More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2108 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2108  fumarate hydratase  100 
 
 		 459 aa  923    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.866969  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  67.69 
 
 		 469 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1738  fumarate hydratase  64.77 
 
 		 456 aa  601  1.0000000000000001e-171  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27180  fumarate hydratase  65.5 
 
 		 458 aa  587  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00136432  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1177  fumarate hydratase  65.13 
 
 		 461 aa  587  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.661179  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002204  fumarate hydratase class II  64.77 
 
 		 461 aa  582  1.0000000000000001e-165  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5084  fumarate hydratase  65.07 
 
 		 458 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209589  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58030  fumarate hydratase  64.85 
 
 		 458 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127723  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4461  fumarate hydratase, class II  64.63 
 
 		 458 aa  580  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  65.35 
 
 		 465 aa  579  1e-164  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00163  fumarate hydratase  65.21 
 
 		 461 aa  579  1e-164  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1650  fumarate hydratase  61.57 
 
 		 462 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0984  fumarate hydratase  65.07 
 
 		 459 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0944  fumarate hydratase  64.63 
 
 		 459 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4264  fumarate hydratase  65.57 
 
 		 458 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0951  fumarate hydratase  65.07 
 
 		 459 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1384  fumarate hydratase  60 
 
 		 464 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4271  fumarate hydratase  63.76 
 
 		 458 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3686  fumarate lyase  61.69 
 
 		 463 aa  564  1.0000000000000001e-159  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  64.3 
 
 		 456 aa  559  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  63.13 
 
 		 475 aa  559  1e-158  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01603  Fumarase  61.32 
 
 		 457 aa  555  1e-157  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00674477  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0849  fumarate hydratase  62.72 
 
 		 448 aa  556  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  64.1 
 
 		 462 aa  552  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1272  fumarate lyase  64.44 
 
 		 462 aa  548  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0703  fumarate hydratase  64.47 
 
 		 458 aa  550  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00794329 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  61.62 
 
 		 469 aa  549  1e-155  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  61.45 
 
 		 469 aa  546  1e-154  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  61.56 
 
 		 469 aa  543  1e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3405  fumarate hydratase  59.96 
 
 		 458 aa  540  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  58.09 
 
 		 460 aa  526  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0068  fumarate lyase  59.74 
 
 		 459 aa  513  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0822  fumarate hydratase  58.06 
 
 		 457 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2056  fumarate hydratase  58.01 
 
 		 469 aa  499  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1441  fumarate lyase  57.33 
 
 		 461 aa  485  1e-136  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  52.79 
 
 		 472 aa  472  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  52.26 
 
 		 468 aa  473  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  51.72 
 
 		 469 aa  467  9.999999999999999e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  52.05 
 
 		 475 aa  466  9.999999999999999e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  54.9 
 
 		 463 aa  468  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  52.72 
 
 		 467 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  55.24 
 
 		 463 aa  464  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  51.74 
 
 		 462 aa  457  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  49.89 
 
 		 480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  52.83 
 
 		 464 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 468 aa  449  1e-125  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  51.3 
 
 		 463 aa  449  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  53.71 
 
 		 465 aa  448  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  51.56 
 
 		 459 aa  446  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  52.74 
 
 		 473 aa  441  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  49.79 
 
 		 469 aa  445  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  51.42 
 
 		 471 aa  444  1e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2065  fumarate hydratase  53.88 
 
 		 469 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0865781 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  53.88 
 
 		 466 aa  441  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0229  fumarate lyase  50.66 
 
 		 457 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4649  fumarate hydratase  53.98 
 
 		 471 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456115 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  53.16 
 
 		 465 aa  436  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4243  fumarate hydratase  52.85 
 
 		 466 aa  436  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0560645 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07330  fumarase  51.88 
 
 		 463 aa  432  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.24875 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  53.56 
 
 		 465 aa  433  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  56.67 
 
 		 464 aa  434  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  52.29 
 
 		 472 aa  435  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  53.29 
 
 		 466 aa  433  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11119  fumarate hydratase  53.67 
 
 		 474 aa  433  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.954044 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05170  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 473 aa  430  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  48.69 
 
 		 471 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4353  fumarate hydratase  53.32 
 
 		 473 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121763  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4122  fumarate hydratase  53.32 
 
 		 473 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264623  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  52.07 
 
 		 471 aa  427  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  51.94 
 
 		 473 aa  425  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4197  fumarate hydratase  53.32 
 
 		 473 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309456  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23010  fumarase  52.52 
 
 		 468 aa  421  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  51.29 
 
 		 475 aa  421  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  51.09 
 
 		 473 aa  420  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  48.68 
 
 		 469 aa  419  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3120  fumarate lyase  52.33 
 
 		 472 aa  418  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000941956  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  51.53 
 
 		 464 aa  420  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0935  fumarate lyase  54.25 
 
 		 476 aa  413  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  47.28 
 
 		 463 aa  409  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  48.02 
 
 		 472 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  44.4 
 
 		 459 aa  409  1e-113  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  48.02 
 
 		 472 aa  409  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  52.75 
 
 		 472 aa  411  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  47.37 
 
 		 461 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  44.18 
 
 		 459 aa  406  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  46.62 
 
 		 465 aa  405  1.0000000000000001e-112  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  47.69 
 
 		 464 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  47.69 
 
 		 464 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  47.91 
 
 		 464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1786  fumarate lyase  52.46 
 
 		 463 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.263641  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  47.37 
 
 		 461 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  47.69 
 
 		 464 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  47.91 
 
 		 464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  47.69 
 
 		 464 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0083  fumarate hydratase  46.62 
 
 		 466 aa  404  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2270  fumarate hydratase  47.06 
 
 		 465 aa  404  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3341  fumarate lyase  47.15 
 
 		 484 aa  402  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.611164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3882  fumarate hydratase  51.31 
 
 		 463 aa  402  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.475519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  45.85 
 
 		 465 aa  402  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1873  fumarate hydratase  47.06 
 
 		 465 aa  404  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0104019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>