More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_24080 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_24080  aspartate ammonia-lyase  100 
 
 		 505 aa  1029    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2052  aspartate ammonia-lyase  60.47 
 
 		 485 aa  598  1e-170  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0909745  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0128  aspartate ammonia-lyase  61.31 
 
 		 474 aa  591  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0135  aspartate ammonia-lyase  61.78 
 
 		 485 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5499  aspartate ammonia-lyase  61.78 
 
 		 474 aa  590  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5051  aspartate ammonia-lyase  61.78 
 
 		 474 aa  588  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6217  aspartate ammonia-lyase  62.23 
 
 		 474 aa  589  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.946627  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71650  aspartate ammonia-lyase  62.02 
 
 		 474 aa  588  1e-167  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5338  aspartate ammonia-lyase  61.59 
 
 		 478 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486768 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5625  aspartate ammonia-lyase  61.57 
 
 		 478 aa  587  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149238  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5247  aspartate ammonia-lyase  61.59 
 
 		 478 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0371805  normal  0.169068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5387  aspartate ammonia-lyase  61.59 
 
 		 485 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2167  aspartate ammonia-lyase  61.09 
 
 		 480 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3958  fumarate lyase  61.06 
 
 		 571 aa  578  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4326  fumarate lyase  61.06 
 
 		 568 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705927  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4435  fumarate lyase  60.55 
 
 		 560 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3758  fumarate lyase  64.24 
 
 		 471 aa  571  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0481  aspartate ammonia-lyase  62.37 
 
 		 474 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0082  aspartate ammonia-lyase  58.35 
 
 		 468 aa  571  1e-161  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0122  aspartate ammonia-lyase  58.35 
 
 		 468 aa  569  1e-161  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2438  aspartate ammonia-lyase  59.57 
 
 		 466 aa  570  1e-161  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.268607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0094  aspartate ammonia-lyase  58.35 
 
 		 468 aa  569  1e-161  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1905  fumarate lyase  57.42 
 
 		 475 aa  570  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3455  aspartate ammonia-lyase  61.09 
 
 		 470 aa  567  1e-160  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025134  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2072  aspartate ammonia-lyase  62.99 
 
 		 471 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1746  fumarate lyase  59.83 
 
 		 469 aa  564  1.0000000000000001e-159  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1643  aspartate ammonia-lyase  58.19 
 
 		 474 aa  564  1.0000000000000001e-159  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0939  aspartate ammonia-lyase  65.08 
 
 		 468 aa  561  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1791  aspartate ammonia-lyase  61.42 
 
 		 475 aa  560  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3544  fumarate lyase  63.36 
 
 		 471 aa  561  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3976  fumarate lyase  63.8 
 
 		 471 aa  560  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5639  aspartate ammonia-lyase  61 
 
 		 479 aa  556  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.611375  normal  0.502562 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0193  aspartate ammonia-lyase  58.77 
 
 		 463 aa  555  1e-157  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6431  aspartate ammonia-lyase  62.69 
 
 		 471 aa  556  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1993  aspartate ammonia-lyase  57.05 
 
 		 463 aa  553  1e-156  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2177  aspartate ammonia-lyase  58.84 
 
 		 475 aa  551  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5752  aspartate ammonia-lyase  62.13 
 
 		 475 aa  554  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555308  normal  0.129771 
 
 
-
 
NC_004310  BR1958  aspartate ammonia-lyase  58.32 
 
 		 483 aa  550  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.175554  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0461  fumarate lyase  60.69 
 
 		 507 aa  549  1e-155  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1884  aspartate ammonia-lyase  58.32 
 
 		 483 aa  550  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218686  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2083  aspartate ammonia-lyase  58.62 
 
 		 475 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195347  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2009  aspartate ammonia-lyase  57.61 
 
 		 476 aa  546  1e-154  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2008  aspartate ammonia-lyase  58.26 
 
 		 468 aa  542  1e-153  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0356  fumarate lyase  61.42 
 
 		 481 aa  543  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1299  fumarate lyase  61.92 
 
 		 479 aa  543  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160462  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1152  fumarate lyase  57.56 
 
 		 481 aa  541  9.999999999999999e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1663  aspartate ammonia-lyase  57.92 
 
 		 474 aa  535  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.201173  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3846  aspartate ammonia-lyase  55.1 
 
 		 467 aa  535  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1395  fumarate lyase  56.25 
 
 		 478 aa  537  1e-151  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0827  fumarate lyase  55.65 
 
 		 483 aa  532  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3458  aspartate ammonia-lyase  59.26 
 
 		 468 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.882524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3403  aspartate ammonia-lyase  56.01 
 
 		 469 aa  532  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00437169  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1757  aspartate ammonia-lyase  58.57 
 
 		 482 aa  529  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3530  fumarate lyase  56.43 
 
 		 540 aa  530  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.448364 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4302  aspartate ammonia-lyase  59.26 
 
 		 468 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4064  aspartate ammonia-lyase  59.26 
 
 		 468 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0789  aspartate ammonia-lyase  58.41 
 
 		 472 aa  528  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1741  aspartate ammonia-lyase  55.22 
 
 		 475 aa  525  1e-148  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2652  aspartate ammonia-lyase  56.99 
 
 		 467 aa  526  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531608  normal  0.0454862 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1293  aspartate ammonia-lyase  57.83 
 
 		 468 aa  526  1e-148  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0277144  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0565  aspartate ammonia-lyase  56.52 
 
 		 521 aa  522  1e-147  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0355315 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1984  aspartate ammonia-lyase  59.57 
 
 		 468 aa  520  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3457  aspartate ammonia-lyase  59.78 
 
 		 468 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4956  aspartate ammonia-lyase  56.71 
 
 		 474 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.177777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3964  aspartate ammonia-lyase  60 
 
 		 468 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256806 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1417  aspartate ammonia-lyase  54.21 
 
 		 470 aa  515  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.442168 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0589  aspartate ammonia-lyase  54.13 
 
 		 467 aa  515  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1545  aspartate ammonia-lyase  53.78 
 
 		 470 aa  511  1e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000011141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03150  aspartate ammonia-lyase  52.39 
 
 		 471 aa  505  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000322515  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00154  aspartate ammonia-lyase  54.16 
 
 		 483 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2806  aspartate ammonia-lyase  54.18 
 
 		 482 aa  503  1e-141  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2270  aspartate ammonia-lyase  52.77 
 
 		 483 aa  501  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.935521  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002214  aspartate ammonia-lyase  53.94 
 
 		 483 aa  498  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_13405  predicted protein  53.21 
 
 		 466 aa  496  1e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.457596 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1178  aspartate ammonia-lyase  52.38 
 
 		 485 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000150136 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0406  aspartate ammonia-lyase  53.26 
 
 		 478 aa  490  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4355  aspartate ammonia-lyase  51.85 
 
 		 474 aa  491  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000233495  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1365  fumarate lyase  52.62 
 
 		 484 aa  486  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000934378  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1116  putative aspartate ammonia-lyase  51.63 
 
 		 466 aa  488  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0466  aspartate ammonia-lyase  55.1 
 
 		 471 aa  488  1e-136  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000107475  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2667  fumarase  49.57 
 
 		 479 aa  485  1e-136  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.284725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0140  aspartate ammonia-lyase  50.11 
 
 		 470 aa  482  1e-135  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1665  aspartate ammonia-lyase  50.22 
 
 		 479 aa  483  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1091  aspartate ammonia-lyase  52.49 
 
 		 485 aa  483  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.0187146 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3825  aspartate ammonia-lyase  52.83 
 
 		 478 aa  484  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3678  aspartate ammonia-lyase  52.83 
 
 		 478 aa  484  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3115  aspartate ammonia-lyase  49.35 
 
 		 476 aa  479  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2124  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  50 
 
 		 471 aa  481  1e-134  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000051294  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0593  aspartate ammonia-lyase  51.3 
 
 		 472 aa  480  1e-134  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0391  thiamine biosynthesis protein ThiC  48.7 
 
 		 466 aa  481  1e-134  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0682  aspartate ammonia-lyase  51.51 
 
 		 480 aa  479  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0725  aspartate ammonia-lyase  52.61 
 
 		 478 aa  481  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3853  aspartate ammonia-lyase  54.35 
 
 		 478 aa  476  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3873  aspartate ammonia-lyase  54.35 
 
 		 478 aa  476  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1921  aspartate ammonia-lyase  49.78 
 
 		 479 aa  478  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03971  hypothetical protein  54.35 
 
 		 478 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1800  aspartate ammonia-lyase  49.78 
 
 		 479 aa  478  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1811  aspartate ammonia-lyase  49.78 
 
 		 479 aa  477  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4380  aspartate ammonia-lyase  54.35 
 
 		 478 aa  476  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4691  aspartate ammonia-lyase  49.24 
 
 		 477 aa  476  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000148862  hitchhiker  1.50426e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>