More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4355 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4355  aspartate ammonia-lyase  100 
 
 
474 aa  959    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000233495  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0526  aspartate ammonia-lyase  64.67 
 
 
477 aa  636    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0181392  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0523  aspartate ammonia-lyase  65.1 
 
 
477 aa  636    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442808  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4691  aspartate ammonia-lyase  64.88 
 
 
477 aa  633  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000148862  hitchhiker  1.50426e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0736  aspartate ammonia-lyase  64.88 
 
 
477 aa  631  1e-180  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0153519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0665  aspartate ammonia-lyase  64.67 
 
 
477 aa  629  1e-179  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0151100000000002e-47 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0677  aspartate ammonia-lyase  64.88 
 
 
477 aa  630  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0185443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0576  aspartate ammonia-lyase  64.67 
 
 
477 aa  628  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0647  aspartate ammonia-lyase  64.88 
 
 
477 aa  630  1e-179  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00115494  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0520  aspartate ammonia-lyase  64.67 
 
 
477 aa  629  1e-179  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270873  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0520  aspartate ammonia-lyase  64.67 
 
 
477 aa  630  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0609  aspartate ammonia-lyase  64.67 
 
 
477 aa  628  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1665  aspartate ammonia-lyase  63.6 
 
 
479 aa  617  1e-176  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1811  aspartate ammonia-lyase  62.96 
 
 
479 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03150  aspartate ammonia-lyase  63.38 
 
 
471 aa  613  9.999999999999999e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000322515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3115  aspartate ammonia-lyase  62.96 
 
 
476 aa  610  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1667  aspartate ammonia-lyase  62.74 
 
 
479 aa  610  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0778255  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1800  aspartate ammonia-lyase  62.74 
 
 
479 aa  610  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1921  aspartate ammonia-lyase  62.74 
 
 
479 aa  610  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3530  aspartate ammonia-lyase  62.53 
 
 
479 aa  609  1e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3135  aspartate ammonia-lyase  63.6 
 
 
476 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1847  aspartate ammonia-lyase  62.96 
 
 
479 aa  597  1e-169  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142722 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1872  aspartate ammonia-lyase  62.74 
 
 
479 aa  595  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2915  aspartate ammonia-lyase  62.96 
 
 
476 aa  597  1e-169  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1649  aspartate ammonia-lyase  62.96 
 
 
479 aa  597  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2883  aspartate ammonia-lyase  62.96 
 
 
476 aa  596  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1614  aspartate ammonia-lyase  62.96 
 
 
479 aa  597  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3136  aspartate ammonia-lyase  62.96 
 
 
476 aa  597  1e-169  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2845  aspartate ammonia-lyase  62.88 
 
 
476 aa  592  1e-168  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3158  aspartate ammonia-lyase  62.74 
 
 
476 aa  593  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2122  aspartate ammonia-lyase  62.53 
 
 
476 aa  592  1e-168  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2667  fumarase  58.96 
 
 
479 aa  579  1e-164  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.284725  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1415  aspartate ammonia-lyase  57.88 
 
 
466 aa  545  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24959e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2795  aspartate ammonia-lyase  57.05 
 
 
466 aa  541  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000791072  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0940  aspartate ammonia-lyase  55.97 
 
 
467 aa  522  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0286202  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0682  aspartate ammonia-lyase  56.1 
 
 
472 aa  524  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000328745  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0479  aspartate ammonia-lyase  57.61 
 
 
463 aa  518  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2083  aspartate ammonia-lyase  56.21 
 
 
475 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195347  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2177  aspartate ammonia-lyase  55.99 
 
 
475 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1240  aspartate ammonia-lyase  54.45 
 
 
498 aa  520  1e-146  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0519864  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2438  aspartate ammonia-lyase  56.3 
 
 
466 aa  520  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.268607  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3082  aspartate ammonia-lyase  55.39 
 
 
469 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1993  aspartate ammonia-lyase  55 
 
 
463 aa  514  1e-144  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2167  aspartate ammonia-lyase  53.91 
 
 
480 aa  514  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1273  aspartate ammonia-lyase  53.81 
 
 
476 aa  510  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000429353 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1643  aspartate ammonia-lyase  53.42 
 
 
474 aa  509  1e-143  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3455  aspartate ammonia-lyase  55.31 
 
 
470 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025134  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0122  aspartate ammonia-lyase  52.29 
 
 
468 aa  501  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0082  aspartate ammonia-lyase  52.51 
 
 
468 aa  503  1e-141  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3758  fumarate lyase  55.12 
 
 
471 aa  504  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0094  aspartate ammonia-lyase  51.61 
 
 
468 aa  502  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1757  aspartate ammonia-lyase  55.77 
 
 
482 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2052  aspartate ammonia-lyase  54.45 
 
 
485 aa  498  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0909745  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0162  aspartate ammonia-lyase  53.65 
 
 
484 aa  499  1e-140  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0565  aspartate ammonia-lyase  54.9 
 
 
521 aa  498  1e-140  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0355315 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0193  aspartate ammonia-lyase  53.61 
 
 
463 aa  496  1e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3544  fumarate lyase  55.02 
 
 
471 aa  497  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3976  fumarate lyase  54.9 
 
 
471 aa  496  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24080  aspartate ammonia-lyase  51.85 
 
 
505 aa  491  9.999999999999999e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6431  aspartate ammonia-lyase  55.56 
 
 
471 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1791  aspartate ammonia-lyase  55.65 
 
 
475 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1293  aspartate ammonia-lyase  56.64 
 
 
468 aa  489  1e-137  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0277144  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2072  aspartate ammonia-lyase  55.34 
 
 
471 aa  489  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5338  aspartate ammonia-lyase  53.8 
 
 
478 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486768 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5639  aspartate ammonia-lyase  52.94 
 
 
479 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.611375  normal  0.502562 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5051  aspartate ammonia-lyase  53.78 
 
 
474 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3458  aspartate ammonia-lyase  53.68 
 
 
468 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.882524  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5752  aspartate ammonia-lyase  54.35 
 
 
475 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555308  normal  0.129771 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5247  aspartate ammonia-lyase  53.8 
 
 
478 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0371805  normal  0.169068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5387  aspartate ammonia-lyase  53.58 
 
 
485 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2009  aspartate ammonia-lyase  52.51 
 
 
476 aa  485  1e-136  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2008  aspartate ammonia-lyase  53.16 
 
 
468 aa  487  1e-136  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5499  aspartate ammonia-lyase  53.56 
 
 
474 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0391  thiamine biosynthesis protein ThiC  50.98 
 
 
466 aa  483  1e-135  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1746  fumarate lyase  53.58 
 
 
469 aa  484  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0135  aspartate ammonia-lyase  53.58 
 
 
485 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2689  aspartate ammonia-lyase  51.64 
 
 
476 aa  484  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0392115  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4302  aspartate ammonia-lyase  53.46 
 
 
468 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1545  aspartate ammonia-lyase  51.63 
 
 
470 aa  482  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000011141  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4064  aspartate ammonia-lyase  53.46 
 
 
468 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0550  aspartate ammonia-lyase  53.04 
 
 
467 aa  483  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1152  fumarate lyase  53.06 
 
 
481 aa  483  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265028  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0184  fumarate lyase  53.12 
 
 
488 aa  478  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0128  aspartate ammonia-lyase  53.36 
 
 
474 aa  479  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.266622  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0481  aspartate ammonia-lyase  53.25 
 
 
474 aa  480  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5625  aspartate ammonia-lyase  53.8 
 
 
478 aa  479  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149238  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1663  aspartate ammonia-lyase  54.03 
 
 
474 aa  481  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.201173  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71650  aspartate ammonia-lyase  54.13 
 
 
474 aa  478  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3403  aspartate ammonia-lyase  52.17 
 
 
469 aa  477  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00437169  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6217  aspartate ammonia-lyase  54.13 
 
 
474 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.946627  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1984  aspartate ammonia-lyase  52.8 
 
 
468 aa  472  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4435  fumarate lyase  52.83 
 
 
560 aa  474  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3457  aspartate ammonia-lyase  53.25 
 
 
468 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1905  fumarate lyase  50.43 
 
 
475 aa  474  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2124  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  50.85 
 
 
471 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000051294  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4326  fumarate lyase  52.39 
 
 
568 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705927  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1299  fumarate lyase  54.34 
 
 
479 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160462  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3958  fumarate lyase  52.17 
 
 
571 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2652  aspartate ammonia-lyase  52.38 
 
 
467 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531608  normal  0.0454862 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3964  aspartate ammonia-lyase  53.25 
 
 
468 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>