More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3556 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_2695  fumarate lyase  86.75 
 
 		 468 aa  849    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3556  aspartate ammonia-lyase  100 
 
 		 471 aa  963    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0479  aspartate ammonia-lyase  55.9 
 
 		 463 aa  482  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3082  aspartate ammonia-lyase  53.98 
 
 		 469 aa  482  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0550  aspartate ammonia-lyase  55.93 
 
 		 467 aa  482  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0925  fumarate lyase  52.67 
 
 		 484 aa  474  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.751355  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3341  fumarate lyase  52.45 
 
 		 484 aa  473  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.611164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2500  fumarate lyase  53.71 
 
 		 472 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2689  aspartate ammonia-lyase  51.54 
 
 		 476 aa  470  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0392115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1346  aspartate ammonia-lyase  51.87 
 
 		 475 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1245  aspartate ammonia-lyase  51.43 
 
 		 475 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.431098  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2602  aspartate ammonia-lyase  51.43 
 
 		 475 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1415  aspartate ammonia-lyase  52.67 
 
 		 466 aa  464  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24959e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2795  aspartate ammonia-lyase  52.44 
 
 		 466 aa  463  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000791072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0520  aspartate ammonia-lyase  48.6 
 
 		 477 aa  455  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4355  aspartate ammonia-lyase  50.87 
 
 		 474 aa  455  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000233495  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0526  aspartate ammonia-lyase  48.6 
 
 		 477 aa  456  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0181392  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4762  fumarate lyase  50.11 
 
 		 473 aa  458  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0677  aspartate ammonia-lyase  48.38 
 
 		 477 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0185443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0576  aspartate ammonia-lyase  48.38 
 
 		 477 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0940  aspartate ammonia-lyase  51 
 
 		 467 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0286202  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0520  aspartate ammonia-lyase  48.38 
 
 		 477 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0736  aspartate ammonia-lyase  48.38 
 
 		 477 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0153519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0609  aspartate ammonia-lyase  48.38 
 
 		 477 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0665  aspartate ammonia-lyase  48.38 
 
 		 477 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0151100000000002e-47 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4691  aspartate ammonia-lyase  48.16 
 
 		 477 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000148862  hitchhiker  1.50426e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0647  aspartate ammonia-lyase  48.38 
 
 		 477 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00115494  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03150  aspartate ammonia-lyase  49.34 
 
 		 471 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000322515  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0523  aspartate ammonia-lyase  48.16 
 
 		 477 aa  451  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442808  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1258  aspartate ammonia-lyase  50.99 
 
 		 481 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.963292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2667  fumarase  46.27 
 
 		 479 aa  439  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.284725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2177  aspartate ammonia-lyase  49.57 
 
 		 475 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2119  aspartate ammonia-lyase  52.53 
 
 		 466 aa  438  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2083  aspartate ammonia-lyase  49.57 
 
 		 475 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195347  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  47.51 
 
 		 472 aa  437  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3530  aspartate ammonia-lyase  47.37 
 
 		 479 aa  428  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1665  aspartate ammonia-lyase  47.59 
 
 		 479 aa  431  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3115  aspartate ammonia-lyase  47.51 
 
 		 476 aa  431  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2052  aspartate ammonia-lyase  46.32 
 
 		 485 aa  426  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0909745  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1667  aspartate ammonia-lyase  47.37 
 
 		 479 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0778255  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1811  aspartate ammonia-lyase  47.37 
 
 		 479 aa  427  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1800  aspartate ammonia-lyase  47.37 
 
 		 479 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1921  aspartate ammonia-lyase  47.37 
 
 		 479 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3455  aspartate ammonia-lyase  48.16 
 
 		 470 aa  422  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025134  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2167  aspartate ammonia-lyase  45.18 
 
 		 480 aa  422  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  48.58 
 
 		 467 aa  424  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1757  aspartate ammonia-lyase  49.14 
 
 		 482 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3135  aspartate ammonia-lyase  47.72 
 
 		 476 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1791  aspartate ammonia-lyase  47.84 
 
 		 475 aa  420  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  47.49 
 
 		 468 aa  419  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0565  aspartate ammonia-lyase  47.63 
 
 		 521 aa  421  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0355315 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0406  aspartate ammonia-lyase  47.51 
 
 		 478 aa  421  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04009  aspartate ammonia-lyase  48.27 
 
 		 478 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3853  aspartate ammonia-lyase  48.27 
 
 		 478 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03971  hypothetical protein  48.27 
 
 		 478 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0082  aspartate ammonia-lyase  45.95 
 
 		 468 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4380  aspartate ammonia-lyase  48.27 
 
 		 478 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2915  aspartate ammonia-lyase  47.29 
 
 		 476 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0391  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.83 
 
 		 466 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2883  aspartate ammonia-lyase  47.51 
 
 		 476 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5655  aspartate ammonia-lyase  48.27 
 
 		 478 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0582808  normal  0.320226 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6217  aspartate ammonia-lyase  48.93 
 
 		 474 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.946627  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4608  aspartate ammonia-lyase  48.27 
 
 		 478 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.21143  normal  0.755736 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3873  aspartate ammonia-lyase  48.27 
 
 		 478 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4694  aspartate ammonia-lyase  48.27 
 
 		 478 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3136  aspartate ammonia-lyase  47.29 
 
 		 476 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2122  aspartate ammonia-lyase  47.51 
 
 		 476 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0122  aspartate ammonia-lyase  46.17 
 
 		 468 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3158  aspartate ammonia-lyase  47.51 
 
 		 476 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71650  aspartate ammonia-lyase  48.72 
 
 		 474 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2438  aspartate ammonia-lyase  47.07 
 
 		 466 aa  418  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.268607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4668  aspartate ammonia-lyase  48.27 
 
 		 478 aa  416  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1643  aspartate ammonia-lyase  45.95 
 
 		 474 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1872  aspartate ammonia-lyase  47.37 
 
 		 479 aa  414  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1649  aspartate ammonia-lyase  47.37 
 
 		 479 aa  414  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1614  aspartate ammonia-lyase  47.37 
 
 		 479 aa  414  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2845  aspartate ammonia-lyase  47.39 
 
 		 476 aa  414  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0094  aspartate ammonia-lyase  45.95 
 
 		 468 aa  414  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2124  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  46.39 
 
 		 471 aa  414  1e-114  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000051294  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0193  aspartate ammonia-lyase  46.74 
 
 		 463 aa  412  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  48.18 
 
 		 463 aa  412  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002214  aspartate ammonia-lyase  46.98 
 
 		 483 aa  414  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  47.87 
 
 		 459 aa  414  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1847  aspartate ammonia-lyase  47.37 
 
 		 479 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142722 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1884  aspartate ammonia-lyase  47.53 
 
 		 483 aa  410  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218686  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1958  aspartate ammonia-lyase  47.53 
 
 		 483 aa  411  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.175554  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0481  aspartate ammonia-lyase  45.32 
 
 		 474 aa  409  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  46.51 
 
 		 469 aa  411  1e-113  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2009  aspartate ammonia-lyase  46.17 
 
 		 476 aa  409  1e-113  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0682  aspartate ammonia-lyase  46.94 
 
 		 472 aa  409  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000328745  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2008  aspartate ammonia-lyase  46.61 
 
 		 468 aa  410  1e-113  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3758  fumarate lyase  48.09 
 
 		 471 aa  408  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1116  putative aspartate ammonia-lyase  45.1 
 
 		 466 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3825  aspartate ammonia-lyase  46.32 
 
 		 478 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00154  aspartate ammonia-lyase  46.55 
 
 		 483 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1663  aspartate ammonia-lyase  47.49 
 
 		 474 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.201173  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4604  aspartate ammonia-lyase  46.97 
 
 		 478 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4687  aspartate ammonia-lyase  46.97 
 
 		 478 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3976  fumarate lyase  48.21 
 
 		 471 aa  405  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0162  aspartate ammonia-lyase  47.41 
 
 		 484 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>