More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2119 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2119  aspartate ammonia-lyase  100 
 
 		 466 aa  949    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3082  aspartate ammonia-lyase  53.56 
 
 		 469 aa  442  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4762  fumarate lyase  53.32 
 
 		 473 aa  442  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0479  aspartate ammonia-lyase  55.78 
 
 		 463 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2795  aspartate ammonia-lyase  51.89 
 
 		 466 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000791072  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1415  aspartate ammonia-lyase  52.12 
 
 		 466 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24959e-23 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3556  aspartate ammonia-lyase  52.97 
 
 		 471 aa  438  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3341  fumarate lyase  52.38 
 
 		 484 aa  436  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.611164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0550  aspartate ammonia-lyase  54.81 
 
 		 467 aa  438  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0925  fumarate lyase  52.58 
 
 		 484 aa  434  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.751355  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2695  fumarate lyase  50.67 
 
 		 468 aa  422  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0940  aspartate ammonia-lyase  51.12 
 
 		 467 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0286202  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2500  fumarate lyase  52.97 
 
 		 472 aa  419  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2689  aspartate ammonia-lyase  48.78 
 
 		 476 aa  415  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0392115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2602  aspartate ammonia-lyase  52.49 
 
 		 475 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1346  aspartate ammonia-lyase  52.26 
 
 		 475 aa  405  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1245  aspartate ammonia-lyase  52.04 
 
 		 475 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.431098  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1993  aspartate ammonia-lyase  43.81 
 
 		 463 aa  394  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0082  aspartate ammonia-lyase  45.23 
 
 		 468 aa  393  1e-108  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0122  aspartate ammonia-lyase  45.23 
 
 		 468 aa  392  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4355  aspartate ammonia-lyase  47.33 
 
 		 474 aa  392  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000233495  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0094  aspartate ammonia-lyase  45.01 
 
 		 468 aa  390  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1258  aspartate ammonia-lyase  51.26 
 
 		 481 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.963292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2667  fumarase  43.43 
 
 		 479 aa  387  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.284725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1260  fumarate lyase  42.67 
 
 		 453 aa  386  1e-106  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2008  aspartate ammonia-lyase  45.71 
 
 		 468 aa  385  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6217  aspartate ammonia-lyase  46.92 
 
 		 474 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.946627  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2009  aspartate ammonia-lyase  45.01 
 
 		 476 aa  388  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1643  aspartate ammonia-lyase  44.12 
 
 		 474 aa  385  1e-106  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  46.24 
 
 		 475 aa  386  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2177  aspartate ammonia-lyase  46.12 
 
 		 475 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2083  aspartate ammonia-lyase  45.9 
 
 		 475 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195347  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0193  aspartate ammonia-lyase  44.4 
 
 		 463 aa  382  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0526  aspartate ammonia-lyase  44.35 
 
 		 477 aa  382  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0181392  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  47.06 
 
 		 472 aa  384  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71650  aspartate ammonia-lyase  46.7 
 
 		 474 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0391  thiamine biosynthesis protein ThiC  43.24 
 
 		 466 aa  381  1e-104  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5639  aspartate ammonia-lyase  45.01 
 
 		 479 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.611375  normal  0.502562 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  47.45 
 
 		 467 aa  379  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5247  aspartate ammonia-lyase  45.59 
 
 		 478 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0371805  normal  0.169068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5387  aspartate ammonia-lyase  45.81 
 
 		 485 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  46.46 
 
 		 468 aa  379  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0523  aspartate ammonia-lyase  43.68 
 
 		 477 aa  376  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442808  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5338  aspartate ammonia-lyase  45.59 
 
 		 478 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486768 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0677  aspartate ammonia-lyase  43.68 
 
 		 477 aa  375  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0185443  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  46.24 
 
 		 469 aa  375  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1958  aspartate ammonia-lyase  47.54 
 
 		 483 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.175554  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5499  aspartate ammonia-lyase  45.47 
 
 		 474 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0576  aspartate ammonia-lyase  43.68 
 
 		 477 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0520  aspartate ammonia-lyase  43.68 
 
 		 477 aa  376  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270873  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  45.18 
 
 		 480 aa  378  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0520  aspartate ammonia-lyase  43.9 
 
 		 477 aa  378  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2167  aspartate ammonia-lyase  44.84 
 
 		 480 aa  376  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0665  aspartate ammonia-lyase  43.68 
 
 		 477 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0151100000000002e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0609  aspartate ammonia-lyase  43.68 
 
 		 477 aa  377  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0647  aspartate ammonia-lyase  43.46 
 
 		 477 aa  375  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00115494  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03150  aspartate ammonia-lyase  42.98 
 
 		 471 aa  378  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000322515  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1757  aspartate ammonia-lyase  45.9 
 
 		 482 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0736  aspartate ammonia-lyase  43.68 
 
 		 477 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0153519  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0140  aspartate ammonia-lyase  43.24 
 
 		 470 aa  378  1e-103  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2438  aspartate ammonia-lyase  44.49 
 
 		 466 aa  375  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.268607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1884  aspartate ammonia-lyase  47.54 
 
 		 483 aa  376  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218686  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  45.58 
 
 		 469 aa  377  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1152  fumarate lyase  45.08 
 
 		 481 aa  373  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00154  aspartate ammonia-lyase  45.13 
 
 		 483 aa  375  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1667  aspartate ammonia-lyase  45.58 
 
 		 479 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0778255  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1921  aspartate ammonia-lyase  45.58 
 
 		 479 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5051  aspartate ammonia-lyase  45.47 
 
 		 474 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5625  aspartate ammonia-lyase  45.98 
 
 		 478 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149238  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1800  aspartate ammonia-lyase  45.58 
 
 		 479 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0128  aspartate ammonia-lyase  46.1 
 
 		 474 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002214  aspartate ammonia-lyase  44.91 
 
 		 483 aa  373  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1811  aspartate ammonia-lyase  45.58 
 
 		 479 aa  375  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1665  aspartate ammonia-lyase  45.58 
 
 		 479 aa  375  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4691  aspartate ammonia-lyase  43.24 
 
 		 477 aa  375  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000148862  hitchhiker  1.50426e-18 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0135  aspartate ammonia-lyase  45.96 
 
 		 485 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2270  aspartate ammonia-lyase  44.32 
 
 		 483 aa  374  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.935521  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0092  fumarate lyase  44.59 
 
 		 472 aa  369  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1299  fumarate lyase  47.43 
 
 		 479 aa  369  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160462  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4956  aspartate ammonia-lyase  47.61 
 
 		 474 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.177777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2124  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  43.02 
 
 		 471 aa  371  1e-101  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000051294  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1116  putative aspartate ammonia-lyase  44.77 
 
 		 466 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3530  aspartate ammonia-lyase  45.13 
 
 		 479 aa  371  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3457  aspartate ammonia-lyase  47.23 
 
 		 468 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  46 
 
 		 459 aa  371  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3455  aspartate ammonia-lyase  47.69 
 
 		 470 aa  372  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025134  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3458  aspartate ammonia-lyase  46.56 
 
 		 468 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.882524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0827  fumarate lyase  45.92 
 
 		 483 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0725  aspartate ammonia-lyase  42.92 
 
 		 478 aa  365  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  46.29 
 
 		 468 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0565  aspartate ammonia-lyase  45.95 
 
 		 521 aa  368  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0355315 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3825  aspartate ammonia-lyase  43.14 
 
 		 478 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1555  aspartate ammonia-lyase (Aspartase)  43.58 
 
 		 469 aa  366  1e-100  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4302  aspartate ammonia-lyase  46.34 
 
 		 468 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  47.5 
 
 		 463 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0474  aspartate ammonia-lyase  43.69 
 
 		 461 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.180708  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1178  aspartate ammonia-lyase  43.96 
 
 		 485 aa  365  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000150136 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4064  aspartate ammonia-lyase  46.34 
 
 		 468 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3115  aspartate ammonia-lyase  44.99 
 
 		 476 aa  368  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3678  aspartate ammonia-lyase  43.14 
 
 		 478 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>