More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2795 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0479  aspartate ammonia-lyase  72.29 
 
 		 463 aa  645    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0940  aspartate ammonia-lyase  70.11 
 
 		 467 aa  658    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0286202  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3082  aspartate ammonia-lyase  72.47 
 
 		 469 aa  679    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2795  aspartate ammonia-lyase  100 
 
 		 466 aa  944    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000791072  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1415  aspartate ammonia-lyase  95.27 
 
 		 466 aa  900    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24959e-23 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0550  aspartate ammonia-lyase  67.1 
 
 		 467 aa  610  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4355  aspartate ammonia-lyase  57.05 
 
 		 474 aa  541  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000233495  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03150  aspartate ammonia-lyase  51.83 
 
 		 471 aa  511  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000322515  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2689  aspartate ammonia-lyase  54.35 
 
 		 476 aa  500  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0392115  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1667  aspartate ammonia-lyase  51.84 
 
 		 479 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0778255  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0520  aspartate ammonia-lyase  51.63 
 
 		 477 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270873  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0520  aspartate ammonia-lyase  51.84 
 
 		 477 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1665  aspartate ammonia-lyase  51.84 
 
 		 479 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4691  aspartate ammonia-lyase  51.19 
 
 		 477 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000148862  hitchhiker  1.50426e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1800  aspartate ammonia-lyase  51.84 
 
 		 479 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1811  aspartate ammonia-lyase  52.06 
 
 		 479 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0526  aspartate ammonia-lyase  51.41 
 
 		 477 aa  491  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0181392  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3530  aspartate ammonia-lyase  51.84 
 
 		 479 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0736  aspartate ammonia-lyase  51.41 
 
 		 477 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0153519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0665  aspartate ammonia-lyase  51.63 
 
 		 477 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0151100000000002e-47 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1921  aspartate ammonia-lyase  51.84 
 
 		 479 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0677  aspartate ammonia-lyase  51.41 
 
 		 477 aa  491  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0185443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0576  aspartate ammonia-lyase  51.63 
 
 		 477 aa  491  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4762  fumarate lyase  55.78 
 
 		 473 aa  489  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0609  aspartate ammonia-lyase  51.63 
 
 		 477 aa  491  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0523  aspartate ammonia-lyase  50.76 
 
 		 477 aa  485  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442808  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3341  fumarate lyase  54 
 
 		 484 aa  485  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.611164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3115  aspartate ammonia-lyase  51.52 
 
 		 476 aa  488  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2500  fumarate lyase  55.41 
 
 		 472 aa  485  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0647  aspartate ammonia-lyase  50.98 
 
 		 477 aa  488  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00115494  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1872  aspartate ammonia-lyase  52.06 
 
 		 479 aa  482  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1649  aspartate ammonia-lyase  52.06 
 
 		 479 aa  483  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1614  aspartate ammonia-lyase  52.06 
 
 		 479 aa  483  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1847  aspartate ammonia-lyase  52.06 
 
 		 479 aa  483  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142722 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2667  fumarase  49.89 
 
 		 479 aa  484  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.284725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3135  aspartate ammonia-lyase  52.06 
 
 		 476 aa  483  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2883  aspartate ammonia-lyase  51.63 
 
 		 476 aa  478  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0925  fumarate lyase  53.58 
 
 		 484 aa  479  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.751355  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2602  aspartate ammonia-lyase  55.8 
 
 		 475 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1346  aspartate ammonia-lyase  55.58 
 
 		 475 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2915  aspartate ammonia-lyase  51.63 
 
 		 476 aa  477  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2845  aspartate ammonia-lyase  51.73 
 
 		 476 aa  476  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3136  aspartate ammonia-lyase  51.63 
 
 		 476 aa  477  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1245  aspartate ammonia-lyase  55.36 
 
 		 475 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.431098  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2122  aspartate ammonia-lyase  51.41 
 
 		 476 aa  473  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0682  aspartate ammonia-lyase  49.46 
 
 		 472 aa  473  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000328745  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3158  aspartate ammonia-lyase  51.41 
 
 		 476 aa  474  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1258  aspartate ammonia-lyase  55.99 
 
 		 481 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.963292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3556  aspartate ammonia-lyase  52.44 
 
 		 471 aa  463  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2695  fumarate lyase  50.44 
 
 		 468 aa  458  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  50.32 
 
 		 468 aa  448  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1273  aspartate ammonia-lyase  50 
 
 		 476 aa  447  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000429353 
 
 
-
 
NC_004310  BR1958  aspartate ammonia-lyase  49.79 
 
 		 483 aa  441  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.175554  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2119  aspartate ammonia-lyase  51.89 
 
 		 466 aa  442  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1884  aspartate ammonia-lyase  49.79 
 
 		 483 aa  441  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218686  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2167  aspartate ammonia-lyase  48.7 
 
 		 480 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2052  aspartate ammonia-lyase  47.28 
 
 		 485 aa  435  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0909745  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3758  fumarate lyase  49.45 
 
 		 471 aa  434  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0092  fumarate lyase  47.49 
 
 		 472 aa  434  1e-120  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2177  aspartate ammonia-lyase  48.91 
 
 		 475 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0082  aspartate ammonia-lyase  45.82 
 
 		 468 aa  433  1e-120  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0162  aspartate ammonia-lyase  49.78 
 
 		 484 aa  434  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0094  aspartate ammonia-lyase  45.82 
 
 		 468 aa  432  1e-120  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0193  aspartate ammonia-lyase  48.57 
 
 		 463 aa  434  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2083  aspartate ammonia-lyase  48.91 
 
 		 475 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195347  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1240  aspartate ammonia-lyase  48.16 
 
 		 498 aa  432  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0519864  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  49.34 
 
 		 459 aa  434  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1395  fumarate lyase  48.27 
 
 		 478 aa  432  1e-120  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  50.76 
 
 		 469 aa  431  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0122  aspartate ammonia-lyase  45.82 
 
 		 468 aa  431  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  49.24 
 
 		 472 aa  431  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3455  aspartate ammonia-lyase  48.92 
 
 		 470 aa  431  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025134  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1643  aspartate ammonia-lyase  46.97 
 
 		 474 aa  430  1e-119  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0565  aspartate ammonia-lyase  49.78 
 
 		 521 aa  427  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0355315 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0474  aspartate ammonia-lyase  48.13 
 
 		 461 aa  426  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.180708  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3403  aspartate ammonia-lyase  47.07 
 
 		 469 aa  426  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00437169  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1905  fumarate lyase  47.07 
 
 		 475 aa  425  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5051  aspartate ammonia-lyase  47.4 
 
 		 474 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1663  aspartate ammonia-lyase  48.92 
 
 		 474 aa  422  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.201173  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1545  aspartate ammonia-lyase  44.11 
 
 		 470 aa  422  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000011141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3846  aspartate ammonia-lyase  47.53 
 
 		 467 aa  424  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2438  aspartate ammonia-lyase  47.49 
 
 		 466 aa  422  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.268607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1293  aspartate ammonia-lyase  50 
 
 		 468 aa  423  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0277144  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5499  aspartate ammonia-lyase  47.19 
 
 		 474 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  49.56 
 
 		 475 aa  418  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1757  aspartate ammonia-lyase  49.13 
 
 		 482 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  47.95 
 
 		 480 aa  420  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0406  aspartate ammonia-lyase  47.53 
 
 		 478 aa  416  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0481  aspartate ammonia-lyase  49.02 
 
 		 474 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5625  aspartate ammonia-lyase  48.04 
 
 		 478 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149238  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3678  aspartate ammonia-lyase  47.1 
 
 		 478 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6217  aspartate ammonia-lyase  46.75 
 
 		 474 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.946627  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1091  aspartate ammonia-lyase  47.94 
 
 		 485 aa  412  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.0187146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5387  aspartate ammonia-lyase  46.96 
 
 		 485 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  48.16 
 
 		 469 aa  412  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  51.03 
 
 		 463 aa  412  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2008  aspartate ammonia-lyase  46.25 
 
 		 468 aa  413  1e-114  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3544  fumarate lyase  48.24 
 
 		 471 aa  414  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3976  fumarate lyase  48.13 
 
 		 471 aa  412  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3825  aspartate ammonia-lyase  47.1 
 
 		 478 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>