More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1650 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1650  fumarate hydratase  100 
 
 		 462 aa  941    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00163  fumarate hydratase  64.71 
 
 		 461 aa  585  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1177  fumarate hydratase  64.77 
 
 		 461 aa  586  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.661179  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4461  fumarate hydratase, class II  65.36 
 
 		 458 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002204  fumarate hydratase class II  64.05 
 
 		 461 aa  582  1.0000000000000001e-165  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1738  fumarate hydratase  63.32 
 
 		 456 aa  580  1e-164  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  62.17 
 
 		 469 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4271  fumarate hydratase  65.5 
 
 		 458 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0951  fumarate hydratase  65.07 
 
 		 459 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0984  fumarate hydratase  64.41 
 
 		 459 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0944  fumarate hydratase  64.41 
 
 		 459 aa  571  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0849  fumarate hydratase  65.85 
 
 		 448 aa  570  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27180  fumarate hydratase  63.32 
 
 		 458 aa  567  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00136432  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  61.9 
 
 		 462 aa  566  1e-160  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2108  fumarate hydratase  61.57 
 
 		 459 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.866969  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  60.43 
 
 		 465 aa  558  1e-158  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5084  fumarate hydratase  62.66 
 
 		 458 aa  557  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209589  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0822  fumarate hydratase  62.75 
 
 		 457 aa  555  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58030  fumarate hydratase  62.01 
 
 		 458 aa  554  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  62.2 
 
 		 456 aa  550  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3686  fumarate lyase  60.39 
 
 		 463 aa  547  1e-154  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4264  fumarate hydratase  62.72 
 
 		 458 aa  541  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01603  Fumarase  59.43 
 
 		 457 aa  542  1e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00674477  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0703  fumarate hydratase  63.08 
 
 		 458 aa  534  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00794329 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1384  fumarate hydratase  56.99 
 
 		 464 aa  531  1e-149  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  56.24 
 
 		 469 aa  527  1e-148  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  56.07 
 
 		 469 aa  522  1e-147  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  55.9 
 
 		 469 aa  522  1e-147  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  59.24 
 
 		 460 aa  524  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3405  fumarate hydratase  56.33 
 
 		 458 aa  521  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  56.83 
 
 		 475 aa  509  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1441  fumarate lyase  55.99 
 
 		 461 aa  504  1e-141  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1272  fumarate lyase  58.55 
 
 		 462 aa  498  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0068  fumarate lyase  56.07 
 
 		 459 aa  484  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2056  fumarate hydratase  56.88 
 
 		 469 aa  480  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  52.26 
 
 		 472 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  52.17 
 
 		 463 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0229  fumarate lyase  53.49 
 
 		 457 aa  455  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  50.66 
 
 		 473 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  51.97 
 
 		 463 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  51.63 
 
 		 464 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  50.43 
 
 		 467 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  51.91 
 
 		 471 aa  436  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  50 
 
 		 463 aa  437  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  48.58 
 
 		 462 aa  432  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  54.25 
 
 		 465 aa  435  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  52.7 
 
 		 473 aa  433  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  48.81 
 
 		 468 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  50.91 
 
 		 459 aa  434  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  49.24 
 
 		 465 aa  431  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  47.82 
 
 		 469 aa  429  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  51.2 
 
 		 465 aa  429  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  52.47 
 
 		 464 aa  425  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  49.25 
 
 		 475 aa  426  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  50.48 
 
 		 473 aa  422  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  50.65 
 
 		 466 aa  420  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  51.46 
 
 		 471 aa  419  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05170  fumarate hydratase  52.24 
 
 		 473 aa  421  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0935  fumarate lyase  49.46 
 
 		 476 aa  419  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4649  fumarate hydratase  51.47 
 
 		 471 aa  420  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456115 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  46.2 
 
 		 469 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11119  fumarate hydratase  51.02 
 
 		 474 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.954044 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0959  fumarate lyase  52.72 
 
 		 473 aa  417  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  hitchhiker  0.000463461 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  50.11 
 
 		 472 aa  416  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  51.1 
 
 		 472 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2065  fumarate hydratase  50.91 
 
 		 469 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0865781 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  48.47 
 
 		 464 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 466 aa  412  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23010  fumarase  49.46 
 
 		 468 aa  413  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  45.91 
 
 		 469 aa  413  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  48.18 
 
 		 474 aa  412  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  44.69 
 
 		 480 aa  411  1e-113  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07330  fumarase  49.66 
 
 		 463 aa  409  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.24875 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4353  fumarate hydratase  50.23 
 
 		 473 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121763  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4243  fumarate hydratase  49.77 
 
 		 466 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0560645 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3882  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 463 aa  409  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.475519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4122  fumarate hydratase  50.23 
 
 		 473 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264623  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  45.32 
 
 		 468 aa  411  1e-113  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  48.71 
 
 		 466 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0720  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 464 aa  409  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4197  fumarate hydratase  50.23 
 
 		 473 aa  411  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309456  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  46.37 
 
 		 464 aa  408  1.0000000000000001e-112  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0844  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 463 aa  408  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  46.68 
 
 		 461 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  47.78 
 
 		 461 aa  404  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  47.78 
 
 		 461 aa  403  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1415  fumarate hydratase  45.61 
 
 		 462 aa  405  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.566531  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  50 
 
 		 469 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1819  fumarate hydratase  44.96 
 
 		 462 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  45.53 
 
 		 463 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1617  fumarate hydratase  44.74 
 
 		 462 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1587  fumarate hydratase  44.74 
 
 		 462 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3120  fumarate lyase  51.54 
 
 		 472 aa  400  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000941956  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  46.46 
 
 		 467 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  48.24 
 
 		 463 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2270  fumarate hydratase  47.8 
 
 		 465 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1873  fumarate hydratase  47.8 
 
 		 465 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0104019  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  45.61 
 
 		 459 aa  400  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  45.51 
 
 		 462 aa  401  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  48.71 
 
 		 631 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>