More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_2124 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0140  aspartate ammonia-lyase  89.51 
 
 		 470 aa  855    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2124  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  100 
 
 		 471 aa  971    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000051294  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1555  aspartate ammonia-lyase (Aspartase)  85.38 
 
 		 469 aa  807    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0391  thiamine biosynthesis protein ThiC  90.13 
 
 		 466 aa  869    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0082  aspartate ammonia-lyase  64.44 
 
 		 468 aa  630  1e-179  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0122  aspartate ammonia-lyase  64.66 
 
 		 468 aa  629  1e-179  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0094  aspartate ammonia-lyase  64.44 
 
 		 468 aa  627  1e-178  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1643  aspartate ammonia-lyase  63.27 
 
 		 474 aa  627  1e-178  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2009  aspartate ammonia-lyase  59.09 
 
 		 476 aa  565  1e-160  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2008  aspartate ammonia-lyase  59.09 
 
 		 468 aa  566  1e-160  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2177  aspartate ammonia-lyase  53.7 
 
 		 475 aa  528  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2083  aspartate ammonia-lyase  53.7 
 
 		 475 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195347  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2438  aspartate ammonia-lyase  54.21 
 
 		 466 aa  521  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.268607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1757  aspartate ammonia-lyase  54.57 
 
 		 482 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1545  aspartate ammonia-lyase  52.16 
 
 		 470 aa  501  1e-140  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000011141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1791  aspartate ammonia-lyase  54.47 
 
 		 475 aa  501  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3403  aspartate ammonia-lyase  52.28 
 
 		 469 aa  499  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00437169  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2072  aspartate ammonia-lyase  52.61 
 
 		 471 aa  498  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0135  aspartate ammonia-lyase  51.95 
 
 		 485 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5338  aspartate ammonia-lyase  52.16 
 
 		 478 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486768 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1993  aspartate ammonia-lyase  52.94 
 
 		 463 aa  497  1e-139  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3846  aspartate ammonia-lyase  50.11 
 
 		 467 aa  495  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0193  aspartate ammonia-lyase  53.17 
 
 		 463 aa  494  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5051  aspartate ammonia-lyase  51.94 
 
 		 474 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5639  aspartate ammonia-lyase  50.98 
 
 		 479 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.611375  normal  0.502562 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5247  aspartate ammonia-lyase  51.95 
 
 		 478 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0371805  normal  0.169068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5387  aspartate ammonia-lyase  51.95 
 
 		 485 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2052  aspartate ammonia-lyase  52.29 
 
 		 485 aa  491  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0909745  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5499  aspartate ammonia-lyase  51.72 
 
 		 474 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0481  aspartate ammonia-lyase  52.06 
 
 		 474 aa  488  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6217  aspartate ammonia-lyase  52.48 
 
 		 474 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.946627  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1417  aspartate ammonia-lyase  51.09 
 
 		 470 aa  491  1e-137  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.442168 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2167  aspartate ammonia-lyase  50.87 
 
 		 480 aa  489  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24080  aspartate ammonia-lyase  50 
 
 		 505 aa  490  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71650  aspartate ammonia-lyase  52.27 
 
 		 474 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3455  aspartate ammonia-lyase  51.72 
 
 		 470 aa  485  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025134  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0128  aspartate ammonia-lyase  51.4 
 
 		 474 aa  485  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6431  aspartate ammonia-lyase  52.39 
 
 		 471 aa  488  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0589  aspartate ammonia-lyase  49.46 
 
 		 467 aa  488  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3758  fumarate lyase  50.43 
 
 		 471 aa  484  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5625  aspartate ammonia-lyase  51.08 
 
 		 478 aa  484  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149238  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4355  aspartate ammonia-lyase  50.85 
 
 		 474 aa  479  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000233495  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1152  fumarate lyase  50.65 
 
 		 481 aa  479  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5752  aspartate ammonia-lyase  51.96 
 
 		 475 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555308  normal  0.129771 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0939  aspartate ammonia-lyase  52.81 
 
 		 468 aa  481  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1178  aspartate ammonia-lyase  50.11 
 
 		 485 aa  477  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000150136 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1116  putative aspartate ammonia-lyase  49.25 
 
 		 466 aa  477  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0576  aspartate ammonia-lyase  50.43 
 
 		 477 aa  472  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03150  aspartate ammonia-lyase  49.47 
 
 		 471 aa  471  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000322515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0609  aspartate ammonia-lyase  50.43 
 
 		 477 aa  472  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1905  fumarate lyase  47.96 
 
 		 475 aa  472  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3457  aspartate ammonia-lyase  52.06 
 
 		 468 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3544  fumarate lyase  51.19 
 
 		 471 aa  473  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0677  aspartate ammonia-lyase  50.43 
 
 		 477 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0185443  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0665  aspartate ammonia-lyase  50.43 
 
 		 477 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0151100000000002e-47 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0736  aspartate ammonia-lyase  50.43 
 
 		 477 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0153519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0520  aspartate ammonia-lyase  50.43 
 
 		 477 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4691  aspartate ammonia-lyase  50.43 
 
 		 477 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000148862  hitchhiker  1.50426e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0520  aspartate ammonia-lyase  50.22 
 
 		 477 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0526  aspartate ammonia-lyase  50.87 
 
 		 477 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0181392  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3458  aspartate ammonia-lyase  50.33 
 
 		 468 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.882524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0523  aspartate ammonia-lyase  50.43 
 
 		 477 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442808  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4302  aspartate ammonia-lyase  50.33 
 
 		 468 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3976  fumarate lyase  50.87 
 
 		 471 aa  470  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4064  aspartate ammonia-lyase  50.33 
 
 		 468 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1299  fumarate lyase  52.12 
 
 		 479 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160462  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00154  aspartate ammonia-lyase  48.7 
 
 		 483 aa  465  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1667  aspartate ammonia-lyase  49.57 
 
 		 479 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0778255  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1665  aspartate ammonia-lyase  49.35 
 
 		 479 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1800  aspartate ammonia-lyase  49.57 
 
 		 479 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1921  aspartate ammonia-lyase  49.57 
 
 		 479 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3530  aspartate ammonia-lyase  49.35 
 
 		 479 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1091  aspartate ammonia-lyase  49.67 
 
 		 485 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.0187146 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1811  aspartate ammonia-lyase  49.35 
 
 		 479 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2667  fumarase  48.51 
 
 		 479 aa  465  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.284725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0827  fumarate lyase  50.33 
 
 		 483 aa  465  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0789  aspartate ammonia-lyase  50.87 
 
 		 472 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1741  aspartate ammonia-lyase  50.22 
 
 		 475 aa  464  1e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1984  aspartate ammonia-lyase  50.76 
 
 		 468 aa  464  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0647  aspartate ammonia-lyase  50.22 
 
 		 477 aa  464  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00115494  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0406  aspartate ammonia-lyase  49.02 
 
 		 478 aa  463  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04009  aspartate ammonia-lyase  50.11 
 
 		 478 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3853  aspartate ammonia-lyase  50.11 
 
 		 478 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4608  aspartate ammonia-lyase  50.11 
 
 		 478 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.21143  normal  0.755736 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4694  aspartate ammonia-lyase  50.11 
 
 		 478 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0640  aspartate ammonia-lyase  48.48 
 
 		 479 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3825  aspartate ammonia-lyase  48.81 
 
 		 478 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3964  aspartate ammonia-lyase  51.84 
 
 		 468 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256806 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0645  aspartate ammonia-lyase  48.48 
 
 		 479 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0356  fumarate lyase  49.78 
 
 		 481 aa  459  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3678  aspartate ammonia-lyase  48.81 
 
 		 478 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3115  aspartate ammonia-lyase  48.6 
 
 		 476 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1746  fumarate lyase  50.65 
 
 		 469 aa  461  9.999999999999999e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0618  aspartate ammonia-lyase  48.48 
 
 		 479 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5655  aspartate ammonia-lyase  50.11 
 
 		 478 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0582808  normal  0.320226 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4380  aspartate ammonia-lyase  50.11 
 
 		 478 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03971  hypothetical protein  50.11 
 
 		 478 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3873  aspartate ammonia-lyase  50.11 
 
 		 478 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0682  aspartate ammonia-lyase  47.94 
 
 		 480 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4668  aspartate ammonia-lyase  50.11 
 
 		 478 aa  460  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>