More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4122 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3120  fumarate lyase  82.68 
 
 		 472 aa  744    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000941956  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2065  fumarate hydratase  91.83 
 
 		 469 aa  852    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0865781 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  83.91 
 
 		 466 aa  751    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4122  fumarate hydratase  100 
 
 		 473 aa  958    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264623  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11119  fumarate hydratase  88.44 
 
 		 474 aa  810    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.954044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4353  fumarate hydratase  99.79 
 
 		 473 aa  957    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121763  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4197  fumarate hydratase  100 
 
 		 473 aa  958    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309456  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4649  fumarate hydratase  92.11 
 
 		 471 aa  852    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456115 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  67.17 
 
 		 463 aa  625  1e-178  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  67.03 
 
 		 462 aa  618  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  67.25 
 
 		 472 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  66.3 
 
 		 464 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  64.35 
 
 		 463 aa  595  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23010  fumarase  65.8 
 
 		 468 aa  590  1e-167  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  66.3 
 
 		 464 aa  591  1e-167  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  63.42 
 
 		 473 aa  588  1e-167  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  65.36 
 
 		 465 aa  583  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  66.45 
 
 		 473 aa  580  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  61.75 
 
 		 471 aa  578  1e-164  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4243  fumarate hydratase  64.85 
 
 		 466 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0560645 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  64.22 
 
 		 475 aa  572  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  64.19 
 
 		 466 aa  569  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3882  fumarate hydratase  66.3 
 
 		 463 aa  570  1e-161  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.475519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  65.35 
 
 		 472 aa  567  1e-160  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  63.36 
 
 		 473 aa  564  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0844  fumarate hydratase  66.52 
 
 		 463 aa  560  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0959  fumarate lyase  63.64 
 
 		 473 aa  560  1e-158  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  hitchhiker  0.000463461 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  63.12 
 
 		 465 aa  560  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  63.02 
 
 		 465 aa  556  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05170  fumarate hydratase  60.89 
 
 		 473 aa  556  1e-157  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  63.75 
 
 		 471 aa  557  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0935  fumarate lyase  62.37 
 
 		 476 aa  556  1e-157  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  64.21 
 
 		 464 aa  550  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0720  fumarate hydratase  64.85 
 
 		 464 aa  536  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07330  fumarase  59.91 
 
 		 463 aa  518  1.0000000000000001e-145  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.24875 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  55.29 
 
 		 480 aa  503  1e-141  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  56.18 
 
 		 469 aa  497  1e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  54.51 
 
 		 469 aa  485  1e-136  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  55.31 
 
 		 459 aa  483  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  53.78 
 
 		 468 aa  481  1e-134  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  53.98 
 
 		 475 aa  478  1e-134  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  55.8 
 
 		 462 aa  480  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  54.05 
 
 		 465 aa  473  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  55.41 
 
 		 467 aa  473  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5854  fumarate lyase  54.75 
 
 		 440 aa  462  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  53.28 
 
 		 475 aa  461  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  52.74 
 
 		 469 aa  461  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  56.67 
 
 		 456 aa  460  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  52.74 
 
 		 469 aa  459  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1786  fumarate lyase  57.11 
 
 		 463 aa  458  1e-127  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.263641  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  51.97 
 
 		 469 aa  456  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  51.97 
 
 		 469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  49.46 
 
 		 460 aa  452  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  51.33 
 
 		 461 aa  448  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  51.33 
 
 		 461 aa  448  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  52.38 
 
 		 469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  52.47 
 
 		 474 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  52.26 
 
 		 461 aa  444  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1384  fumarate hydratase  51.44 
 
 		 464 aa  442  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  51.1 
 
 		 464 aa  443  1e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  51.53 
 
 		 468 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2108  fumarate hydratase  53.32 
 
 		 459 aa  440  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.866969  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  50.66 
 
 		 462 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1441  fumarate lyase  50.87 
 
 		 461 aa  440  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3367  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 463 aa  436  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.328502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  50.32 
 
 		 472 aa  436  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  50.55 
 
 		 463 aa  437  1e-121  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1189  fumarate hydratase, class II  50.98 
 
 		 466 aa  436  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  50.77 
 
 		 464 aa  434  1e-120  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0853  fumarate lyase  49.26 
 
 		 474 aa  432  1e-120  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104747  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1576  fumarate hydratase  50.33 
 
 		 482 aa  434  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0866386  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  52.12 
 
 		 464 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  52.12 
 
 		 464 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  50.33 
 
 		 471 aa  435  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  52.12 
 
 		 464 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  50.55 
 
 		 465 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  52.12 
 
 		 464 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  51.89 
 
 		 464 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  50.33 
 
 		 463 aa  432  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1650  fumarate hydratase  50.34 
 
 		 462 aa  433  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  52.34 
 
 		 631 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  52.12 
 
 		 464 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  52.12 
 
 		 464 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0238  fumarate hydratase, class II  49.25 
 
 		 466 aa  433  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2694  fumarate hydratase, class II  48.91 
 
 		 466 aa  429  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.650126  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09838  FumC  49.67 
 
 		 465 aa  429  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  49.04 
 
 		 510 aa  428  1e-119  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  50 
 
 		 465 aa  430  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0904  fumarate hydratase, class II  52.19 
 
 		 465 aa  431  1e-119  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  51.43 
 
 		 465 aa  431  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  51.13 
 
 		 463 aa  430  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  49.57 
 
 		 464 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  49.57 
 
 		 464 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  51.2 
 
 		 464 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2816  fumarate hydratase, class II  49.23 
 
 		 467 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0160  fumarate hydratase, class II  50.99 
 
 		 465 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2077  fumarate hydratase  50.87 
 
 		 463 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1738  fumarate hydratase  50.44 
 
 		 456 aa  427  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  51.36 
 
 		 461 aa  427  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1415  fumarate hydratase  49.02 
 
 		 462 aa  424  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.566531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>