More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1545 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1545  aspartate ammonia-lyase  100 
 
 
470 aa  979    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000011141  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1417  aspartate ammonia-lyase  76.45 
 
 
470 aa  774    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.442168 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2008  aspartate ammonia-lyase  58.89 
 
 
468 aa  561  1.0000000000000001e-159  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2009  aspartate ammonia-lyase  59.52 
 
 
476 aa  556  1e-157  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1643  aspartate ammonia-lyase  56.84 
 
 
474 aa  554  1e-156  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0082  aspartate ammonia-lyase  55.67 
 
 
468 aa  547  1e-154  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0122  aspartate ammonia-lyase  55.67 
 
 
468 aa  546  1e-154  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0094  aspartate ammonia-lyase  55.67 
 
 
468 aa  546  1e-154  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2083  aspartate ammonia-lyase  54.09 
 
 
475 aa  542  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195347  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2177  aspartate ammonia-lyase  54.09 
 
 
475 aa  544  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1757  aspartate ammonia-lyase  54.53 
 
 
482 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0193  aspartate ammonia-lyase  55.14 
 
 
463 aa  526  1e-148  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2438  aspartate ammonia-lyase  54.9 
 
 
466 aa  521  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.268607  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24080  aspartate ammonia-lyase  53.78 
 
 
505 aa  511  1e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1091  aspartate ammonia-lyase  54.06 
 
 
485 aa  509  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.0187146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5387  aspartate ammonia-lyase  54.74 
 
 
485 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5338  aspartate ammonia-lyase  54.53 
 
 
478 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486768 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3403  aspartate ammonia-lyase  53.58 
 
 
469 aa  504  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00437169  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1791  aspartate ammonia-lyase  54.57 
 
 
475 aa  503  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5247  aspartate ammonia-lyase  54.31 
 
 
478 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0371805  normal  0.169068 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3758  fumarate lyase  53.95 
 
 
471 aa  499  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1152  fumarate lyase  53.93 
 
 
481 aa  501  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265028  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2072  aspartate ammonia-lyase  53.46 
 
 
471 aa  498  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6217  aspartate ammonia-lyase  53.88 
 
 
474 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.946627  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3846  aspartate ammonia-lyase  52.48 
 
 
467 aa  499  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1746  fumarate lyase  52.88 
 
 
469 aa  499  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71650  aspartate ammonia-lyase  54.09 
 
 
474 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5752  aspartate ammonia-lyase  54.88 
 
 
475 aa  495  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555308  normal  0.129771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0135  aspartate ammonia-lyase  53.66 
 
 
485 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1741  aspartate ammonia-lyase  52.6 
 
 
475 aa  494  9.999999999999999e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1993  aspartate ammonia-lyase  52.29 
 
 
463 aa  493  9.999999999999999e-139  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0391  thiamine biosynthesis protein ThiC  51.08 
 
 
466 aa  492  9.999999999999999e-139  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5499  aspartate ammonia-lyase  53.02 
 
 
474 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2124  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  52.16 
 
 
471 aa  491  9.999999999999999e-139  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000051294  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0128  aspartate ammonia-lyase  52.8 
 
 
474 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.266622  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3530  fumarate lyase  52.4 
 
 
540 aa  494  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.448364 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3544  fumarate lyase  54.05 
 
 
471 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3976  fumarate lyase  53.95 
 
 
471 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1178  aspartate ammonia-lyase  52.14 
 
 
485 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000150136 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0677  aspartate ammonia-lyase  51.27 
 
 
477 aa  491  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0185443  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5051  aspartate ammonia-lyase  52.8 
 
 
474 aa  491  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0526  aspartate ammonia-lyase  50.84 
 
 
477 aa  491  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0181392  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4691  aspartate ammonia-lyase  50.84 
 
 
477 aa  488  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000148862  hitchhiker  1.50426e-18 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2167  aspartate ammonia-lyase  50.76 
 
 
480 aa  488  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0939  aspartate ammonia-lyase  54.55 
 
 
468 aa  491  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0736  aspartate ammonia-lyase  51.05 
 
 
477 aa  488  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0153519  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2667  fumarase  50.11 
 
 
479 aa  485  1e-136  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.284725  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0827  fumarate lyase  51.61 
 
 
483 aa  486  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2052  aspartate ammonia-lyase  52.07 
 
 
485 aa  487  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0909745  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3455  aspartate ammonia-lyase  52.29 
 
 
470 aa  486  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025134  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5625  aspartate ammonia-lyase  52.59 
 
 
478 aa  487  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149238  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0647  aspartate ammonia-lyase  50.84 
 
 
477 aa  487  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00115494  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3115  aspartate ammonia-lyase  50.76 
 
 
476 aa  487  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0140  aspartate ammonia-lyase  52.6 
 
 
470 aa  484  1e-135  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0576  aspartate ammonia-lyase  50.63 
 
 
477 aa  484  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1667  aspartate ammonia-lyase  50.22 
 
 
479 aa  481  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0778255  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0520  aspartate ammonia-lyase  50.63 
 
 
477 aa  484  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270873  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0520  aspartate ammonia-lyase  50.63 
 
 
477 aa  484  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1921  aspartate ammonia-lyase  50.22 
 
 
479 aa  481  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0523  aspartate ammonia-lyase  50.42 
 
 
477 aa  482  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442808  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0609  aspartate ammonia-lyase  50.63 
 
 
477 aa  484  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1800  aspartate ammonia-lyase  50.22 
 
 
479 aa  481  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4355  aspartate ammonia-lyase  51.63 
 
 
474 aa  482  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000233495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0665  aspartate ammonia-lyase  50.63 
 
 
477 aa  484  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0151100000000002e-47 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1811  aspartate ammonia-lyase  50.43 
 
 
479 aa  483  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1665  aspartate ammonia-lyase  50.22 
 
 
479 aa  481  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5639  aspartate ammonia-lyase  51.62 
 
 
479 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.611375  normal  0.502562 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1299  fumarate lyase  53.59 
 
 
479 aa  479  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160462  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0589  aspartate ammonia-lyase  51.09 
 
 
467 aa  479  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3530  aspartate ammonia-lyase  50 
 
 
479 aa  480  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1958  aspartate ammonia-lyase  51.3 
 
 
483 aa  477  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.175554  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0481  aspartate ammonia-lyase  51.19 
 
 
474 aa  476  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1884  aspartate ammonia-lyase  51.3 
 
 
483 aa  476  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218686  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3458  aspartate ammonia-lyase  51.63 
 
 
468 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.882524  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00154  aspartate ammonia-lyase  50.32 
 
 
483 aa  476  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0406  aspartate ammonia-lyase  49.15 
 
 
478 aa  476  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4302  aspartate ammonia-lyase  51.85 
 
 
468 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6431  aspartate ammonia-lyase  52.28 
 
 
471 aa  476  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4064  aspartate ammonia-lyase  51.85 
 
 
468 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1395  fumarate lyase  50.77 
 
 
478 aa  473  1e-132  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0593  aspartate ammonia-lyase  49.68 
 
 
472 aa  473  1e-132  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3958  fumarate lyase  49.46 
 
 
571 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3825  aspartate ammonia-lyase  48.72 
 
 
478 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03150  aspartate ammonia-lyase  49.46 
 
 
471 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000322515  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002214  aspartate ammonia-lyase  49.89 
 
 
483 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1116  putative aspartate ammonia-lyase  50.33 
 
 
466 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2270  aspartate ammonia-lyase  50.32 
 
 
483 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.935521  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3457  aspartate ammonia-lyase  52.51 
 
 
468 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4435  fumarate lyase  49.46 
 
 
560 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3678  aspartate ammonia-lyase  48.72 
 
 
478 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4326  fumarate lyase  49.68 
 
 
568 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705927  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0789  aspartate ammonia-lyase  52.93 
 
 
472 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1555  aspartate ammonia-lyase (Aspartase)  50.22 
 
 
469 aa  465  9.999999999999999e-131  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2915  aspartate ammonia-lyase  50.54 
 
 
476 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2883  aspartate ammonia-lyase  50.76 
 
 
476 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2845  aspartate ammonia-lyase  50.76 
 
 
476 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0725  aspartate ammonia-lyase  48.51 
 
 
478 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3136  aspartate ammonia-lyase  50.54 
 
 
476 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2652  aspartate ammonia-lyase  50.87 
 
 
467 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531608  normal  0.0454862 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1614  aspartate ammonia-lyase  50.43 
 
 
479 aa  462  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>