More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3341 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2500  fumarate lyase  85.3 
 
 		 472 aa  825    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0925  fumarate lyase  96.62 
 
 		 484 aa  937    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.751355  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4762  fumarate lyase  73.57 
 
 		 473 aa  716    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3341  fumarate lyase  100 
 
 		 484 aa  987    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.611164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0550  aspartate ammonia-lyase  56.87 
 
 		 467 aa  500  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1415  aspartate ammonia-lyase  53.89 
 
 		 466 aa  487  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24959e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2795  aspartate ammonia-lyase  53.25 
 
 		 466 aa  487  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000791072  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0940  aspartate ammonia-lyase  52.84 
 
 		 467 aa  480  1e-134  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0286202  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2689  aspartate ammonia-lyase  52.13 
 
 		 476 aa  476  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0392115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2695  fumarate lyase  52.24 
 
 		 468 aa  473  1e-132  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3556  aspartate ammonia-lyase  52.45 
 
 		 471 aa  473  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3082  aspartate ammonia-lyase  51.9 
 
 		 469 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  52.2 
 
 		 467 aa  456  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0479  aspartate ammonia-lyase  53.18 
 
 		 463 aa  450  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0576  aspartate ammonia-lyase  47.8 
 
 		 477 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0520  aspartate ammonia-lyase  47.59 
 
 		 477 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0523  aspartate ammonia-lyase  47.59 
 
 		 477 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442808  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0609  aspartate ammonia-lyase  47.8 
 
 		 477 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0736  aspartate ammonia-lyase  47.59 
 
 		 477 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0153519  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4355  aspartate ammonia-lyase  49.58 
 
 		 474 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000233495  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0677  aspartate ammonia-lyase  47.59 
 
 		 477 aa  444  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0185443  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0665  aspartate ammonia-lyase  47.59 
 
 		 477 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0151100000000002e-47 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0520  aspartate ammonia-lyase  47.59 
 
 		 477 aa  444  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4691  aspartate ammonia-lyase  47.38 
 
 		 477 aa  444  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000148862  hitchhiker  1.50426e-18 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03150  aspartate ammonia-lyase  47.15 
 
 		 471 aa  442  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000322515  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  49.48 
 
 		 469 aa  444  1e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0526  aspartate ammonia-lyase  47.8 
 
 		 477 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0181392  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2602  aspartate ammonia-lyase  52.03 
 
 		 475 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1346  aspartate ammonia-lyase  51.6 
 
 		 475 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0647  aspartate ammonia-lyase  47.17 
 
 		 477 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00115494  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  49.9 
 
 		 472 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  48.21 
 
 		 480 aa  436  1e-121  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1245  aspartate ammonia-lyase  51.6 
 
 		 475 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.431098  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1667  aspartate ammonia-lyase  48.2 
 
 		 479 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0778255  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1811  aspartate ammonia-lyase  48.2 
 
 		 479 aa  432  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2119  aspartate ammonia-lyase  52.38 
 
 		 466 aa  435  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1921  aspartate ammonia-lyase  48.2 
 
 		 479 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1800  aspartate ammonia-lyase  48.2 
 
 		 479 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  47.81 
 
 		 469 aa  431  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1665  aspartate ammonia-lyase  47.78 
 
 		 479 aa  431  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2667  fumarase  44.14 
 
 		 479 aa  430  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.284725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  50 
 
 		 459 aa  429  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3530  aspartate ammonia-lyase  47.99 
 
 		 479 aa  431  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  47.81 
 
 		 468 aa  425  1e-118  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  48.75 
 
 		 468 aa  427  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3115  aspartate ammonia-lyase  47.36 
 
 		 476 aa  425  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  47.7 
 
 		 475 aa  425  1e-117  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  48.76 
 
 		 469 aa  424  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1872  aspartate ammonia-lyase  48.2 
 
 		 479 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1649  aspartate ammonia-lyase  48.2 
 
 		 479 aa  419  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1614  aspartate ammonia-lyase  48.2 
 
 		 479 aa  419  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1847  aspartate ammonia-lyase  48.2 
 
 		 479 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142722 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0391  thiamine biosynthesis protein ThiC  45.53 
 
 		 466 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3135  aspartate ammonia-lyase  47.47 
 
 		 476 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3158  aspartate ammonia-lyase  47.36 
 
 		 476 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2883  aspartate ammonia-lyase  47.36 
 
 		 476 aa  412  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1258  aspartate ammonia-lyase  50.43 
 
 		 481 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.963292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0193  aspartate ammonia-lyase  46.27 
 
 		 463 aa  413  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  49.9 
 
 		 463 aa  414  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1643  aspartate ammonia-lyase  46 
 
 		 474 aa  414  1e-114  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5387  aspartate ammonia-lyase  48.07 
 
 		 485 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1993  aspartate ammonia-lyase  45.22 
 
 		 463 aa  409  1e-113  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0082  aspartate ammonia-lyase  44.92 
 
 		 468 aa  410  1e-113  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1958  aspartate ammonia-lyase  48.8 
 
 		 483 aa  410  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.175554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2915  aspartate ammonia-lyase  47.36 
 
 		 476 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2845  aspartate ammonia-lyase  47.36 
 
 		 476 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2122  aspartate ammonia-lyase  47.15 
 
 		 476 aa  410  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3136  aspartate ammonia-lyase  47.36 
 
 		 476 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3455  aspartate ammonia-lyase  47.35 
 
 		 470 aa  409  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025134  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1884  aspartate ammonia-lyase  48.8 
 
 		 483 aa  409  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218686  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  48.6 
 
 		 456 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5338  aspartate ammonia-lyase  47.85 
 
 		 478 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486768 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0565  aspartate ammonia-lyase  48.6 
 
 		 521 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0355315 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5499  aspartate ammonia-lyase  48.71 
 
 		 474 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3758  fumarate lyase  48.19 
 
 		 471 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2167  aspartate ammonia-lyase  45.42 
 
 		 480 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5247  aspartate ammonia-lyase  48.07 
 
 		 478 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0371805  normal  0.169068 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0094  aspartate ammonia-lyase  44.92 
 
 		 468 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1905  fumarate lyase  46.25 
 
 		 475 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0122  aspartate ammonia-lyase  44.92 
 
 		 468 aa  408  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5051  aspartate ammonia-lyase  48.71 
 
 		 474 aa  405  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0135  aspartate ammonia-lyase  47.64 
 
 		 485 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2177  aspartate ammonia-lyase  46.27 
 
 		 475 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  47.07 
 
 		 463 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2108  fumarate hydratase  47.39 
 
 		 459 aa  400  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.866969  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2083  aspartate ammonia-lyase  46.27 
 
 		 475 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195347  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2438  aspartate ammonia-lyase  46.17 
 
 		 466 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.268607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  48.07 
 
 		 462 aa  401  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1293  aspartate ammonia-lyase  47.86 
 
 		 468 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0277144  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  45.72 
 
 		 469 aa  396  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2052  aspartate ammonia-lyase  44.47 
 
 		 485 aa  395  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0909745  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0481  aspartate ammonia-lyase  47.23 
 
 		 474 aa  397  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0682  aspartate ammonia-lyase  45.57 
 
 		 472 aa  397  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000328745  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0092  fumarate lyase  43.91 
 
 		 472 aa  398  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1299  fumarate lyase  48.91 
 
 		 479 aa  396  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160462  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  47.29 
 
 		 465 aa  397  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  46.32 
 
 		 464 aa  393  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71650  aspartate ammonia-lyase  48.28 
 
 		 474 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0474  aspartate ammonia-lyase  44.97 
 
 		 461 aa  393  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.180708  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2008  aspartate ammonia-lyase  43.8 
 
 		 468 aa  393  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>