More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2500 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4762  fumarate lyase  74.46 
 
 
473 aa  717    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0925  fumarate lyase  85.84 
 
 
484 aa  833    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.751355  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3341  fumarate lyase  85.84 
 
 
484 aa  835    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.611164  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2500  fumarate lyase  100 
 
 
472 aa  970    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1415  aspartate ammonia-lyase  55.84 
 
 
466 aa  508  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24959e-23 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0550  aspartate ammonia-lyase  58.48 
 
 
467 aa  510  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2795  aspartate ammonia-lyase  55.41 
 
 
466 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000791072  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2695  fumarate lyase  53.06 
 
 
468 aa  488  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3556  aspartate ammonia-lyase  53.71 
 
 
471 aa  491  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3082  aspartate ammonia-lyase  54.43 
 
 
469 aa  488  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0940  aspartate ammonia-lyase  52.81 
 
 
467 aa  482  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0286202  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  53.65 
 
 
467 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2689  aspartate ammonia-lyase  51.2 
 
 
476 aa  471  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0392115  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0479  aspartate ammonia-lyase  54.01 
 
 
463 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4355  aspartate ammonia-lyase  50.22 
 
 
474 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000233495  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1346  aspartate ammonia-lyase  54.37 
 
 
475 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2602  aspartate ammonia-lyase  54.59 
 
 
475 aa  458  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  51.06 
 
 
472 aa  458  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1245  aspartate ammonia-lyase  54.15 
 
 
475 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.431098  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0523  aspartate ammonia-lyase  48.07 
 
 
477 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442808  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03150  aspartate ammonia-lyase  47.84 
 
 
471 aa  449  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000322515  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0526  aspartate ammonia-lyase  48.28 
 
 
477 aa  451  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0181392  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0576  aspartate ammonia-lyase  47.64 
 
 
477 aa  451  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0520  aspartate ammonia-lyase  47.42 
 
 
477 aa  449  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0609  aspartate ammonia-lyase  47.64 
 
 
477 aa  451  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4691  aspartate ammonia-lyase  47.42 
 
 
477 aa  450  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000148862  hitchhiker  1.50426e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0677  aspartate ammonia-lyase  47.42 
 
 
477 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0185443  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0520  aspartate ammonia-lyase  47.42 
 
 
477 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0736  aspartate ammonia-lyase  47.42 
 
 
477 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0153519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0665  aspartate ammonia-lyase  47.42 
 
 
477 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0151100000000002e-47 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0647  aspartate ammonia-lyase  47.21 
 
 
477 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00115494  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  48.72 
 
 
469 aa  442  1e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1258  aspartate ammonia-lyase  53.8 
 
 
481 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.963292  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  50.77 
 
 
459 aa  444  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2667  fumarase  46.15 
 
 
479 aa  443  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.284725  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2119  aspartate ammonia-lyase  52.97 
 
 
466 aa  441  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  49.24 
 
 
468 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  48.29 
 
 
469 aa  437  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  47.53 
 
 
480 aa  436  1e-121  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  49.14 
 
 
475 aa  436  1e-121  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  47.86 
 
 
468 aa  434  1e-120  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1667  aspartate ammonia-lyase  47.4 
 
 
479 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0778255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3530  aspartate ammonia-lyase  47.4 
 
 
479 aa  432  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1800  aspartate ammonia-lyase  47.4 
 
 
479 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1665  aspartate ammonia-lyase  47.19 
 
 
479 aa  434  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1811  aspartate ammonia-lyase  47.4 
 
 
479 aa  432  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1921  aspartate ammonia-lyase  47.4 
 
 
479 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3455  aspartate ammonia-lyase  50.54 
 
 
470 aa  429  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025134  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3115  aspartate ammonia-lyase  46.97 
 
 
476 aa  428  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  51.19 
 
 
463 aa  431  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1643  aspartate ammonia-lyase  47.79 
 
 
474 aa  429  1e-119  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  49.24 
 
 
456 aa  427  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0565  aspartate ammonia-lyase  50.44 
 
 
521 aa  426  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0355315 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0082  aspartate ammonia-lyase  46.68 
 
 
468 aa  422  1e-117  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1872  aspartate ammonia-lyase  47.4 
 
 
479 aa  420  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1649  aspartate ammonia-lyase  47.4 
 
 
479 aa  421  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1614  aspartate ammonia-lyase  47.4 
 
 
479 aa  420  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0122  aspartate ammonia-lyase  46.68 
 
 
468 aa  421  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1905  fumarate lyase  46.93 
 
 
475 aa  421  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0094  aspartate ammonia-lyase  46.46 
 
 
468 aa  419  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1847  aspartate ammonia-lyase  47.4 
 
 
479 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142722 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0193  aspartate ammonia-lyase  47.61 
 
 
463 aa  421  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3135  aspartate ammonia-lyase  46.75 
 
 
476 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2915  aspartate ammonia-lyase  46.75 
 
 
476 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2845  aspartate ammonia-lyase  46.97 
 
 
476 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3158  aspartate ammonia-lyase  46.97 
 
 
476 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3136  aspartate ammonia-lyase  46.75 
 
 
476 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0391  thiamine biosynthesis protein ThiC  44.86 
 
 
466 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0682  aspartate ammonia-lyase  47.2 
 
 
472 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000328745  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2122  aspartate ammonia-lyase  46.97 
 
 
476 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  48.8 
 
 
469 aa  413  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0092  fumarate lyase  44.78 
 
 
472 aa  412  1e-114  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2883  aspartate ammonia-lyase  46.75 
 
 
476 aa  415  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2167  aspartate ammonia-lyase  46.19 
 
 
480 aa  412  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2438  aspartate ammonia-lyase  48.48 
 
 
466 aa  414  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.268607  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1993  aspartate ammonia-lyase  44.88 
 
 
463 aa  411  1e-113  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3758  fumarate lyase  48.59 
 
 
471 aa  408  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2177  aspartate ammonia-lyase  46.72 
 
 
475 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2052  aspartate ammonia-lyase  45.99 
 
 
485 aa  410  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0909745  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  46.7 
 
 
469 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  48.18 
 
 
463 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2008  aspartate ammonia-lyase  45.13 
 
 
468 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2108  fumarate hydratase  47.95 
 
 
459 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.866969  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1299  fumarate lyase  49.44 
 
 
479 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160462  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2083  aspartate ammonia-lyase  46.72 
 
 
475 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195347  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1958  aspartate ammonia-lyase  48.47 
 
 
483 aa  405  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.175554  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1240  aspartate ammonia-lyase  46.58 
 
 
498 aa  402  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0519864  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  46.9 
 
 
463 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1884  aspartate ammonia-lyase  48.47 
 
 
483 aa  404  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218686  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1746  fumarate lyase  46.15 
 
 
469 aa  404  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1293  aspartate ammonia-lyase  47.51 
 
 
468 aa  402  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0277144  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1757  aspartate ammonia-lyase  46.94 
 
 
482 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  47.53 
 
 
465 aa  399  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1741  aspartate ammonia-lyase  43.57 
 
 
475 aa  395  1e-109  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1663  aspartate ammonia-lyase  47.29 
 
 
474 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.201173  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1384  fumarate hydratase  44.85 
 
 
464 aa  395  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3882  fumarate hydratase  49.25 
 
 
463 aa  398  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.475519  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  46.81 
 
 
462 aa  397  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0135  aspartate ammonia-lyase  46.92 
 
 
485 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07330  fumarase  49.25 
 
 
463 aa  395  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.24875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>