More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1272 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1272  fumarate lyase  100 
 
 		 462 aa  919    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2108  fumarate hydratase  64.44 
 
 		 459 aa  560  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.866969  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  65.27 
 
 		 465 aa  555  1e-157  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  64.18 
 
 		 456 aa  548  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  62.72 
 
 		 462 aa  535  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  57.78 
 
 		 460 aa  530  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1384  fumarate hydratase  57.33 
 
 		 464 aa  523  1e-147  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  60.26 
 
 		 475 aa  520  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1650  fumarate hydratase  58.55 
 
 		 462 aa  521  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3405  fumarate hydratase  60.13 
 
 		 458 aa  520  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  61.62 
 
 		 469 aa  514  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4461  fumarate hydratase, class II  59.61 
 
 		 458 aa  511  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  59.33 
 
 		 469 aa  514  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01603  Fumarase  58.81 
 
 		 457 aa  508  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00674477  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1738  fumarate hydratase  59.24 
 
 		 456 aa  508  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  57.77 
 
 		 469 aa  503  1e-141  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1177  fumarate hydratase  58.22 
 
 		 461 aa  503  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.661179  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1441  fumarate lyase  57.6 
 
 		 461 aa  499  1e-140  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  57.55 
 
 		 469 aa  500  1e-140  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0944  fumarate hydratase  60.26 
 
 		 459 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27180  fumarate hydratase  59.87 
 
 		 458 aa  497  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00136432  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0984  fumarate hydratase  60.48 
 
 		 459 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3686  fumarate lyase  57.68 
 
 		 463 aa  494  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5084  fumarate hydratase  60.27 
 
 		 458 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209589  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0951  fumarate hydratase  60.26 
 
 		 459 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0849  fumarate hydratase  58.54 
 
 		 448 aa  489  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58030  fumarate hydratase  59.87 
 
 		 458 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4271  fumarate hydratase  59.83 
 
 		 458 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002204  fumarate hydratase class II  58.04 
 
 		 461 aa  486  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00163  fumarate hydratase  57.33 
 
 		 461 aa  482  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4264  fumarate hydratase  58.24 
 
 		 458 aa  475  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0822  fumarate hydratase  57.24 
 
 		 457 aa  475  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0703  fumarate hydratase  58.02 
 
 		 458 aa  473  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00794329 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2056  fumarate hydratase  56.88 
 
 		 469 aa  464  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  54.03 
 
 		 463 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  52.99 
 
 		 466 aa  444  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  52.27 
 
 		 463 aa  444  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  53.07 
 
 		 465 aa  442  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  51.32 
 
 		 471 aa  440  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  51.59 
 
 		 462 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  52.95 
 
 		 473 aa  437  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  54.26 
 
 		 465 aa  437  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0068  fumarate lyase  53.69 
 
 		 459 aa  436  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  53.64 
 
 		 472 aa  432  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  50.87 
 
 		 473 aa  433  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4649  fumarate hydratase  51.83 
 
 		 471 aa  430  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456115 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2065  fumarate hydratase  51.62 
 
 		 469 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0865781 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4353  fumarate hydratase  53.44 
 
 		 473 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121763  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3120  fumarate lyase  53.7 
 
 		 472 aa  426  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000941956  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4122  fumarate hydratase  53.44 
 
 		 473 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264623  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  53.07 
 
 		 465 aa  427  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11119  fumarate hydratase  54.17 
 
 		 474 aa  427  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.954044 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4197  fumarate hydratase  53.44 
 
 		 473 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309456  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05170  fumarate hydratase  50.54 
 
 		 473 aa  425  1e-118  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  48.91 
 
 		 461 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23010  fumarase  50.87 
 
 		 468 aa  421  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  48.91 
 
 		 461 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  48.79 
 
 		 469 aa  421  1e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  48.13 
 
 		 468 aa  419  1e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  47.6 
 
 		 471 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  50 
 
 		 464 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0935  fumarate lyase  51.62 
 
 		 476 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  48.2 
 
 		 472 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  48.7 
 
 		 475 aa  415  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0229  fumarate lyase  48.45 
 
 		 457 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  50.43 
 
 		 473 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  48.89 
 
 		 459 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0083  fumarate hydratase  49.03 
 
 		 466 aa  413  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  53.07 
 
 		 464 aa  412  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  48.47 
 
 		 461 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2019  fumarate hydratase  46.75 
 
 		 467 aa  412  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  46.75 
 
 		 467 aa  412  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  48.48 
 
 		 469 aa  414  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  46.97 
 
 		 467 aa  412  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01580  fumarate hydratase  46.75 
 
 		 467 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  46.75 
 
 		 467 aa  409  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1589  fumarate hydratase  46.87 
 
 		 467 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.194502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  47.6 
 
 		 463 aa  409  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01570  hypothetical protein  46.75 
 
 		 467 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24852  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  52.09 
 
 		 475 aa  411  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2320  fumarate hydratase  46.75 
 
 		 467 aa  410  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  50.98 
 
 		 471 aa  408  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0959  fumarate lyase  53.26 
 
 		 473 aa  411  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  hitchhiker  0.000463461 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  47.03 
 
 		 480 aa  408  1e-113  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1796  fumarate hydratase  46.75 
 
 		 467 aa  410  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.114122  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  50.44 
 
 		 464 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  46.51 
 
 		 464 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1637  fumarate hydratase  46.07 
 
 		 462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.156374  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1617  fumarate hydratase  45.85 
 
 		 462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1587  fumarate hydratase  45.85 
 
 		 462 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  46.97 
 
 		 467 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1767  fumarate hydratase  46.07 
 
 		 462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  46.97 
 
 		 467 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  46.29 
 
 		 464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  51.22 
 
 		 466 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  46.97 
 
 		 465 aa  406  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  46.97 
 
 		 467 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4243  fumarate hydratase  50 
 
 		 466 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0560645 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  46.97 
 
 		 467 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  48.47 
 
 		 461 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>