More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0422 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  100 
 
 		 472 aa  962    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  72.67 
 
 		 463 aa  654    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  62.39 
 
 		 467 aa  568  1e-161  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  62.09 
 
 		 468 aa  566  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  59.96 
 
 		 459 aa  555  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  58.64 
 
 		 475 aa  542  1e-153  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  58.1 
 
 		 468 aa  540  9.999999999999999e-153  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  56.89 
 
 		 469 aa  530  1e-149  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  56.09 
 
 		 480 aa  526  1e-148  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  55.87 
 
 		 469 aa  518  1.0000000000000001e-145  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  54.7 
 
 		 469 aa  506  9.999999999999999e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  53.38 
 
 		 461 aa  496  1e-139  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  52.53 
 
 		 471 aa  492  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  56.03 
 
 		 463 aa  492  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  53.71 
 
 		 465 aa  491  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6106  fumarate hydratase  52.03 
 
 		 474 aa  490  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  54.25 
 
 		 462 aa  488  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  51.31 
 
 		 463 aa  488  1e-136  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  52.62 
 
 		 461 aa  485  1e-136  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  52.29 
 
 		 464 aa  484  1e-135  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  53.49 
 
 		 472 aa  483  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  53.28 
 
 		 472 aa  481  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  50.87 
 
 		 464 aa  478  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  53.22 
 
 		 464 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3367  fumarate hydratase  52.94 
 
 		 463 aa  478  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.328502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  52.27 
 
 		 467 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  55.24 
 
 		 456 aa  475  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  52.27 
 
 		 467 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  50.86 
 
 		 510 aa  477  1e-133  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2353  fumarate hydratase  52.06 
 
 		 469 aa  475  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.499046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  50.87 
 
 		 464 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  52.27 
 
 		 467 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  52.27 
 
 		 467 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  52.27 
 
 		 467 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4521  fumarate hydratase, class II  52.7 
 
 		 469 aa  474  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  51.93 
 
 		 464 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2030  fumarate hydratase  53.9 
 
 		 472 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  53.5 
 
 		 465 aa  472  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  51.52 
 
 		 466 aa  473  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1576  fumarate hydratase  51.4 
 
 		 482 aa  472  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0866386  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  53.03 
 
 		 463 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2786  fumarate hydratase, class II  53.49 
 
 		 472 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.347801 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  52.31 
 
 		 470 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  52.27 
 
 		 469 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  50.98 
 
 		 462 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  51.63 
 
 		 465 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  52.38 
 
 		 462 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  49.78 
 
 		 459 aa  469  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  52.31 
 
 		 467 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01580  fumarate hydratase  52.31 
 
 		 467 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  51.53 
 
 		 463 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2137  fumarate hydratase  52.09 
 
 		 465 aa  467  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2935  fumarate hydratase  53.25 
 
 		 468 aa  466  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.317569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0812  fumarate hydratase  52.58 
 
 		 464 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01570  hypothetical protein  52.31 
 
 		 467 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24852  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  52.53 
 
 		 467 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1650  fumarate hydratase  52.26 
 
 		 462 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2732  fumarate hydratase  52.29 
 
 		 471 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  51.62 
 
 		 469 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  49.56 
 
 		 459 aa  466  9.999999999999999e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  50.66 
 
 		 465 aa  466  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0355  fumarate hydratase  50.33 
 
 		 463 aa  466  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0771995  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1328  fumarate hydratase  49.13 
 
 		 469 aa  466  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  0.832729 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08707  fumarate hydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02470)  51.09 
 
 		 544 aa  462  1e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  52.31 
 
 		 467 aa  464  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  51.87 
 
 		 461 aa  464  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  52.42 
 
 		 469 aa  463  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  51.53 
 
 		 478 aa  464  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1071  fumarate hydratase  51.62 
 
 		 465 aa  462  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  54.96 
 
 		 471 aa  464  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  51.65 
 
 		 465 aa  463  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0494  fumarate hydratase, class II  50.98 
 
 		 464 aa  462  1e-129  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2334  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 465 aa  462  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00667023  normal  0.148736 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2320  fumarate hydratase  52.31 
 
 		 467 aa  464  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0853  fumarate lyase  51.6 
 
 		 474 aa  464  1e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104747  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1796  fumarate hydratase  52.31 
 
 		 467 aa  464  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.114122  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3271  fumarate hydratase  52.49 
 
 		 472 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.126919  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3360  fumarate hydratase  53.46 
 
 		 472 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0876882  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2108  fumarate hydratase  52.79 
 
 		 459 aa  463  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.866969  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  51.87 
 
 		 461 aa  464  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  55.22 
 
 		 462 aa  465  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4014  fumarate hydratase  52.62 
 
 		 475 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1738  fumarate hydratase  52.71 
 
 		 456 aa  464  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2019  fumarate hydratase  52.31 
 
 		 467 aa  463  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  51.21 
 
 		 461 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  50.99 
 
 		 466 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  51.41 
 
 		 465 aa  460  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0283  fumarate hydratase, class II  50.86 
 
 		 468 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136542 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3022  fumarate hydratase  51.53 
 
 		 463 aa  459  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2237  fumarate hydratase  51.31 
 
 		 463 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.416397 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2016  fumarate hydratase  51.09 
 
 		 463 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1415  fumarate hydratase  49.46 
 
 		 462 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.566531  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  52.15 
 
 		 473 aa  461  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  50.99 
 
 		 464 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1589  fumarate hydratase  52.09 
 
 		 467 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.194502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  50.99 
 
 		 464 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  50.99 
 
 		 464 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  53.66 
 
 		 473 aa  460  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  50.99 
 
 		 464 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  52.05 
 
 		 464 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>