More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0935 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0959  fumarate lyase  88.53 
 
 		 473 aa  775    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  hitchhiker  0.000463461 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05170  fumarate hydratase  74.25 
 
 		 473 aa  675    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23010  fumarase  79.26 
 
 		 468 aa  719    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  71.33 
 
 		 463 aa  676    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  87.23 
 
 		 473 aa  813    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  75.93 
 
 		 462 aa  701    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  84.03 
 
 		 471 aa  778    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  75.75 
 
 		 475 aa  690    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  72.55 
 
 		 472 aa  656    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  73.59 
 
 		 465 aa  667    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  79.3 
 
 		 471 aa  702    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  69.05 
 
 		 464 aa  639    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  71.43 
 
 		 464 aa  644    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  71.9 
 
 		 473 aa  648    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  76.13 
 
 		 473 aa  713    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0935  fumarate lyase  100 
 
 		 476 aa  954    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  71.61 
 
 		 465 aa  651    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  69.41 
 
 		 463 aa  640    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3882  fumarate hydratase  70.72 
 
 		 463 aa  629  1e-179  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.475519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4243  fumarate hydratase  68.71 
 
 		 466 aa  621  1e-177  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0560645 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  68.78 
 
 		 466 aa  623  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  71.68 
 
 		 464 aa  620  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  69.48 
 
 		 472 aa  618  1e-176  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  68.04 
 
 		 465 aa  615  1e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0844  fumarate hydratase  70.28 
 
 		 463 aa  612  9.999999999999999e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  65.36 
 
 		 466 aa  580  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3120  fumarate lyase  64.99 
 
 		 472 aa  558  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000941956  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11119  fumarate hydratase  62.93 
 
 		 474 aa  553  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.954044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2065  fumarate hydratase  62.75 
 
 		 469 aa  548  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0865781 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07330  fumarase  64.92 
 
 		 463 aa  551  1e-155  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.24875 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4649  fumarate hydratase  62.58 
 
 		 471 aa  548  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456115 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0720  fumarate hydratase  65.72 
 
 		 464 aa  546  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4353  fumarate hydratase  62.58 
 
 		 473 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121763  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4122  fumarate hydratase  62.37 
 
 		 473 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264623  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4197  fumarate hydratase  62.37 
 
 		 473 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309456  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1786  fumarate lyase  60.18 
 
 		 463 aa  487  1e-136  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.263641  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  57.11 
 
 		 465 aa  486  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  58.59 
 
 		 456 aa  484  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  54.43 
 
 		 469 aa  476  1e-133  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  53.68 
 
 		 475 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  53.13 
 
 		 480 aa  471  1.0000000000000001e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  54.08 
 
 		 467 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  55.36 
 
 		 462 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  54.87 
 
 		 469 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  52.94 
 
 		 469 aa  464  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  52.59 
 
 		 472 aa  464  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  54.31 
 
 		 469 aa  463  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  53.92 
 
 		 469 aa  462  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  53.25 
 
 		 468 aa  464  1e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  51.73 
 
 		 469 aa  461  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  54.03 
 
 		 475 aa  461  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  52.76 
 
 		 461 aa  457  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5854  fumarate lyase  55.88 
 
 		 440 aa  456  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  53.03 
 
 		 469 aa  456  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  52.54 
 
 		 461 aa  458  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  52.54 
 
 		 461 aa  458  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  50.11 
 
 		 460 aa  453  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  52.38 
 
 		 468 aa  450  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  53.32 
 
 		 464 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  53.32 
 
 		 464 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  53.32 
 
 		 464 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  53.32 
 
 		 464 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  52.88 
 
 		 464 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  53.32 
 
 		 464 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  53.32 
 
 		 464 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  53.29 
 
 		 459 aa  448  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  53.54 
 
 		 631 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  54.94 
 
 		 463 aa  443  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1650  fumarate hydratase  49.46 
 
 		 462 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  50.97 
 
 		 462 aa  436  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  51.01 
 
 		 464 aa  436  1e-121  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  50.64 
 
 		 470 aa  437  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  49.79 
 
 		 465 aa  437  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  51.43 
 
 		 463 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1738  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 456 aa  436  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0244  fumarate hydratase  49.22 
 
 		 463 aa  432  1e-120  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1177  fumarate hydratase  50.76 
 
 		 461 aa  432  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.661179  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  52.13 
 
 		 472 aa  432  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  52.37 
 
 		 472 aa  432  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0853  fumarate lyase  49.16 
 
 		 474 aa  434  1e-120  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104747  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1384  fumarate hydratase  49.33 
 
 		 464 aa  433  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  51.88 
 
 		 464 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  50.89 
 
 		 463 aa  432  1e-120  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3405  fumarate hydratase  50.87 
 
 		 458 aa  433  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  51.21 
 
 		 464 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  46.42 
 
 		 459 aa  429  1e-119  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  49.43 
 
 		 471 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00163  fumarate hydratase  53.3 
 
 		 461 aa  431  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  52.43 
 
 		 463 aa  430  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  52.65 
 
 		 463 aa  431  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  51.7 
 
 		 474 aa  431  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002204  fumarate hydratase class II  53.3 
 
 		 461 aa  431  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  51.21 
 
 		 464 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  49.33 
 
 		 464 aa  428  1e-119  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  51.43 
 
 		 464 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  51.21 
 
 		 464 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2137  fumarate hydratase  49.55 
 
 		 465 aa  426  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2947  fumarate hydratase  51.98 
 
 		 466 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  50.32 
 
 		 467 aa  427  1e-118  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  50 
 
 		 462 aa  426  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>