More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1293 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0565  aspartate ammonia-lyase  76.82 
 
 		 521 aa  726    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0355315 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1663  aspartate ammonia-lyase  74.36 
 
 		 474 aa  707    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.201173  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3455  aspartate ammonia-lyase  66.52 
 
 		 470 aa  640    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025134  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1293  aspartate ammonia-lyase  100 
 
 		 468 aa  947    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0277144  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2167  aspartate ammonia-lyase  63.38 
 
 		 480 aa  619  1e-176  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2438  aspartate ammonia-lyase  59.35 
 
 		 466 aa  573  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.268607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2177  aspartate ammonia-lyase  61.72 
 
 		 475 aa  568  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2083  aspartate ammonia-lyase  61.72 
 
 		 475 aa  569  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195347  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1643  aspartate ammonia-lyase  59.61 
 
 		 474 aa  570  1e-161  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0082  aspartate ammonia-lyase  58.32 
 
 		 468 aa  563  1.0000000000000001e-159  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0122  aspartate ammonia-lyase  58.32 
 
 		 468 aa  561  1.0000000000000001e-159  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0094  aspartate ammonia-lyase  58.32 
 
 		 468 aa  561  1.0000000000000001e-159  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1757  aspartate ammonia-lyase  62.34 
 
 		 482 aa  558  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2052  aspartate ammonia-lyase  58.7 
 
 		 485 aa  557  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0909745  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1791  aspartate ammonia-lyase  61.3 
 
 		 475 aa  549  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2009  aspartate ammonia-lyase  59.05 
 
 		 476 aa  547  1e-154  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6217  aspartate ammonia-lyase  59.65 
 
 		 474 aa  545  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.946627  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24080  aspartate ammonia-lyase  57.83 
 
 		 505 aa  545  1e-154  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71650  aspartate ammonia-lyase  59.87 
 
 		 474 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0193  aspartate ammonia-lyase  57.95 
 
 		 463 aa  542  1e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5338  aspartate ammonia-lyase  58.44 
 
 		 478 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486768 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2008  aspartate ammonia-lyase  57.91 
 
 		 468 aa  540  9.999999999999999e-153  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5639  aspartate ammonia-lyase  57.85 
 
 		 479 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.611375  normal  0.502562 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5051  aspartate ammonia-lyase  58.57 
 
 		 474 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5247  aspartate ammonia-lyase  58.44 
 
 		 478 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0371805  normal  0.169068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6431  aspartate ammonia-lyase  60.65 
 
 		 471 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5499  aspartate ammonia-lyase  58.35 
 
 		 474 aa  538  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5387  aspartate ammonia-lyase  58.23 
 
 		 485 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0481  aspartate ammonia-lyase  60.3 
 
 		 474 aa  536  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5625  aspartate ammonia-lyase  58.41 
 
 		 478 aa  536  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149238  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1905  fumarate lyase  55.79 
 
 		 475 aa  535  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0135  aspartate ammonia-lyase  58.23 
 
 		 485 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3758  fumarate lyase  59.08 
 
 		 471 aa  534  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3544  fumarate lyase  59.65 
 
 		 471 aa  531  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3976  fumarate lyase  59.52 
 
 		 471 aa  533  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0128  aspartate ammonia-lyase  57.88 
 
 		 474 aa  530  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1152  fumarate lyase  56.96 
 
 		 481 aa  530  1e-149  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3458  aspartate ammonia-lyase  58.35 
 
 		 468 aa  525  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.882524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4302  aspartate ammonia-lyase  58.13 
 
 		 468 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3403  aspartate ammonia-lyase  55.48 
 
 		 469 aa  522  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00437169  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4064  aspartate ammonia-lyase  58.13 
 
 		 468 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0939  aspartate ammonia-lyase  60.65 
 
 		 468 aa  522  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1746  fumarate lyase  56.86 
 
 		 469 aa  520  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0356  fumarate lyase  59.03 
 
 		 481 aa  520  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2072  aspartate ammonia-lyase  58.66 
 
 		 471 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002214  aspartate ammonia-lyase  54.72 
 
 		 483 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1993  aspartate ammonia-lyase  54.76 
 
 		 463 aa  511  1e-144  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0461  fumarate lyase  57.51 
 
 		 507 aa  511  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2652  aspartate ammonia-lyase  57.85 
 
 		 467 aa  514  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531608  normal  0.0454862 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3846  aspartate ammonia-lyase  54.96 
 
 		 467 aa  514  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00154  aspartate ammonia-lyase  54.29 
 
 		 483 aa  513  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1091  aspartate ammonia-lyase  54.72 
 
 		 485 aa  508  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.0187146 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2806  aspartate ammonia-lyase  54.29 
 
 		 482 aa  509  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3457  aspartate ammonia-lyase  58.57 
 
 		 468 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5752  aspartate ammonia-lyase  57.48 
 
 		 475 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555308  normal  0.129771 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1178  aspartate ammonia-lyase  54.27 
 
 		 485 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000150136 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0593  aspartate ammonia-lyase  52.79 
 
 		 472 aa  506  9.999999999999999e-143  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0589  aspartate ammonia-lyase  53.45 
 
 		 467 aa  506  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0827  fumarate lyase  56.83 
 
 		 483 aa  502  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0640  aspartate ammonia-lyase  53.43 
 
 		 479 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1958  aspartate ammonia-lyase  56.56 
 
 		 483 aa  502  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.175554  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4355  aspartate ammonia-lyase  56.64 
 
 		 474 aa  504  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000233495  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1299  fumarate lyase  58.54 
 
 		 479 aa  504  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160462  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3747  aspartate ammonia-lyase  53.22 
 
 		 479 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1984  aspartate ammonia-lyase  58.35 
 
 		 468 aa  504  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1884  aspartate ammonia-lyase  56.56 
 
 		 483 aa  501  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218686  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0618  aspartate ammonia-lyase  53.43 
 
 		 479 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2270  aspartate ammonia-lyase  53.22 
 
 		 483 aa  503  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.935521  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0682  aspartate ammonia-lyase  53.43 
 
 		 480 aa  501  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0645  aspartate ammonia-lyase  53.43 
 
 		 479 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0406  aspartate ammonia-lyase  53 
 
 		 478 aa  498  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3964  aspartate ammonia-lyase  58.57 
 
 		 468 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256806 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03150  aspartate ammonia-lyase  53.46 
 
 		 471 aa  497  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000322515  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0520  aspartate ammonia-lyase  54.25 
 
 		 477 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0736  aspartate ammonia-lyase  54.03 
 
 		 477 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0153519  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4435  fumarate lyase  56.3 
 
 		 560 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0677  aspartate ammonia-lyase  54.03 
 
 		 477 aa  490  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0185443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0576  aspartate ammonia-lyase  54.03 
 
 		 477 aa  491  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0520  aspartate ammonia-lyase  54.03 
 
 		 477 aa  491  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270873  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1395  fumarate lyase  53.06 
 
 		 478 aa  491  1e-137  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0609  aspartate ammonia-lyase  54.03 
 
 		 477 aa  491  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0466  aspartate ammonia-lyase  54.21 
 
 		 471 aa  488  1e-137  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000107475  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0789  aspartate ammonia-lyase  55.41 
 
 		 472 aa  491  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0665  aspartate ammonia-lyase  54.03 
 
 		 477 aa  491  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0151100000000002e-47 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3958  fumarate lyase  55 
 
 		 571 aa  485  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4691  aspartate ammonia-lyase  53.38 
 
 		 477 aa  487  1e-136  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000148862  hitchhiker  1.50426e-18 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3678  aspartate ammonia-lyase  52.15 
 
 		 478 aa  487  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1365  fumarate lyase  56.98 
 
 		 484 aa  486  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000934378  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0647  aspartate ammonia-lyase  53.16 
 
 		 477 aa  485  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00115494  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0523  aspartate ammonia-lyase  53.38 
 
 		 477 aa  485  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442808  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3825  aspartate ammonia-lyase  52.15 
 
 		 478 aa  487  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3530  fumarate lyase  55.65 
 
 		 540 aa  482  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.448364 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4326  fumarate lyase  55 
 
 		 568 aa  483  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705927  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0526  aspartate ammonia-lyase  53.59 
 
 		 477 aa  483  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0181392  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0725  aspartate ammonia-lyase  51.93 
 
 		 478 aa  484  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4956  aspartate ammonia-lyase  54.21 
 
 		 474 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.177777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2667  fumarase  50.54 
 
 		 479 aa  481  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.284725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1116  putative aspartate ammonia-lyase  52.06 
 
 		 466 aa  476  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3853  aspartate ammonia-lyase  53 
 
 		 478 aa  473  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4668  aspartate ammonia-lyase  53 
 
 		 478 aa  473  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>