More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3085 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  75 
 
 		 462 aa  704    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  71.9 
 
 		 473 aa  655    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  74.78 
 
 		 464 aa  651    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0844  fumarate hydratase  73.36 
 
 		 463 aa  645    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  75 
 
 		 463 aa  714    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  75.65 
 
 		 463 aa  717    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3882  fumarate hydratase  73.58 
 
 		 463 aa  658    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.475519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  74.24 
 
 		 472 aa  659    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  100 
 
 		 464 aa  939    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  72.05 
 
 		 472 aa  665    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  68.76 
 
 		 473 aa  637    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  70.81 
 
 		 464 aa  627  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  69.65 
 
 		 471 aa  624  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  66.74 
 
 		 471 aa  622  1e-177  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4243  fumarate hydratase  68.42 
 
 		 466 aa  614  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0560645 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  68.49 
 
 		 466 aa  615  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0935  fumarate lyase  69.05 
 
 		 476 aa  612  9.999999999999999e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  66.67 
 
 		 465 aa  612  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  68.12 
 
 		 465 aa  612  9.999999999999999e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  67.97 
 
 		 465 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0959  fumarate lyase  69.63 
 
 		 473 aa  600  1e-170  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  hitchhiker  0.000463461 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  64.03 
 
 		 473 aa  596  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  63.95 
 
 		 475 aa  589  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  65.5 
 
 		 466 aa  587  1e-166  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05170  fumarate hydratase  63.58 
 
 		 473 aa  583  1.0000000000000001e-165  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4353  fumarate hydratase  66.3 
 
 		 473 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121763  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4122  fumarate hydratase  66.3 
 
 		 473 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264623  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4197  fumarate hydratase  66.3 
 
 		 473 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309456  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11119  fumarate hydratase  64.92 
 
 		 474 aa  574  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.954044 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23010  fumarase  63.68 
 
 		 468 aa  574  1.0000000000000001e-162  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3120  fumarate lyase  65.07 
 
 		 472 aa  572  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000941956  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2065  fumarate hydratase  64.13 
 
 		 469 aa  571  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0865781 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4649  fumarate hydratase  64.57 
 
 		 471 aa  570  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456115 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0720  fumarate hydratase  66.01 
 
 		 464 aa  552  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07330  fumarase  61 
 
 		 463 aa  530  1e-149  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.24875 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  59.38 
 
 		 456 aa  499  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  56.21 
 
 		 469 aa  490  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  56.28 
 
 		 467 aa  486  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  54.25 
 
 		 469 aa  479  1e-134  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  56.09 
 
 		 465 aa  480  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  54.25 
 
 		 469 aa  481  1e-134  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  56.77 
 
 		 462 aa  480  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  56.35 
 
 		 459 aa  481  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1786  fumarate lyase  58.79 
 
 		 463 aa  477  1e-133  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.263641  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  52.69 
 
 		 480 aa  476  1e-133  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  53.86 
 
 		 469 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  53.22 
 
 		 469 aa  468  1.0000000000000001e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  52.83 
 
 		 469 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  52.15 
 
 		 468 aa  467  9.999999999999999e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  53.36 
 
 		 475 aa  465  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  51.94 
 
 		 464 aa  462  1e-129  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1177  fumarate hydratase  54.44 
 
 		 461 aa  464  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.661179  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  53.23 
 
 		 464 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  52.05 
 
 		 472 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  53.23 
 
 		 464 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  53.23 
 
 		 464 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  53.23 
 
 		 464 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  53.23 
 
 		 464 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  51.72 
 
 		 475 aa  461  9.999999999999999e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  53.23 
 
 		 464 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5854  fumarate lyase  55 
 
 		 440 aa  460  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  51.51 
 
 		 469 aa  456  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  53.45 
 
 		 631 aa  458  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  51.21 
 
 		 460 aa  457  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27180  fumarate hydratase  54.73 
 
 		 458 aa  452  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00136432  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  52.74 
 
 		 462 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 465 aa  448  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  52.12 
 
 		 464 aa  451  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  50.77 
 
 		 461 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  47.92 
 
 		 459 aa  448  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  50.54 
 
 		 510 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  50.55 
 
 		 461 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  47.7 
 
 		 459 aa  445  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  51.76 
 
 		 474 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1650  fumarate hydratase  51.63 
 
 		 462 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  50.77 
 
 		 461 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0853  fumarate lyase  48.32 
 
 		 474 aa  446  1.0000000000000001e-124  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104747  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  52.28 
 
 		 467 aa  442  1e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  51.21 
 
 		 464 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1384  fumarate hydratase  50 
 
 		 464 aa  442  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  52.07 
 
 		 472 aa  444  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  50.33 
 
 		 461 aa  444  1e-123  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2108  fumarate hydratase  52.83 
 
 		 459 aa  443  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.866969  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  51.21 
 
 		 464 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  51.21 
 
 		 464 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58030  fumarate hydratase  53.26 
 
 		 458 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  51.21 
 
 		 464 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  51.85 
 
 		 472 aa  443  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  50.97 
 
 		 468 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1894  fumarate hydratase  52.28 
 
 		 467 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0017878  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  54.65 
 
 		 463 aa  439  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  48.94 
 
 		 466 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  50.99 
 
 		 464 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2947  fumarate hydratase  51.1 
 
 		 466 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  49.78 
 
 		 464 aa  438  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  50.33 
 
 		 464 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  49.56 
 
 		 462 aa  436  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  50 
 
 		 464 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  49.78 
 
 		 463 aa  435  1e-121  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1189  fumarate hydratase, class II  49.89 
 
 		 466 aa  436  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0920131 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>