More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_07330 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_07330  fumarase  100 
 
 		 463 aa  937    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.24875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  61.79 
 
 		 462 aa  565  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  63.12 
 
 		 463 aa  566  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  62.17 
 
 		 472 aa  566  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  62.75 
 
 		 473 aa  559  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  60.26 
 
 		 463 aa  556  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0935  fumarate lyase  64.92 
 
 		 476 aa  556  1e-157  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  61 
 
 		 464 aa  554  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23010  fumarase  62.8 
 
 		 468 aa  554  1e-156  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  62.66 
 
 		 465 aa  554  1e-156  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  61.4 
 
 		 471 aa  548  1e-155  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  63.16 
 
 		 465 aa  549  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  62.58 
 
 		 464 aa  548  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  61 
 
 		 473 aa  550  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  61.14 
 
 		 465 aa  538  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  61.26 
 
 		 466 aa  536  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  60.43 
 
 		 466 aa  535  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4243  fumarate hydratase  60 
 
 		 466 aa  533  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0560645 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  62.5 
 
 		 464 aa  533  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05170  fumarate hydratase  58.41 
 
 		 473 aa  528  1e-149  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0959  fumarate lyase  62.96 
 
 		 473 aa  530  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  hitchhiker  0.000463461 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4649  fumarate hydratase  59.91 
 
 		 471 aa  529  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456115 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2065  fumarate hydratase  59.39 
 
 		 469 aa  525  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0865781 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11119  fumarate hydratase  59.96 
 
 		 474 aa  524  1e-147  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.954044 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0844  fumarate hydratase  60.13 
 
 		 463 aa  522  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3882  fumarate hydratase  59.26 
 
 		 463 aa  521  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.475519  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3120  fumarate lyase  59.83 
 
 		 472 aa  518  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000941956  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  60.57 
 
 		 471 aa  520  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  59.78 
 
 		 472 aa  514  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4353  fumarate hydratase  59.69 
 
 		 473 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121763  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4122  fumarate hydratase  59.91 
 
 		 473 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264623  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4197  fumarate hydratase  59.91 
 
 		 473 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309456  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  56.47 
 
 		 473 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0720  fumarate hydratase  61.79 
 
 		 464 aa  501  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  55.58 
 
 		 475 aa  485  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  55.58 
 
 		 468 aa  482  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  54.86 
 
 		 467 aa  476  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  53.45 
 
 		 472 aa  476  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  55.75 
 
 		 456 aa  472  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  57.27 
 
 		 463 aa  474  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  52.72 
 
 		 459 aa  469  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  53.15 
 
 		 480 aa  469  1.0000000000000001e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  53.58 
 
 		 468 aa  466  9.999999999999999e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  52.53 
 
 		 469 aa  467  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  54.45 
 
 		 469 aa  468  9.999999999999999e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  52.64 
 
 		 475 aa  466  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  53.45 
 
 		 469 aa  465  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  54.05 
 
 		 469 aa  462  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  55.43 
 
 		 465 aa  462  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1786  fumarate lyase  58.78 
 
 		 463 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.263641  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  52.08 
 
 		 475 aa  456  1e-127  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5854  fumarate lyase  53.9 
 
 		 440 aa  450  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  50.88 
 
 		 469 aa  447  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  51.11 
 
 		 469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2108  fumarate hydratase  51.88 
 
 		 459 aa  443  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.866969  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0853  fumarate lyase  47.91 
 
 		 474 aa  439  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104747  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1384  fumarate hydratase  49.45 
 
 		 464 aa  439  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  52.33 
 
 		 462 aa  440  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  51.33 
 
 		 469 aa  437  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  47.15 
 
 		 459 aa  436  1e-121  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1415  fumarate hydratase  48.06 
 
 		 462 aa  435  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.566531  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1650  fumarate hydratase  49.66 
 
 		 462 aa  435  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  49.46 
 
 		 472 aa  436  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3405  fumarate hydratase  50.77 
 
 		 458 aa  438  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1783  fumarate hydratase  47.63 
 
 		 462 aa  431  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1617  fumarate hydratase  47.84 
 
 		 462 aa  434  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1587  fumarate hydratase  47.63 
 
 		 462 aa  432  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  49.25 
 
 		 472 aa  435  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  49.55 
 
 		 460 aa  434  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  47.15 
 
 		 459 aa  433  1e-120  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1637  fumarate hydratase  47.2 
 
 		 462 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.156374  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  49.03 
 
 		 464 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1767  fumarate hydratase  47.2 
 
 		 462 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  49.03 
 
 		 464 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1819  fumarate hydratase  47.41 
 
 		 462 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1738  fumarate hydratase  48.37 
 
 		 456 aa  431  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1441  fumarate lyase  49.45 
 
 		 461 aa  426  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1841  fumarate hydratase  47.2 
 
 		 462 aa  425  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194885  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  49.55 
 
 		 462 aa  427  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1636  fumarate hydratase  47.2 
 
 		 462 aa  425  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0545327  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1895  fumarate hydratase  47.2 
 
 		 462 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0261938  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2151  fumarate hydratase, class II  48.71 
 
 		 467 aa  425  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0733926 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3561  fumarate hydratase  47.41 
 
 		 462 aa  427  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2786  fumarate hydratase, class II  51.69 
 
 		 472 aa  426  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.347801 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  48.79 
 
 		 471 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27180  fumarate hydratase  51.76 
 
 		 458 aa  422  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00136432  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4461  fumarate hydratase, class II  51.76 
 
 		 458 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  48.6 
 
 		 467 aa  422  1e-117  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1177  fumarate hydratase  50 
 
 		 461 aa  422  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.661179  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1939  fumarate hydratase  45.57 
 
 		 461 aa  422  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  48.66 
 
 		 464 aa  423  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2365  fumarate hydratase  49.68 
 
 		 470 aa  424  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  47.52 
 
 		 462 aa  422  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1905  fumarate hydratase  45.57 
 
 		 461 aa  422  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0427155  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  48.66 
 
 		 464 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  48.66 
 
 		 464 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  48.57 
 
 		 465 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  48.66 
 
 		 464 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  47.96 
 
 		 474 aa  419  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0951  fumarate hydratase  51.32 
 
 		 459 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624822  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>