.01 
 
 		 468 aa  587  1e-166  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05170  fumarate hydratase  62.28 
 
 		 473 aa  578  1e-164  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11119  fumarate hydratase  66.59 
 
 		 474 aa  568  1e-160  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.954044 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  63.99 
 
 		 466 aa  561  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0720  fumarate hydratase  68.48 
 
 		 464 aa  560  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3120  fumarate lyase  63.7 
 
 		 472 aa  553  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000941956  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2065  fumarate hydratase  63.02 
 
 		 469 aa  548  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0865781 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4649  fumarate hydratase  63.89 
 
 		 471 aa  548  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456115 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4122  fumarate hydratase  64.55 
 
 		 473 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264623  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4353  fumarate hydratase  64.55 
 
 		 473 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121763  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4197  fumarate hydratase  64.55 
 
 		 473 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309456  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07330  fumarase  62.5 
 
 		 463 aa  534  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.24875 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  58.96 
 
 		 467 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  61.78 
 
 		 456 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1786  fumarate lyase  62.06 
 
 		 463 aa  496  1e-139  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.263641  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  55.97 
 
 		 469 aa  491  1e-137  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  60.14 
 
 		 459 aa  490  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  55.9 
 
 		 469 aa  478  1e-134  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  54.11 
 
 		 468 aa  478  1e-134  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  57.96 
 
 		 465 aa  479  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  55.7 
 
 		 469 aa  481  1e-134  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  54.31 
 
 		 480 aa  481  1e-134  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  54.84 
 
 		 469 aa  477  1e-133  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  56.39 
 
 		 469 aa  472  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  55.7 
 
 		 469 aa  474  1e-132  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  54.48 
 
 		 460 aa  474  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  53.75 
 
 		 472 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  56.62 
 
 		 462 aa  466  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  52.69 
 
 		 475 aa  464  1e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  56.06 
 
 		 468 aa  464  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5854  fumarate lyase  56.52 
 
 		 440 aa  462  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  51.94 
 
 		 463 aa  461  9.999999999999999e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  51.4 
 
 		 465 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5084  fumarate hydratase  57.47 
 
 		 458 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209589  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  53.79 
 
 		 469 aa  457  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  54.25 
 
 		 475 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  52.8 
 
 		 474 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  53.02 
 
 		 464 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  53.02 
 
 		 464 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  53.02 
 
 		 464 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  53.02 
 
 		 464 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3367  fumarate hydratase  51.88 
 
 		 463 aa  448  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.328502  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0853  fumarate lyase  50 
 
 		 474 aa  450  1e-125  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104747  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  51.19 
 
 		 471 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58030  fumarate hydratase  56.11 
 
 		 458 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  53.02 
 
 		 464 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  52.19 
 
 		 464 aa  448  1.0000000000000001e-124  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  51.4 
 
 		 461 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  53.23 
 
 		 631 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  52.8 
 
 		 464 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  52.6 
 
 		 464 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2108  fumarate hydratase  56.67 
 
 		 459 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.866969  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  50.97 
 
 		 461 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  56.01 
 
 		 463 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  50.97 
 
 		 461 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  51.21 
 
 		 462 aa  442  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27180  fumarate hydratase  54.87 
 
 		 458 aa  443  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00136432  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1650  fumarate hydratase  52.47 
 
 		 462 aa  443  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  50.97 
 
 		 466 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  51.99 
 
 		 463 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  52.48 
 
 		 463 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  52.61 
 
 		 464 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1189  fumarate hydratase, class II  49.57 
 
 		 466 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  52.05 
 
 		 463 aa  435  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2947  fumarate hydratase  51.18 
 
 		 466 aa  435  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1384  fumarate hydratase  49.78 
 
 		 464 aa  437  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3215  fumarate hydratase, class II  52.26 
 
 		 468 aa  437  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587959  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  52.38 
 
 		 464 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1177  fumarate hydratase  53.05 
 
 		 461 aa  437  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.661179  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0822  fumarate hydratase  54.13 
 
 		 457 aa  438  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 463 aa  433  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  48.03 
 
 		 459 aa  433  1e-120  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  50.97 
 
 		 461 aa  434  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2213  fumarate hydratase  51.29 
 
 		 464 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.620267  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  49.78 
 
 		 510 aa  432  1e-120  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  51.47 
 
 		 462 aa  434  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  51.73 
 
 		 470 aa  435  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>