More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6431 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3758  fumarate lyase  70.18 
 
 		 471 aa  644    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2072  aspartate ammonia-lyase  87.79 
 
 		 471 aa  813    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6431  aspartate ammonia-lyase  100 
 
 		 471 aa  952    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0481  aspartate ammonia-lyase  75.97 
 
 		 474 aa  696    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1791  aspartate ammonia-lyase  77.2 
 
 		 475 aa  707    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5639  aspartate ammonia-lyase  70.94 
 
 		 479 aa  663    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.611375  normal  0.502562 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3544  fumarate lyase  69.05 
 
 		 471 aa  641    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3976  fumarate lyase  69.41 
 
 		 471 aa  640    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5752  aspartate ammonia-lyase  78.97 
 
 		 475 aa  735    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555308  normal  0.129771 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0939  aspartate ammonia-lyase  76.36 
 
 		 468 aa  681    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3458  aspartate ammonia-lyase  70.02 
 
 		 468 aa  631  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.882524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4302  aspartate ammonia-lyase  69.81 
 
 		 468 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4064  aspartate ammonia-lyase  69.81 
 
 		 468 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0827  fumarate lyase  66.74 
 
 		 483 aa  616  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1746  fumarate lyase  66.38 
 
 		 469 aa  617  1e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3457  aspartate ammonia-lyase  69.63 
 
 		 468 aa  611  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1984  aspartate ammonia-lyase  68.88 
 
 		 468 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3530  fumarate lyase  69.37 
 
 		 540 aa  607  9.999999999999999e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.448364 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1152  fumarate lyase  65.24 
 
 		 481 aa  602  1.0000000000000001e-171  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3964  aspartate ammonia-lyase  69.85 
 
 		 468 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256806 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1299  fumarate lyase  67.55 
 
 		 479 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160462  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2438  aspartate ammonia-lyase  63.48 
 
 		 466 aa  594  1e-169  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.268607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1643  aspartate ammonia-lyase  62.26 
 
 		 474 aa  593  1e-168  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2009  aspartate ammonia-lyase  62.55 
 
 		 476 aa  586  1e-166  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0082  aspartate ammonia-lyase  60.74 
 
 		 468 aa  585  1e-166  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3455  aspartate ammonia-lyase  64.57 
 
 		 470 aa  587  1e-166  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025134  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0356  fumarate lyase  67.17 
 
 		 481 aa  586  1e-166  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0122  aspartate ammonia-lyase  60.74 
 
 		 468 aa  584  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0094  aspartate ammonia-lyase  60.52 
 
 		 468 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2008  aspartate ammonia-lyase  62.12 
 
 		 468 aa  579  1e-164  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2177  aspartate ammonia-lyase  63.34 
 
 		 475 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2083  aspartate ammonia-lyase  63.34 
 
 		 475 aa  581  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195347  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24080  aspartate ammonia-lyase  62.69 
 
 		 505 aa  574  1.0000000000000001e-162  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1757  aspartate ammonia-lyase  63.12 
 
 		 482 aa  568  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2167  aspartate ammonia-lyase  61.3 
 
 		 480 aa  567  1e-160  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5499  aspartate ammonia-lyase  61.54 
 
 		 474 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5051  aspartate ammonia-lyase  61.54 
 
 		 474 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1905  fumarate lyase  59.22 
 
 		 475 aa  553  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5338  aspartate ammonia-lyase  61.16 
 
 		 478 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486768 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5625  aspartate ammonia-lyase  60.94 
 
 		 478 aa  547  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149238  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5387  aspartate ammonia-lyase  61.16 
 
 		 485 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0135  aspartate ammonia-lyase  61.16 
 
 		 485 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5247  aspartate ammonia-lyase  61.16 
 
 		 478 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0371805  normal  0.169068 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6217  aspartate ammonia-lyase  60.99 
 
 		 474 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.946627  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2052  aspartate ammonia-lyase  57.63 
 
 		 485 aa  543  1e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0909745  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0193  aspartate ammonia-lyase  58.99 
 
 		 463 aa  542  1e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0128  aspartate ammonia-lyase  60.73 
 
 		 474 aa  542  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71650  aspartate ammonia-lyase  60.78 
 
 		 474 aa  541  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0565  aspartate ammonia-lyase  59.57 
 
 		 521 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0355315 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1365  fumarate lyase  59.48 
 
 		 484 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000934378  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1293  aspartate ammonia-lyase  60.65 
 
 		 468 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0277144  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4435  fumarate lyase  59.66 
 
 		 560 aa  532  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4326  fumarate lyase  59.23 
 
 		 568 aa  529  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705927  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3958  fumarate lyase  58.8 
 
 		 571 aa  530  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1178  aspartate ammonia-lyase  56.49 
 
 		 485 aa  528  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000150136 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2270  aspartate ammonia-lyase  57.14 
 
 		 483 aa  525  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.935521  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00154  aspartate ammonia-lyase  57.27 
 
 		 483 aa  526  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002214  aspartate ammonia-lyase  56.83 
 
 		 483 aa  524  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1993  aspartate ammonia-lyase  56.09 
 
 		 463 aa  518  1e-146  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3403  aspartate ammonia-lyase  55.84 
 
 		 469 aa  520  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00437169  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0406  aspartate ammonia-lyase  55.43 
 
 		 478 aa  519  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3846  aspartate ammonia-lyase  53.78 
 
 		 467 aa  519  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2806  aspartate ammonia-lyase  56.01 
 
 		 482 aa  521  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1091  aspartate ammonia-lyase  55.41 
 
 		 485 aa  514  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.0187146 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0789  aspartate ammonia-lyase  59.78 
 
 		 472 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2652  aspartate ammonia-lyase  56.9 
 
 		 467 aa  511  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531608  normal  0.0454862 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0725  aspartate ammonia-lyase  55 
 
 		 478 aa  510  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0461  fumarate lyase  58.89 
 
 		 507 aa  511  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3678  aspartate ammonia-lyase  55 
 
 		 478 aa  510  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1417  aspartate ammonia-lyase  53.76 
 
 		 470 aa  509  1e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.442168 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3825  aspartate ammonia-lyase  55 
 
 		 478 aa  510  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04009  aspartate ammonia-lyase  56.52 
 
 		 478 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3853  aspartate ammonia-lyase  56.52 
 
 		 478 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4668  aspartate ammonia-lyase  56.52 
 
 		 478 aa  507  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4380  aspartate ammonia-lyase  56.52 
 
 		 478 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1665  aspartate ammonia-lyase  53.43 
 
 		 479 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03971  hypothetical protein  56.52 
 
 		 478 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5655  aspartate ammonia-lyase  56.52 
 
 		 478 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0582808  normal  0.320226 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4608  aspartate ammonia-lyase  56.52 
 
 		 478 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.21143  normal  0.755736 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0593  aspartate ammonia-lyase  54.43 
 
 		 472 aa  507  9.999999999999999e-143  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0466  aspartate ammonia-lyase  57.27 
 
 		 471 aa  506  9.999999999999999e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000107475  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0682  aspartate ammonia-lyase  54.64 
 
 		 480 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4355  aspartate ammonia-lyase  55.56 
 
 		 474 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000233495  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3873  aspartate ammonia-lyase  56.52 
 
 		 478 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4694  aspartate ammonia-lyase  56.3 
 
 		 478 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3115  aspartate ammonia-lyase  53.55 
 
 		 476 aa  504  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1667  aspartate ammonia-lyase  53.22 
 
 		 479 aa  503  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0778255  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0647  aspartate ammonia-lyase  52.9 
 
 		 477 aa  501  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00115494  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0520  aspartate ammonia-lyase  52.9 
 
 		 477 aa  503  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270873  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1811  aspartate ammonia-lyase  53.43 
 
 		 479 aa  503  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0520  aspartate ammonia-lyase  53.12 
 
 		 477 aa  504  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3530  aspartate ammonia-lyase  53.12 
 
 		 479 aa  501  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4722  aspartate ammonia-lyase  56.3 
 
 		 478 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0609  aspartate ammonia-lyase  52.9 
 
 		 477 aa  502  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0391  thiamine biosynthesis protein ThiC  52.17 
 
 		 466 aa  502  1e-141  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1800  aspartate ammonia-lyase  53.22 
 
 		 479 aa  503  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4604  aspartate ammonia-lyase  56.3 
 
 		 478 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0589  aspartate ammonia-lyase  52.28 
 
 		 467 aa  504  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4687  aspartate ammonia-lyase  56.3 
 
 		 478 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1921  aspartate ammonia-lyase  53.22 
 
 		 479 aa  503  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>