More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5752 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2072  aspartate ammonia-lyase  80.83 
 
 		 471 aa  743    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1746  fumarate lyase  67.74 
 
 		 469 aa  645    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0481  aspartate ammonia-lyase  75.76 
 
 		 474 aa  704    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1791  aspartate ammonia-lyase  76.09 
 
 		 475 aa  702    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6431  aspartate ammonia-lyase  78.97 
 
 		 471 aa  734    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4302  aspartate ammonia-lyase  69.13 
 
 		 468 aa  636    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4064  aspartate ammonia-lyase  69.13 
 
 		 468 aa  636    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5639  aspartate ammonia-lyase  68.61 
 
 		 479 aa  644    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.611375  normal  0.502562 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5752  aspartate ammonia-lyase  100 
 
 		 475 aa  971    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555308  normal  0.129771 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3458  aspartate ammonia-lyase  69.35 
 
 		 468 aa  639    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.882524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0939  aspartate ammonia-lyase  76.03 
 
 		 468 aa  691    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3530  fumarate lyase  68.47 
 
 		 540 aa  629  1e-179  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.448364 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3544  fumarate lyase  69.63 
 
 		 471 aa  630  1e-179  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3976  fumarate lyase  69.26 
 
 		 471 aa  630  1e-179  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3758  fumarate lyase  68.18 
 
 		 471 aa  625  1e-178  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3457  aspartate ammonia-lyase  69.13 
 
 		 468 aa  623  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1984  aspartate ammonia-lyase  69.13 
 
 		 468 aa  620  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3964  aspartate ammonia-lyase  69.35 
 
 		 468 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256806 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0827  fumarate lyase  63.91 
 
 		 483 aa  606  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1299  fumarate lyase  68.15 
 
 		 479 aa  595  1e-169  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160462  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1152  fumarate lyase  63.6 
 
 		 481 aa  584  1.0000000000000001e-165  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1643  aspartate ammonia-lyase  61 
 
 		 474 aa  581  1e-164  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2009  aspartate ammonia-lyase  59.75 
 
 		 476 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24080  aspartate ammonia-lyase  62.13 
 
 		 505 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2008  aspartate ammonia-lyase  60.95 
 
 		 468 aa  571  1.0000000000000001e-162  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0356  fumarate lyase  64.78 
 
 		 481 aa  574  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0082  aspartate ammonia-lyase  61 
 
 		 468 aa  571  1e-161  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2167  aspartate ammonia-lyase  61.39 
 
 		 480 aa  569  1e-161  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0122  aspartate ammonia-lyase  61 
 
 		 468 aa  569  1e-161  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0094  aspartate ammonia-lyase  60.61 
 
 		 468 aa  568  1e-160  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2083  aspartate ammonia-lyase  61.26 
 
 		 475 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195347  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2177  aspartate ammonia-lyase  61.26 
 
 		 475 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3455  aspartate ammonia-lyase  62.09 
 
 		 470 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025134  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2438  aspartate ammonia-lyase  60.22 
 
 		 466 aa  563  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.268607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1905  fumarate lyase  57.78 
 
 		 475 aa  556  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5499  aspartate ammonia-lyase  60.87 
 
 		 474 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1757  aspartate ammonia-lyase  61.69 
 
 		 482 aa  551  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0128  aspartate ammonia-lyase  59.66 
 
 		 474 aa  546  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5051  aspartate ammonia-lyase  60.43 
 
 		 474 aa  547  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5625  aspartate ammonia-lyase  59.87 
 
 		 478 aa  546  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149238  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0193  aspartate ammonia-lyase  59.13 
 
 		 463 aa  545  1e-154  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5387  aspartate ammonia-lyase  60.09 
 
 		 485 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5338  aspartate ammonia-lyase  60.09 
 
 		 478 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486768 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5247  aspartate ammonia-lyase  59.87 
 
 		 478 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0371805  normal  0.169068 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2052  aspartate ammonia-lyase  56.34 
 
 		 485 aa  540  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0909745  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4326  fumarate lyase  59.61 
 
 		 568 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705927  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0135  aspartate ammonia-lyase  59.44 
 
 		 485 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6217  aspartate ammonia-lyase  58.8 
 
 		 474 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.946627  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71650  aspartate ammonia-lyase  59.01 
 
 		 474 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3958  fumarate lyase  58.96 
 
 		 571 aa  534  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1365  fumarate lyase  57.86 
 
 		 484 aa  533  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000934378  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4435  fumarate lyase  58.55 
 
 		 560 aa  534  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0565  aspartate ammonia-lyase  57.27 
 
 		 521 aa  520  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0355315 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0461  fumarate lyase  59.35 
 
 		 507 aa  520  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1091  aspartate ammonia-lyase  55.51 
 
 		 485 aa  518  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.0187146 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00154  aspartate ammonia-lyase  55.08 
 
 		 483 aa  514  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002214  aspartate ammonia-lyase  55.08 
 
 		 483 aa  518  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0406  aspartate ammonia-lyase  54.29 
 
 		 478 aa  518  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1178  aspartate ammonia-lyase  55.51 
 
 		 485 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000150136 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1993  aspartate ammonia-lyase  54.57 
 
 		 463 aa  513  1e-144  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3825  aspartate ammonia-lyase  54.08 
 
 		 478 aa  514  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3678  aspartate ammonia-lyase  54.08 
 
 		 478 aa  514  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0725  aspartate ammonia-lyase  54.08 
 
 		 478 aa  514  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04009  aspartate ammonia-lyase  55.36 
 
 		 478 aa  508  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3853  aspartate ammonia-lyase  55.36 
 
 		 478 aa  508  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5655  aspartate ammonia-lyase  55.36 
 
 		 478 aa  508  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0582808  normal  0.320226 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4380  aspartate ammonia-lyase  55.36 
 
 		 478 aa  508  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4608  aspartate ammonia-lyase  55.36 
 
 		 478 aa  508  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.21143  normal  0.755736 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4668  aspartate ammonia-lyase  55.36 
 
 		 478 aa  508  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3846  aspartate ammonia-lyase  53.46 
 
 		 467 aa  508  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3873  aspartate ammonia-lyase  55.36 
 
 		 478 aa  508  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3403  aspartate ammonia-lyase  55.31 
 
 		 469 aa  509  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00437169  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1545  aspartate ammonia-lyase  54.88 
 
 		 470 aa  509  1e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000011141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2270  aspartate ammonia-lyase  53.62 
 
 		 483 aa  510  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.935521  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03971  hypothetical protein  55.36 
 
 		 478 aa  508  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0789  aspartate ammonia-lyase  58.33 
 
 		 472 aa  509  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1741  aspartate ammonia-lyase  54.23 
 
 		 475 aa  505  9.999999999999999e-143  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1417  aspartate ammonia-lyase  53.53 
 
 		 470 aa  508  9.999999999999999e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.442168 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4694  aspartate ammonia-lyase  55.15 
 
 		 478 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1293  aspartate ammonia-lyase  57.48 
 
 		 468 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0277144  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4722  aspartate ammonia-lyase  54.51 
 
 		 478 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4596  aspartate ammonia-lyase  54.51 
 
 		 478 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4355  aspartate ammonia-lyase  54.35 
 
 		 474 aa  502  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000233495  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2806  aspartate ammonia-lyase  53.86 
 
 		 482 aa  503  1e-141  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4604  aspartate ammonia-lyase  54.51 
 
 		 478 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2652  aspartate ammonia-lyase  55.97 
 
 		 467 aa  502  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531608  normal  0.0454862 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4744  aspartate ammonia-lyase  54.51 
 
 		 478 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.825089  normal  0.538431 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4687  aspartate ammonia-lyase  54.51 
 
 		 478 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1395  fumarate lyase  55.68 
 
 		 478 aa  498  1e-140  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0466  aspartate ammonia-lyase  55.15 
 
 		 471 aa  500  1e-140  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000107475  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0682  aspartate ammonia-lyase  53.25 
 
 		 480 aa  500  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1958  aspartate ammonia-lyase  55.53 
 
 		 483 aa  495  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.175554  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0645  aspartate ammonia-lyase  53.12 
 
 		 479 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1884  aspartate ammonia-lyase  55.53 
 
 		 483 aa  495  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218686  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0640  aspartate ammonia-lyase  53.12 
 
 		 479 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0618  aspartate ammonia-lyase  53.12 
 
 		 479 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0326  aspartate ammonia-lyase  54.39 
 
 		 478 aa  496  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000442883 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0593  aspartate ammonia-lyase  53.45 
 
 		 472 aa  496  1e-139  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3532  aspartate ammonia-lyase  54.31 
 
 		 479 aa  491  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.563164  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0589  aspartate ammonia-lyase  52.06 
 
 		 467 aa  492  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>