More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0244 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0244  fumarate hydratase  100 
 
 		 463 aa  955    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  56.89 
 
 		 471 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1627  fumarate hydratase  56.51 
 
 		 468 aa  529  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0494  fumarate hydratase, class II  58.04 
 
 		 464 aa  527  1e-148  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1007  fumarate hydratase  56.14 
 
 		 463 aa  521  1e-147  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0281395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  55.08 
 
 		 464 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  55.08 
 
 		 464 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  56.11 
 
 		 459 aa  518  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1328  fumarate hydratase  52.76 
 
 		 469 aa  514  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  56.11 
 
 		 459 aa  516  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  54.78 
 
 		 464 aa  509  1e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  54.8 
 
 		 461 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  54.8 
 
 		 461 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  54.9 
 
 		 463 aa  507  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  54.7 
 
 		 463 aa  506  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3367  fumarate hydratase  55.7 
 
 		 463 aa  504  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.328502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  53.81 
 
 		 474 aa  505  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  53.71 
 
 		 461 aa  503  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0083  fumarate hydratase  55.75 
 
 		 466 aa  503  1e-141  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  54.8 
 
 		 463 aa  503  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2298  fumarate hydratase, class II  55.36 
 
 		 457 aa  500  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.25517 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  54.37 
 
 		 464 aa  499  1e-140  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2673  fumarate hydratase, class II  55.36 
 
 		 457 aa  500  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  54.15 
 
 		 467 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  54.37 
 
 		 463 aa  495  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  54.15 
 
 		 467 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  54.15 
 
 		 467 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  54.15 
 
 		 467 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  54.15 
 
 		 467 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  53.73 
 
 		 463 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0283  fumarate hydratase, class II  53.25 
 
 		 468 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136542 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2077  fumarate hydratase  54.68 
 
 		 463 aa  494  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  52.49 
 
 		 465 aa  491  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  54.01 
 
 		 470 aa  492  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  54.17 
 
 		 462 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  54.15 
 
 		 467 aa  489  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2365  fumarate hydratase  52.39 
 
 		 470 aa  488  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  53.28 
 
 		 465 aa  489  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  53.29 
 
 		 466 aa  489  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1576  fumarate hydratase  53.39 
 
 		 482 aa  488  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0866386  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  54.17 
 
 		 464 aa  487  1e-136  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2137  fumarate hydratase  54.05 
 
 		 465 aa  488  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6106  fumarate hydratase  52.31 
 
 		 474 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  53.83 
 
 		 465 aa  488  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  53.91 
 
 		 462 aa  487  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  53.48 
 
 		 631 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  52.71 
 
 		 465 aa  485  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1873  fumarate hydratase  52.49 
 
 		 465 aa  481  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0104019  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74587  Fumarase converts fumaric acid to L-malic acid in the TCA cycle  53.9 
 
 		 492 aa  482  1e-135  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.595402 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  53.26 
 
 		 464 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  52.51 
 
 		 467 aa  482  1e-135  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1832  fumarate hydratase  53.83 
 
 		 464 aa  484  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.87946  hitchhiker  0.00222416 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  53.26 
 
 		 464 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2237  fumarate hydratase  52.94 
 
 		 463 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.416397 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  52.4 
 
 		 461 aa  483  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2129  fumarate hydratase  52.75 
 
 		 487 aa  483  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000218779  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  53.26 
 
 		 464 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  53.26 
 
 		 464 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3215  fumarate hydratase, class II  53.28 
 
 		 468 aa  482  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587959  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  52.17 
 
 		 465 aa  484  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  53.26 
 
 		 464 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2016  fumarate hydratase  52.51 
 
 		 463 aa  481  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  53.26 
 
 		 464 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  53.46 
 
 		 466 aa  482  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  54.15 
 
 		 467 aa  478  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  53.29 
 
 		 472 aa  478  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  54.82 
 
 		 469 aa  481  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2270  fumarate hydratase  52.49 
 
 		 465 aa  481  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1985  fumarate hydratase  52.28 
 
 		 465 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  52.62 
 
 		 464 aa  479  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2030  fumarate hydratase  53.63 
 
 		 472 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4521  fumarate hydratase, class II  54.39 
 
 		 469 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  54.61 
 
 		 469 aa  479  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1894  fumarate hydratase  52.29 
 
 		 467 aa  478  1e-134  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0017878  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2334  fumarate hydratase  51.87 
 
 		 465 aa  479  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00667023  normal  0.148736 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0355  fumarate hydratase  53.73 
 
 		 463 aa  478  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0771995  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  51.95 
 
 		 465 aa  481  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  53.51 
 
 		 472 aa  479  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3332  fumarase  53.83 
 
 		 469 aa  478  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08707  fumarate hydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02470)  53.23 
 
 		 544 aa  475  1e-133  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01580  fumarate hydratase  53.93 
 
 		 467 aa  475  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1796  fumarate hydratase  54.15 
 
 		 467 aa  478  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.114122  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  53.47 
 
 		 463 aa  475  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1617  fumarate hydratase  52.83 
 
 		 462 aa  477  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3022  fumarate hydratase  53.69 
 
 		 463 aa  477  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1587  fumarate hydratase  52.61 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  54.47 
 
 		 510 aa  478  1e-133  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  52.39 
 
 		 464 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1819  fumarate hydratase  52.47 
 
 		 462 aa  475  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1589  fumarate hydratase  53.93 
 
 		 467 aa  475  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.194502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1415  fumarate hydratase  52.7 
 
 		 462 aa  475  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.566531  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0240  fumarate hydratase  54.51 
 
 		 466 aa  478  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01570  hypothetical protein  53.93 
 
 		 467 aa  475  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24852  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  52.85 
 
 		 462 aa  476  1e-133  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2320  fumarate hydratase  54.15 
 
 		 467 aa  478  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2394  fumarate hydratase  51.85 
 
 		 462 aa  477  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.344054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  54.15 
 
 		 467 aa  477  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  52.61 
 
 		 464 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  52.61 
 
 		 464 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  52.61 
 
 		 464 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>