More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1786 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1786  fumarate lyase  100 
 
 		 463 aa  923    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.263641  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  60.39 
 
 		 463 aa  534  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  60.87 
 
 		 464 aa  530  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  58.11 
 
 		 463 aa  519  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  59.52 
 
 		 472 aa  519  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  57.05 
 
 		 462 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  59 
 
 		 464 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  60.52 
 
 		 472 aa  514  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  60.13 
 
 		 465 aa  513  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  62.06 
 
 		 464 aa  509  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  58.86 
 
 		 473 aa  506  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  59.08 
 
 		 465 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  58.33 
 
 		 471 aa  504  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3882  fumarate hydratase  59.52 
 
 		 463 aa  503  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.475519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  57.99 
 
 		 473 aa  499  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0935  fumarate lyase  60.39 
 
 		 476 aa  499  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0844  fumarate hydratase  60.17 
 
 		 463 aa  495  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4243  fumarate hydratase  57.89 
 
 		 466 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0560645 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  58.99 
 
 		 471 aa  488  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  57.46 
 
 		 466 aa  483  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  56.62 
 
 		 465 aa  484  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  54.88 
 
 		 468 aa  483  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07330  fumarase  57.36 
 
 		 463 aa  484  1e-135  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.24875 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23010  fumarase  57.89 
 
 		 468 aa  483  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11119  fumarate hydratase  57.27 
 
 		 474 aa  484  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.954044 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0959  fumarate lyase  59.74 
 
 		 473 aa  479  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  hitchhiker  0.000463461 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05170  fumarate hydratase  54.41 
 
 		 473 aa  477  1e-133  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  55.7 
 
 		 467 aa  477  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  55.58 
 
 		 473 aa  476  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  54.6 
 
 		 475 aa  472  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4649  fumarate hydratase  55.36 
 
 		 471 aa  472  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456115 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2065  fumarate hydratase  54.7 
 
 		 469 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0865781 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4353  fumarate hydratase  56.89 
 
 		 473 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121763  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  54.59 
 
 		 466 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4122  fumarate hydratase  56.89 
 
 		 473 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264623  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3120  fumarate lyase  55.6 
 
 		 472 aa  469  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000941956  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4197  fumarate hydratase  56.89 
 
 		 473 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309456  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  51.73 
 
 		 480 aa  462  1e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  53.78 
 
 		 475 aa  460  9.999999999999999e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  53.25 
 
 		 469 aa  459  9.999999999999999e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  51.3 
 
 		 468 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0720  fumarate hydratase  58.39 
 
 		 464 aa  453  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  53.63 
 
 		 465 aa  449  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  51.07 
 
 		 472 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  52.62 
 
 		 469 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  51.85 
 
 		 469 aa  443  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  50.97 
 
 		 469 aa  444  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  55.23 
 
 		 456 aa  442  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  52.32 
 
 		 459 aa  444  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  51.52 
 
 		 472 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  51.63 
 
 		 475 aa  435  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0853  fumarate lyase  47.46 
 
 		 474 aa  437  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104747  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  50.98 
 
 		 464 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  51.65 
 
 		 472 aa  438  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  51.43 
 
 		 464 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  51.43 
 
 		 464 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  51.43 
 
 		 464 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  51.66 
 
 		 631 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 469 aa  434  1e-120  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  51.43 
 
 		 464 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  51.43 
 
 		 464 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  53.07 
 
 		 462 aa  434  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  51.21 
 
 		 464 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  50.11 
 
 		 469 aa  429  1e-119  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2786  fumarate hydratase, class II  51.88 
 
 		 472 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.347801 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  53.1 
 
 		 469 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2108  fumarate hydratase  52.46 
 
 		 459 aa  429  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.866969  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  50.33 
 
 		 466 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  48.11 
 
 		 463 aa  427  1e-118  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4521  fumarate hydratase, class II  50.88 
 
 		 469 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3242  fumarate hydratase, class II  49.02 
 
 		 465 aa  425  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  52.65 
 
 		 469 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  49.67 
 
 		 461 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  49.22 
 
 		 463 aa  422  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5854  fumarate lyase  52.75 
 
 		 440 aa  423  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  50.11 
 
 		 464 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  47.54 
 
 		 460 aa  422  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 464 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  51.47 
 
 		 463 aa  424  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 464 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  49.67 
 
 		 461 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 464 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 464 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1819  fumarate hydratase  48.79 
 
 		 462 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  49.67 
 
 		 461 aa  418  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  49.45 
 
 		 464 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  49.45 
 
 		 474 aa  419  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  48.67 
 
 		 462 aa  418  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0283  fumarate hydratase, class II  50 
 
 		 468 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136542 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1841  fumarate hydratase  48.13 
 
 		 462 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194885  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1617  fumarate hydratase  48.35 
 
 		 462 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1587  fumarate hydratase  48.35 
 
 		 462 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  47.9 
 
 		 510 aa  417  9.999999999999999e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1007  fumarate hydratase  49.12 
 
 		 463 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0281395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1415  fumarate hydratase  47.91 
 
 		 462 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.566531  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27180  fumarate hydratase  50.11 
 
 		 458 aa  415  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00136432  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  48.16 
 
 		 465 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1905  fumarate hydratase  47.1 
 
 		 461 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0427155  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46735  predicted protein  49.01 
 
 		 458 aa  416  9.999999999999999e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.344273  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1939  fumarate hydratase  47.1 
 
 		 461 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>