More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1299 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1299  fumarate lyase  100 
 
 		 479 aa  959    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160462  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0481  aspartate ammonia-lyase  67.26 
 
 		 474 aa  592  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5639  aspartate ammonia-lyase  66.24 
 
 		 479 aa  594  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.611375  normal  0.502562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2072  aspartate ammonia-lyase  67.69 
 
 		 471 aa  593  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0356  fumarate lyase  67.7 
 
 		 481 aa  588  1e-167  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6431  aspartate ammonia-lyase  67.4 
 
 		 471 aa  587  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5752  aspartate ammonia-lyase  67.99 
 
 		 475 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555308  normal  0.129771 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1791  aspartate ammonia-lyase  67.04 
 
 		 475 aa  578  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3530  fumarate lyase  66.81 
 
 		 540 aa  572  1.0000000000000001e-162  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.448364 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1746  fumarate lyase  61.61 
 
 		 469 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0082  aspartate ammonia-lyase  62.39 
 
 		 468 aa  568  1e-161  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0094  aspartate ammonia-lyase  62.17 
 
 		 468 aa  566  1e-160  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0122  aspartate ammonia-lyase  62.39 
 
 		 468 aa  567  1e-160  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0939  aspartate ammonia-lyase  65.86 
 
 		 468 aa  561  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3758  fumarate lyase  63.56 
 
 		 471 aa  556  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1643  aspartate ammonia-lyase  60.62 
 
 		 474 aa  554  1e-156  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3544  fumarate lyase  63.62 
 
 		 471 aa  550  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3458  aspartate ammonia-lyase  63.74 
 
 		 468 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.882524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24080  aspartate ammonia-lyase  61.81 
 
 		 505 aa  546  1e-154  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4302  aspartate ammonia-lyase  63.29 
 
 		 468 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3457  aspartate ammonia-lyase  64.06 
 
 		 468 aa  545  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3976  fumarate lyase  63.89 
 
 		 471 aa  546  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4064  aspartate ammonia-lyase  63.29 
 
 		 468 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0128  aspartate ammonia-lyase  62.45 
 
 		 474 aa  543  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2083  aspartate ammonia-lyase  60.66 
 
 		 475 aa  544  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195347  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2177  aspartate ammonia-lyase  60.79 
 
 		 475 aa  544  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3455  aspartate ammonia-lyase  60.88 
 
 		 470 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025134  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2438  aspartate ammonia-lyase  59.82 
 
 		 466 aa  540  9.999999999999999e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.268607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2008  aspartate ammonia-lyase  60.22 
 
 		 468 aa  538  9.999999999999999e-153  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2009  aspartate ammonia-lyase  59.12 
 
 		 476 aa  537  1e-151  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3964  aspartate ammonia-lyase  63.84 
 
 		 468 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256806 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5338  aspartate ammonia-lyase  61.47 
 
 		 478 aa  531  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486768 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5387  aspartate ammonia-lyase  61.69 
 
 		 485 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5499  aspartate ammonia-lyase  61.79 
 
 		 474 aa  534  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5625  aspartate ammonia-lyase  61.47 
 
 		 478 aa  533  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149238  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1984  aspartate ammonia-lyase  63.51 
 
 		 468 aa  532  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1757  aspartate ammonia-lyase  61.15 
 
 		 482 aa  531  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5051  aspartate ammonia-lyase  61.57 
 
 		 474 aa  531  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1152  fumarate lyase  61.06 
 
 		 481 aa  530  1e-149  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5247  aspartate ammonia-lyase  61.26 
 
 		 478 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0371805  normal  0.169068 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71650  aspartate ammonia-lyase  62.69 
 
 		 474 aa  529  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0135  aspartate ammonia-lyase  61.26 
 
 		 485 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0827  fumarate lyase  59.73 
 
 		 483 aa  527  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6217  aspartate ammonia-lyase  62.47 
 
 		 474 aa  528  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.946627  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3403  aspartate ammonia-lyase  57.3 
 
 		 469 aa  514  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00437169  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3958  fumarate lyase  58.51 
 
 		 571 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4326  fumarate lyase  58.94 
 
 		 568 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705927  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1905  fumarate lyase  57.62 
 
 		 475 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2167  aspartate ammonia-lyase  57.89 
 
 		 480 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4435  fumarate lyase  58.3 
 
 		 560 aa  514  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0461  fumarate lyase  58.64 
 
 		 507 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0193  aspartate ammonia-lyase  56.48 
 
 		 463 aa  506  9.999999999999999e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1884  aspartate ammonia-lyase  57.48 
 
 		 483 aa  502  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218686  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2052  aspartate ammonia-lyase  55.24 
 
 		 485 aa  502  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0909745  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1958  aspartate ammonia-lyase  57.48 
 
 		 483 aa  502  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.175554  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0565  aspartate ammonia-lyase  57.17 
 
 		 521 aa  499  1e-140  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0355315 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1365  fumarate lyase  57.52 
 
 		 484 aa  499  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000934378  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0789  aspartate ammonia-lyase  59.04 
 
 		 472 aa  500  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1293  aspartate ammonia-lyase  58.33 
 
 		 468 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0277144  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3846  aspartate ammonia-lyase  54.85 
 
 		 467 aa  490  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1417  aspartate ammonia-lyase  53.76 
 
 		 470 aa  490  1e-137  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.442168 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1993  aspartate ammonia-lyase  53.2 
 
 		 463 aa  485  1e-136  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0391  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.42 
 
 		 466 aa  484  1e-135  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1178  aspartate ammonia-lyase  54.73 
 
 		 485 aa  478  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000150136 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1663  aspartate ammonia-lyase  57.17 
 
 		 474 aa  479  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.201173  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1545  aspartate ammonia-lyase  52.75 
 
 		 470 aa  481  1e-134  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000011141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0589  aspartate ammonia-lyase  54.3 
 
 		 467 aa  481  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00154  aspartate ammonia-lyase  54.49 
 
 		 483 aa  475  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0725  aspartate ammonia-lyase  53.74 
 
 		 478 aa  475  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3825  aspartate ammonia-lyase  53.74 
 
 		 478 aa  475  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2652  aspartate ammonia-lyase  56.7 
 
 		 467 aa  478  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531608  normal  0.0454862 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3678  aspartate ammonia-lyase  53.74 
 
 		 478 aa  475  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4355  aspartate ammonia-lyase  54.19 
 
 		 474 aa  473  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000233495  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002214  aspartate ammonia-lyase  54.7 
 
 		 483 aa  474  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1091  aspartate ammonia-lyase  53.7 
 
 		 485 aa  473  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.0187146 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1395  fumarate lyase  54.29 
 
 		 478 aa  474  1e-132  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2270  aspartate ammonia-lyase  53.42 
 
 		 483 aa  474  1e-132  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.935521  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1741  aspartate ammonia-lyase  52.32 
 
 		 475 aa  469  1.0000000000000001e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1555  aspartate ammonia-lyase (Aspartase)  52.32 
 
 		 469 aa  469  1.0000000000000001e-131  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0406  aspartate ammonia-lyase  53.96 
 
 		 478 aa  469  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04009  aspartate ammonia-lyase  55.73 
 
 		 478 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3853  aspartate ammonia-lyase  55.73 
 
 		 478 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5655  aspartate ammonia-lyase  55.73 
 
 		 478 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0582808  normal  0.320226 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0677  aspartate ammonia-lyase  51.87 
 
 		 477 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0185443  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4380  aspartate ammonia-lyase  55.73 
 
 		 478 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03971  hypothetical protein  55.73 
 
 		 478 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4604  aspartate ammonia-lyase  55.29 
 
 		 478 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4722  aspartate ammonia-lyase  55.29 
 
 		 478 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4608  aspartate ammonia-lyase  55.73 
 
 		 478 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.21143  normal  0.755736 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4668  aspartate ammonia-lyase  55.73 
 
 		 478 aa  466  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4687  aspartate ammonia-lyase  55.29 
 
 		 478 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1273  aspartate ammonia-lyase  53.45 
 
 		 476 aa  467  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000429353 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4694  aspartate ammonia-lyase  55.73 
 
 		 478 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0526  aspartate ammonia-lyase  51.65 
 
 		 477 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0181392  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4596  aspartate ammonia-lyase  55.29 
 
 		 478 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4744  aspartate ammonia-lyase  55.29 
 
 		 478 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.825089  normal  0.538431 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3873  aspartate ammonia-lyase  55.73 
 
 		 478 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0647  aspartate ammonia-lyase  51.43 
 
 		 477 aa  461  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00115494  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0665  aspartate ammonia-lyase  51.65 
 
 		 477 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0151100000000002e-47 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0520  aspartate ammonia-lyase  51.65 
 
 		 477 aa  464  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>