More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3120 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  86.15 
 
 		 466 aa  772    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2065  fumarate hydratase  83.41 
 
 		 469 aa  747    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0865781 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4353  fumarate hydratase  82.9 
 
 		 473 aa  727    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121763  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11119  fumarate hydratase  83.62 
 
 		 474 aa  754    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.954044 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4122  fumarate hydratase  82.68 
 
 		 473 aa  726    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264623  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3120  fumarate lyase  100 
 
 		 472 aa  955    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000941956  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4197  fumarate hydratase  82.68 
 
 		 473 aa  726    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309456  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4649  fumarate hydratase  82.97 
 
 		 471 aa  744    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456115 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  65.58 
 
 		 462 aa  605  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  65.14 
 
 		 463 aa  598  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  65.07 
 
 		 464 aa  592  1e-168  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  65.87 
 
 		 473 aa  592  1e-168  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23010  fumarase  63.07 
 
 		 468 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  63.62 
 
 		 472 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  63.46 
 
 		 463 aa  569  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  64.5 
 
 		 465 aa  569  1e-161  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  63.64 
 
 		 473 aa  570  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  63.46 
 
 		 464 aa  562  1.0000000000000001e-159  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0959  fumarate lyase  64.88 
 
 		 473 aa  560  1e-158  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  hitchhiker  0.000463461 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  62.36 
 
 		 471 aa  560  1e-158  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  64.01 
 
 		 475 aa  558  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0935  fumarate lyase  64.99 
 
 		 476 aa  557  1e-157  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  63.42 
 
 		 473 aa  550  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  63.85 
 
 		 471 aa  546  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  63.7 
 
 		 464 aa  545  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05170  fumarate hydratase  60.78 
 
 		 473 aa  544  1e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  63.16 
 
 		 472 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3882  fumarate hydratase  62.75 
 
 		 463 aa  537  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.475519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  61.79 
 
 		 465 aa  533  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  60.7 
 
 		 466 aa  528  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4243  fumarate hydratase  61.05 
 
 		 466 aa  530  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0560645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0844  fumarate hydratase  63.18 
 
 		 463 aa  528  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0720  fumarate hydratase  63.99 
 
 		 464 aa  527  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  61.44 
 
 		 465 aa  526  1e-148  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07330  fumarase  59.83 
 
 		 463 aa  507  9.999999999999999e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.24875 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  53.88 
 
 		 469 aa  477  1e-133  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  53.8 
 
 		 475 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  55.12 
 
 		 465 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  53.68 
 
 		 480 aa  470  1.0000000000000001e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  56.11 
 
 		 459 aa  468  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  53.8 
 
 		 469 aa  462  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  53.15 
 
 		 468 aa  464  1e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  54.61 
 
 		 464 aa  455  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  55.43 
 
 		 462 aa  456  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  55.26 
 
 		 456 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1786  fumarate lyase  57.01 
 
 		 463 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.263641  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  54.38 
 
 		 464 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  54.16 
 
 		 464 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  54.38 
 
 		 464 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  54.38 
 
 		 464 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  52.39 
 
 		 467 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  54.38 
 
 		 464 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  54.38 
 
 		 464 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  53.12 
 
 		 474 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  54.38 
 
 		 631 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  52.26 
 
 		 462 aa  451  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  53.3 
 
 		 475 aa  449  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  54.25 
 
 		 469 aa  449  1e-125  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  54.01 
 
 		 469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5854  fumarate lyase  53.65 
 
 		 440 aa  447  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  51.75 
 
 		 464 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  52.43 
 
 		 469 aa  448  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  52.64 
 
 		 469 aa  442  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  51.43 
 
 		 465 aa  444  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  51.31 
 
 		 464 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  51.85 
 
 		 472 aa  444  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1384  fumarate hydratase  50.78 
 
 		 464 aa  440  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  51.81 
 
 		 461 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  51.81 
 
 		 461 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  52.71 
 
 		 461 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  52.48 
 
 		 463 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  50.57 
 
 		 464 aa  437  1e-121  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  49.35 
 
 		 471 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  51.84 
 
 		 469 aa  436  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  49.55 
 
 		 460 aa  436  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3367  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 463 aa  437  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.328502  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  51.58 
 
 		 461 aa  434  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1415  fumarate hydratase  49.24 
 
 		 462 aa  434  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.566531  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0812  fumarate hydratase  51.53 
 
 		 464 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09838  FumC  49.57 
 
 		 465 aa  434  1e-120  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  52.81 
 
 		 463 aa  432  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  50.55 
 
 		 468 aa  433  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  52.27 
 
 		 463 aa  434  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  52.36 
 
 		 464 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  49.45 
 
 		 464 aa  433  1e-120  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  53.03 
 
 		 463 aa  434  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1841  fumarate hydratase  48.37 
 
 		 462 aa  429  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194885  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0853  fumarate lyase  49.58 
 
 		 474 aa  429  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104747  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1617  fumarate hydratase  48.59 
 
 		 462 aa  428  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2694  fumarate hydratase, class II  49.13 
 
 		 466 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.650126  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1576  fumarate hydratase  49.77 
 
 		 482 aa  431  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0866386  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  51.91 
 
 		 464 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  48.79 
 
 		 461 aa  428  1e-119  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0160  fumarate hydratase, class II  51.91 
 
 		 465 aa  430  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  50 
 
 		 465 aa  429  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  51.91 
 
 		 464 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  51.69 
 
 		 464 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  51.91 
 
 		 464 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  51 
 
 		 465 aa  429  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  50.67 
 
 		 472 aa  429  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>