More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1741 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1741  aspartate ammonia-lyase  100 
 
 		 475 aa  989    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0193  aspartate ammonia-lyase  60.18 
 
 		 463 aa  558  1e-158  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1993  aspartate ammonia-lyase  54.55 
 
 		 463 aa  525  1e-148  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0082  aspartate ammonia-lyase  55.43 
 
 		 468 aa  525  1e-148  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24080  aspartate ammonia-lyase  55.22 
 
 		 505 aa  525  1e-148  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2083  aspartate ammonia-lyase  55.56 
 
 		 475 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195347  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0094  aspartate ammonia-lyase  55.43 
 
 		 468 aa  525  1e-148  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2177  aspartate ammonia-lyase  55.56 
 
 		 475 aa  527  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0128  aspartate ammonia-lyase  55.25 
 
 		 474 aa  523  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0122  aspartate ammonia-lyase  55.43 
 
 		 468 aa  524  1e-147  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1395  fumarate lyase  54.11 
 
 		 478 aa  518  1e-146  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5499  aspartate ammonia-lyase  55.03 
 
 		 474 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1757  aspartate ammonia-lyase  55.27 
 
 		 482 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5051  aspartate ammonia-lyase  54.82 
 
 		 474 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5338  aspartate ammonia-lyase  53.28 
 
 		 478 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486768 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5247  aspartate ammonia-lyase  53.28 
 
 		 478 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0371805  normal  0.169068 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2009  aspartate ammonia-lyase  54.01 
 
 		 476 aa  509  1e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5387  aspartate ammonia-lyase  53.28 
 
 		 485 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0135  aspartate ammonia-lyase  53.28 
 
 		 485 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5625  aspartate ammonia-lyase  53.7 
 
 		 478 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149238  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2008  aspartate ammonia-lyase  54.18 
 
 		 468 aa  506  9.999999999999999e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6217  aspartate ammonia-lyase  54.55 
 
 		 474 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.946627  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71650  aspartate ammonia-lyase  54.33 
 
 		 474 aa  501  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1791  aspartate ammonia-lyase  54.09 
 
 		 475 aa  500  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2438  aspartate ammonia-lyase  53.59 
 
 		 466 aa  500  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.268607  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2052  aspartate ammonia-lyase  52.07 
 
 		 485 aa  497  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0909745  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1643  aspartate ammonia-lyase  53.26 
 
 		 474 aa  496  1e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1545  aspartate ammonia-lyase  52.6 
 
 		 470 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000011141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5752  aspartate ammonia-lyase  54.23 
 
 		 475 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555308  normal  0.129771 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1178  aspartate ammonia-lyase  52.47 
 
 		 485 aa  488  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000150136 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3678  aspartate ammonia-lyase  51.83 
 
 		 478 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3825  aspartate ammonia-lyase  51.83 
 
 		 478 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2167  aspartate ammonia-lyase  51.42 
 
 		 480 aa  488  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1091  aspartate ammonia-lyase  53.22 
 
 		 485 aa  486  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.0187146 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002214  aspartate ammonia-lyase  52.71 
 
 		 483 aa  485  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1905  fumarate lyase  49.57 
 
 		 475 aa  483  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0725  aspartate ammonia-lyase  51.83 
 
 		 478 aa  484  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00154  aspartate ammonia-lyase  52.05 
 
 		 483 aa  482  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2806  aspartate ammonia-lyase  51.9 
 
 		 482 aa  483  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1417  aspartate ammonia-lyase  49.68 
 
 		 470 aa  483  1e-135  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.442168 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0406  aspartate ammonia-lyase  51.4 
 
 		 478 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2072  aspartate ammonia-lyase  52.37 
 
 		 471 aa  480  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2270  aspartate ammonia-lyase  51.18 
 
 		 483 aa  479  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.935521  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0939  aspartate ammonia-lyase  55.75 
 
 		 468 aa  479  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3403  aspartate ammonia-lyase  51.84 
 
 		 469 aa  475  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00437169  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0789  aspartate ammonia-lyase  52.05 
 
 		 472 aa  475  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0466  aspartate ammonia-lyase  52.28 
 
 		 471 aa  474  1e-132  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000107475  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04009  aspartate ammonia-lyase  51.61 
 
 		 478 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3853  aspartate ammonia-lyase  51.61 
 
 		 478 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3758  fumarate lyase  52.18 
 
 		 471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3873  aspartate ammonia-lyase  51.61 
 
 		 478 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4596  aspartate ammonia-lyase  51.61 
 
 		 478 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0576  aspartate ammonia-lyase  49.46 
 
 		 477 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4380  aspartate ammonia-lyase  51.61 
 
 		 478 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03971  hypothetical protein  51.61 
 
 		 478 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0520  aspartate ammonia-lyase  49.13 
 
 		 477 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0665  aspartate ammonia-lyase  49.13 
 
 		 477 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0151100000000002e-47 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0640  aspartate ammonia-lyase  50.54 
 
 		 479 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0520  aspartate ammonia-lyase  49.35 
 
 		 477 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4691  aspartate ammonia-lyase  48.92 
 
 		 477 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000148862  hitchhiker  1.50426e-18 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0481  aspartate ammonia-lyase  51.63 
 
 		 474 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4722  aspartate ammonia-lyase  51.61 
 
 		 478 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5655  aspartate ammonia-lyase  51.61 
 
 		 478 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0582808  normal  0.320226 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4608  aspartate ammonia-lyase  51.61 
 
 		 478 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.21143  normal  0.755736 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4687  aspartate ammonia-lyase  51.61 
 
 		 478 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4668  aspartate ammonia-lyase  51.61 
 
 		 478 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0609  aspartate ammonia-lyase  49.46 
 
 		 477 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4694  aspartate ammonia-lyase  51.61 
 
 		 478 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0736  aspartate ammonia-lyase  49.13 
 
 		 477 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0153519  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4744  aspartate ammonia-lyase  51.61 
 
 		 478 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.825089  normal  0.538431 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3458  aspartate ammonia-lyase  52.05 
 
 		 468 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.882524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0645  aspartate ammonia-lyase  50.54 
 
 		 479 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6431  aspartate ammonia-lyase  52.05 
 
 		 471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4604  aspartate ammonia-lyase  51.61 
 
 		 478 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0618  aspartate ammonia-lyase  50.54 
 
 		 479 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3747  aspartate ammonia-lyase  50.32 
 
 		 479 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0677  aspartate ammonia-lyase  48.92 
 
 		 477 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0185443  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0526  aspartate ammonia-lyase  49.25 
 
 		 477 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0181392  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0647  aspartate ammonia-lyase  48.92 
 
 		 477 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00115494  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2667  fumarase  47.53 
 
 		 479 aa  465  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.284725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0140  aspartate ammonia-lyase  50.87 
 
 		 470 aa  465  9.999999999999999e-131  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3455  aspartate ammonia-lyase  51.2 
 
 		 470 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025134  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4302  aspartate ammonia-lyase  51.84 
 
 		 468 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0682  aspartate ammonia-lyase  49.89 
 
 		 480 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1299  fumarate lyase  52.46 
 
 		 479 aa  466  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160462  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4064  aspartate ammonia-lyase  51.84 
 
 		 468 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5639  aspartate ammonia-lyase  50.33 
 
 		 479 aa  464  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.611375  normal  0.502562 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4435  fumarate lyase  49.25 
 
 		 560 aa  463  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0391  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.7 
 
 		 466 aa  462  1e-129  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0506  aspartate ammonia-lyase  51.4 
 
 		 479 aa  463  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0523  aspartate ammonia-lyase  48.27 
 
 		 477 aa  463  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442808  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0593  aspartate ammonia-lyase  50.22 
 
 		 472 aa  462  1e-129  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4326  fumarate lyase  49.03 
 
 		 568 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705927  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0326  aspartate ammonia-lyase  51.09 
 
 		 478 aa  458  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000442883 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2652  aspartate ammonia-lyase  50.97 
 
 		 467 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531608  normal  0.0454862 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3544  fumarate lyase  51.2 
 
 		 471 aa  460  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0725  aspartate ammonia-lyase  50.97 
 
 		 479 aa  458  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.883409  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3958  fumarate lyase  49.03 
 
 		 571 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1293  aspartate ammonia-lyase  50.54 
 
 		 468 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0277144  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0565  aspartate ammonia-lyase  49.46 
 
 		 521 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0355315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>