More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1260 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1260  fumarate lyase  100 
 
 		 453 aa  926    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2689  aspartate ammonia-lyase  44.25 
 
 		 476 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0392115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0550  aspartate ammonia-lyase  45.43 
 
 		 467 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3082  aspartate ammonia-lyase  42.26 
 
 		 469 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0092  fumarate lyase  43.11 
 
 		 472 aa  391  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2119  aspartate ammonia-lyase  42.67 
 
 		 466 aa  386  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0682  aspartate ammonia-lyase  44.03 
 
 		 472 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000328745  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0474  aspartate ammonia-lyase  44.54 
 
 		 461 aa  385  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.180708  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3556  aspartate ammonia-lyase  43.02 
 
 		 471 aa  382  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2695  fumarate lyase  42.79 
 
 		 468 aa  382  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2667  fumarase  42.98 
 
 		 479 aa  383  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.284725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1665  aspartate ammonia-lyase  42.6 
 
 		 479 aa  383  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1667  aspartate ammonia-lyase  42.38 
 
 		 479 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0778255  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1811  aspartate ammonia-lyase  42.15 
 
 		 479 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1800  aspartate ammonia-lyase  42.38 
 
 		 479 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0940  aspartate ammonia-lyase  42.26 
 
 		 467 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0286202  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3115  aspartate ammonia-lyase  42.15 
 
 		 476 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3530  aspartate ammonia-lyase  42.15 
 
 		 479 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1921  aspartate ammonia-lyase  42.38 
 
 		 479 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1415  aspartate ammonia-lyase  42.48 
 
 		 466 aa  381  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24959e-23 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0406  aspartate ammonia-lyase  41.28 
 
 		 478 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0526  aspartate ammonia-lyase  41.11 
 
 		 477 aa  376  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0181392  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24080  aspartate ammonia-lyase  41.46 
 
 		 505 aa  378  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0479  aspartate ammonia-lyase  42.79 
 
 		 463 aa  372  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2795  aspartate ammonia-lyase  41.37 
 
 		 466 aa  372  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000791072  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4355  aspartate ammonia-lyase  41.16 
 
 		 474 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000233495  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3341  fumarate lyase  42.64 
 
 		 484 aa  373  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.611164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5387  aspartate ammonia-lyase  40.84 
 
 		 485 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0925  fumarate lyase  43.13 
 
 		 484 aa  374  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.751355  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2167  aspartate ammonia-lyase  40.53 
 
 		 480 aa  374  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2438  aspartate ammonia-lyase  40.27 
 
 		 466 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.268607  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5338  aspartate ammonia-lyase  40.84 
 
 		 478 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486768 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0677  aspartate ammonia-lyase  41.39 
 
 		 477 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0185443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0576  aspartate ammonia-lyase  41.39 
 
 		 477 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0520  aspartate ammonia-lyase  41.39 
 
 		 477 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270873  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0520  aspartate ammonia-lyase  41.61 
 
 		 477 aa  371  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002214  aspartate ammonia-lyase  41.59 
 
 		 483 aa  371  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0665  aspartate ammonia-lyase  41.39 
 
 		 477 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0151100000000002e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0609  aspartate ammonia-lyase  41.39 
 
 		 477 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5247  aspartate ammonia-lyase  40.84 
 
 		 478 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0371805  normal  0.169068 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4691  aspartate ammonia-lyase  41.39 
 
 		 477 aa  371  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000148862  hitchhiker  1.50426e-18 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3758  fumarate lyase  40.71 
 
 		 471 aa  371  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00154  aspartate ammonia-lyase  40.93 
 
 		 483 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3532  aspartate ammonia-lyase  41.28 
 
 		 479 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.563164  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1643  aspartate ammonia-lyase  40.53 
 
 		 474 aa  370  1e-101  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0736  aspartate ammonia-lyase  41.39 
 
 		 477 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0153519  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4762  fumarate lyase  42.45 
 
 		 473 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0565  aspartate ammonia-lyase  40.09 
 
 		 521 aa  365  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0355315 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3455  aspartate ammonia-lyase  41.46 
 
 		 470 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025134  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1958  aspartate ammonia-lyase  42.21 
 
 		 483 aa  368  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.175554  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3678  aspartate ammonia-lyase  40.4 
 
 		 478 aa  368  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1884  aspartate ammonia-lyase  42.21 
 
 		 483 aa  366  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218686  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1791  aspartate ammonia-lyase  41.37 
 
 		 475 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2270  aspartate ammonia-lyase  40.71 
 
 		 483 aa  366  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.935521  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0135  aspartate ammonia-lyase  41.44 
 
 		 485 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2177  aspartate ammonia-lyase  40.84 
 
 		 475 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0647  aspartate ammonia-lyase  41.16 
 
 		 477 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00115494  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  43.9 
 
 		 467 aa  368  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  39.87 
 
 		 459 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1395  fumarate lyase  40.4 
 
 		 478 aa  368  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2083  aspartate ammonia-lyase  40.84 
 
 		 475 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195347  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0391  thiamine biosynthesis protein ThiC  39.65 
 
 		 466 aa  366  1e-100  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0523  aspartate ammonia-lyase  40.94 
 
 		 477 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442808  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3825  aspartate ammonia-lyase  40.4 
 
 		 478 aa  368  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1365  fumarate lyase  42.13 
 
 		 484 aa  368  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000934378  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  41.94 
 
 		 480 aa  364  1e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0827  fumarate lyase  40.71 
 
 		 483 aa  364  1e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0725  aspartate ammonia-lyase  40.18 
 
 		 478 aa  365  1e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1872  aspartate ammonia-lyase  42.15 
 
 		 479 aa  364  2e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1649  aspartate ammonia-lyase  42.15 
 
 		 479 aa  364  2e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1614  aspartate ammonia-lyase  42.15 
 
 		 479 aa  364  2e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1847  aspartate ammonia-lyase  42.15 
 
 		 479 aa  364  2e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5499  aspartate ammonia-lyase  40.71 
 
 		 474 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03150  aspartate ammonia-lyase  39.29 
 
 		 471 aa  363  3e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000322515  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5051  aspartate ammonia-lyase  40.71 
 
 		 474 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0589  aspartate ammonia-lyase  39.78 
 
 		 467 aa  363  4e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0398  aspartate ammonia-lyase  41.06 
 
 		 479 aa  363  4e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0082  aspartate ammonia-lyase  39.3 
 
 		 468 aa  362  5.0000000000000005e-99  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3976  fumarate lyase  40.93 
 
 		 471 aa  363  5.0000000000000005e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4694  aspartate ammonia-lyase  41.28 
 
 		 478 aa  362  6e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04009  aspartate ammonia-lyase  41.28 
 
 		 478 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3853  aspartate ammonia-lyase  41.28 
 
 		 478 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5639  aspartate ammonia-lyase  39.47 
 
 		 479 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.611375  normal  0.502562 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03971  hypothetical protein  41.28 
 
 		 478 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3403  aspartate ammonia-lyase  42.26 
 
 		 469 aa  362  7.0000000000000005e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00437169  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4668  aspartate ammonia-lyase  41.28 
 
 		 478 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4380  aspartate ammonia-lyase  41.28 
 
 		 478 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5655  aspartate ammonia-lyase  41.28 
 
 		 478 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0582808  normal  0.320226 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4608  aspartate ammonia-lyase  41.28 
 
 		 478 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.21143  normal  0.755736 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1152  fumarate lyase  39.37 
 
 		 481 aa  362  7.0000000000000005e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3873  aspartate ammonia-lyase  41.28 
 
 		 478 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0094  aspartate ammonia-lyase  39.3 
 
 		 468 aa  361  1e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2845  aspartate ammonia-lyase  42.15 
 
 		 476 aa  362  1e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3135  aspartate ammonia-lyase  42.06 
 
 		 476 aa  362  1e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0122  aspartate ammonia-lyase  39.3 
 
 		 468 aa  361  1e-98  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2915  aspartate ammonia-lyase  41.93 
 
 		 476 aa  360  2e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3136  aspartate ammonia-lyase  41.93 
 
 		 476 aa  360  2e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3158  aspartate ammonia-lyase  42.38 
 
 		 476 aa  360  2e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0480  aspartate ammonia-lyase  40.84 
 
 		 479 aa  361  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2883  aspartate ammonia-lyase  42.15 
 
 		 476 aa  360  3e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>