More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_27180 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0944  fumarate hydratase  78.38 
 
 		 459 aa  711    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4461  fumarate hydratase, class II  77.29 
 
 		 458 aa  707    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0951  fumarate hydratase  79.04 
 
 		 459 aa  716    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0849  fumarate hydratase  75.89 
 
 		 448 aa  673    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5084  fumarate hydratase  79.26 
 
 		 458 aa  708    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209589  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3686  fumarate lyase  69.13 
 
 		 463 aa  637    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4271  fumarate hydratase  77.29 
 
 		 458 aa  702    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58030  fumarate hydratase  80.57 
 
 		 458 aa  723    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27180  fumarate hydratase  100 
 
 		 458 aa  931    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00136432  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0984  fumarate hydratase  78.6 
 
 		 459 aa  712    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01603  Fumarase  68.13 
 
 		 457 aa  617  1e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00674477  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4264  fumarate hydratase  71.87 
 
 		 458 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0703  fumarate hydratase  71.43 
 
 		 458 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00794329 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  65.13 
 
 		 469 aa  591  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1177  fumarate hydratase  64.62 
 
 		 461 aa  594  1e-168  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.661179  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2108  fumarate hydratase  65.5 
 
 		 459 aa  585  1e-166  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.866969  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1650  fumarate hydratase  63.32 
 
 		 462 aa  578  1e-164  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  64.4 
 
 		 465 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  66.59 
 
 		 462 aa  576  1.0000000000000001e-163  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0822  fumarate hydratase  65.78 
 
 		 457 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1738  fumarate hydratase  64.41 
 
 		 456 aa  574  1.0000000000000001e-162  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002204  fumarate hydratase class II  62.36 
 
 		 461 aa  563  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00163  fumarate hydratase  62.36 
 
 		 461 aa  555  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1384  fumarate hydratase  58.68 
 
 		 464 aa  553  1e-156  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0068  fumarate lyase  63.41 
 
 		 459 aa  549  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  63.03 
 
 		 456 aa  546  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  60.75 
 
 		 469 aa  535  1e-151  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  60.36 
 
 		 460 aa  534  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  58.79 
 
 		 469 aa  528  1e-149  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  60.93 
 
 		 475 aa  531  1e-149  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  58.95 
 
 		 469 aa  525  1e-148  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3405  fumarate hydratase  57.86 
 
 		 458 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1272  fumarate lyase  59.87 
 
 		 462 aa  491  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1441  fumarate lyase  56.29 
 
 		 461 aa  482  1e-135  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2056  fumarate hydratase  58.72 
 
 		 469 aa  484  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  55.77 
 
 		 463 aa  472  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  54.73 
 
 		 464 aa  464  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  52.28 
 
 		 472 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  53.67 
 
 		 463 aa  457  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0229  fumarate lyase  51.87 
 
 		 457 aa  456  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  54.61 
 
 		 473 aa  449  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  50.54 
 
 		 468 aa  448  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  53.83 
 
 		 463 aa  449  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  51.42 
 
 		 462 aa  449  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  53.71 
 
 		 465 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  51.96 
 
 		 467 aa  444  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  52.71 
 
 		 465 aa  433  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  50.11 
 
 		 459 aa  432  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  54.87 
 
 		 464 aa  431  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  52.09 
 
 		 464 aa  431  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  47.03 
 
 		 459 aa  422  1e-117  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  51.22 
 
 		 472 aa  424  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  50.89 
 
 		 473 aa  424  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4243  fumarate hydratase  51.75 
 
 		 466 aa  418  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0560645 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  48.8 
 
 		 471 aa  419  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  48.14 
 
 		 469 aa  420  1e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3882  fumarate hydratase  53.58 
 
 		 463 aa  419  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.475519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  51.87 
 
 		 472 aa  419  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  51.75 
 
 		 465 aa  420  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  46.81 
 
 		 459 aa  418  1e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1415  fumarate hydratase  46.59 
 
 		 462 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.566531  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  49.67 
 
 		 469 aa  415  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  47.38 
 
 		 475 aa  415  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  46.37 
 
 		 464 aa  415  1e-114  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0935  fumarate lyase  52.31 
 
 		 476 aa  415  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  47.91 
 
 		 472 aa  413  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  47.91 
 
 		 472 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  50.87 
 
 		 466 aa  410  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  45.41 
 
 		 471 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11119  fumarate hydratase  51.66 
 
 		 474 aa  410  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.954044 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07330  fumarase  51.76 
 
 		 463 aa  410  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.24875 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  49.67 
 
 		 469 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1120  fumarate hydratase  47.14 
 
 		 456 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4521  fumarate hydratase, class II  47.91 
 
 		 469 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0844  fumarate hydratase  52.19 
 
 		 463 aa  408  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1617  fumarate hydratase  45.71 
 
 		 462 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  50.77 
 
 		 471 aa  405  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  50.33 
 
 		 466 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  50.65 
 
 		 473 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1819  fumarate hydratase  45.49 
 
 		 462 aa  405  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1637  fumarate hydratase  45.27 
 
 		 462 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.156374  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1587  fumarate hydratase  45.27 
 
 		 462 aa  403  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1895  fumarate hydratase  45.05 
 
 		 462 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0261938  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0959  fumarate lyase  52.33 
 
 		 473 aa  405  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  hitchhiker  0.000463461 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2786  fumarate hydratase, class II  48.35 
 
 		 472 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.347801 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1767  fumarate hydratase  45.27 
 
 		 462 aa  402  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05170  fumarate hydratase  49.35 
 
 		 473 aa  404  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  46.37 
 
 		 461 aa  404  1e-111  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0720  fumarate hydratase  52.89 
 
 		 464 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  49.01 
 
 		 469 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 475 aa  402  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1783  fumarate hydratase  45.27 
 
 		 462 aa  402  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1786  fumarate lyase  50.11 
 
 		 463 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.263641  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1841  fumarate hydratase  45.05 
 
 		 462 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194885  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  46.37 
 
 		 464 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  46.37 
 
 		 464 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  45.71 
 
 		 461 aa  400  9.999999999999999e-111  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  46.37 
 
 		 464 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  46.37 
 
 		 464 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  46.37 
 
 		 464 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>