More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0849 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0944  fumarate hydratase  82.14 
 
 		 459 aa  733    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4461  fumarate hydratase, class II  86.38 
 
 		 458 aa  756    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5084  fumarate hydratase  76.79 
 
 		 458 aa  682    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209589  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0849  fumarate hydratase  100 
 
 		 448 aa  904    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27180  fumarate hydratase  75.89 
 
 		 458 aa  672    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00136432  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0984  fumarate hydratase  81.7 
 
 		 459 aa  730    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0951  fumarate hydratase  83.04 
 
 		 459 aa  737    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4271  fumarate hydratase  82.81 
 
 		 458 aa  734    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58030  fumarate hydratase  76.34 
 
 		 458 aa  677    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3686  fumarate lyase  69.82 
 
 		 463 aa  626  1e-178  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01603  Fumarase  66.52 
 
 		 457 aa  604  9.999999999999999e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00674477  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4264  fumarate hydratase  72.83 
 
 		 458 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0703  fumarate hydratase  71.05 
 
 		 458 aa  598  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00794329 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1650  fumarate hydratase  65.85 
 
 		 462 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  64.29 
 
 		 469 aa  580  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  65.62 
 
 		 462 aa  570  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1177  fumarate hydratase  62.72 
 
 		 461 aa  567  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.661179  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002204  fumarate hydratase class II  64.29 
 
 		 461 aa  565  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  62.72 
 
 		 465 aa  560  1e-158  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0822  fumarate hydratase  64.49 
 
 		 457 aa  561  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2108  fumarate hydratase  62.72 
 
 		 459 aa  557  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.866969  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00163  fumarate hydratase  63.39 
 
 		 461 aa  553  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  64.79 
 
 		 456 aa  549  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1738  fumarate hydratase  62.95 
 
 		 456 aa  550  1e-155  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  61.04 
 
 		 469 aa  541  9.999999999999999e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0068  fumarate lyase  62.14 
 
 		 459 aa  533  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  60.63 
 
 		 475 aa  534  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1384  fumarate hydratase  57.94 
 
 		 464 aa  521  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  58.48 
 
 		 469 aa  519  1e-146  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  58.11 
 
 		 469 aa  511  1e-144  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  58.92 
 
 		 460 aa  508  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3405  fumarate hydratase  56.92 
 
 		 458 aa  489  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1272  fumarate lyase  58.54 
 
 		 462 aa  487  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2056  fumarate hydratase  58.24 
 
 		 469 aa  487  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1441  fumarate lyase  56.47 
 
 		 461 aa  464  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  52.7 
 
 		 463 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0229  fumarate lyase  52.95 
 
 		 457 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  52.95 
 
 		 464 aa  443  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  51.21 
 
 		 472 aa  436  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  50 
 
 		 463 aa  431  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  52.11 
 
 		 465 aa  429  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  53.44 
 
 		 465 aa  428  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  48.78 
 
 		 462 aa  426  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  53 
 
 		 473 aa  426  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  50.9 
 
 		 472 aa  422  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  50.23 
 
 		 473 aa  422  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  50.11 
 
 		 467 aa  423  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  50.78 
 
 		 463 aa  422  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  51.45 
 
 		 465 aa  422  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  47.9 
 
 		 468 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  46.34 
 
 		 459 aa  417  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  48.42 
 
 		 459 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  49.11 
 
 		 469 aa  416  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  46.12 
 
 		 459 aa  413  1e-114  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  52.03 
 
 		 464 aa  411  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  52.01 
 
 		 466 aa  411  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  52.26 
 
 		 475 aa  406  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05170  fumarate hydratase  50 
 
 		 473 aa  405  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  49 
 
 		 464 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  46.1 
 
 		 464 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0720  fumarate hydratase  53.95 
 
 		 464 aa  405  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  47.66 
 
 		 471 aa  402  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  46.1 
 
 		 464 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  49.34 
 
 		 473 aa  402  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  50.9 
 
 		 472 aa  404  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 466 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07330  fumarase  50.68 
 
 		 463 aa  399  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.24875 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1415  fumarate hydratase  45.33 
 
 		 462 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.566531  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1587  fumarate hydratase  44.89 
 
 		 462 aa  395  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0935  fumarate lyase  49.67 
 
 		 476 aa  398  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  44.77 
 
 		 471 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1895  fumarate hydratase  44.89 
 
 		 462 aa  396  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0261938  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4243  fumarate hydratase  49 
 
 		 466 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0560645 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1841  fumarate hydratase  44.67 
 
 		 462 aa  392  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194885  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1637  fumarate hydratase  44.89 
 
 		 462 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.156374  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1617  fumarate hydratase  44.67 
 
 		 462 aa  394  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23010  fumarase  48.89 
 
 		 468 aa  394  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1819  fumarate hydratase  44.89 
 
 		 462 aa  395  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2065  fumarate hydratase  49.55 
 
 		 469 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0865781 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1767  fumarate hydratase  44.89 
 
 		 462 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1783  fumarate hydratase  44.44 
 
 		 462 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3882  fumarate hydratase  49.54 
 
 		 463 aa  393  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.475519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  46.33 
 
 		 465 aa  392  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  46.1 
 
 		 465 aa  392  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  46.1 
 
 		 469 aa  394  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01580  fumarate hydratase  46.33 
 
 		 467 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1636  fumarate hydratase  44.22 
 
 		 462 aa  391  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0545327  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  44.99 
 
 		 468 aa  390  1e-107  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4649  fumarate hydratase  50 
 
 		 471 aa  389  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456115 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  46.1 
 
 		 467 aa  390  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2270  fumarate hydratase  46.33 
 
 		 465 aa  390  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  46.33 
 
 		 467 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1873  fumarate hydratase  46.33 
 
 		 465 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0104019  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  49.22 
 
 		 471 aa  389  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01570  hypothetical protein  46.33 
 
 		 467 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24852  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3561  fumarate hydratase  44.44 
 
 		 462 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0959  fumarate lyase  50.23 
 
 		 473 aa  389  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  hitchhiker  0.000463461 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  46.55 
 
 		 470 aa  386  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  46.1 
 
 		 631 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  44.57 
 
 		 472 aa  385  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>