More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2866 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  71.93 
 
 		 472 aa  684    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  100 
 
 		 463 aa  936    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  62.5 
 
 		 468 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  58.89 
 
 		 459 aa  548  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  58.79 
 
 		 467 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  56.83 
 
 		 469 aa  529  1e-149  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  56.99 
 
 		 475 aa  518  1e-146  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  55.53 
 
 		 468 aa  514  1.0000000000000001e-145  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  54.59 
 
 		 480 aa  507  9.999999999999999e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  54.88 
 
 		 469 aa  506  9.999999999999999e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  58.73 
 
 		 456 aa  501  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  58.21 
 
 		 462 aa  494  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  55.04 
 
 		 469 aa  490  1e-137  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2108  fumarate hydratase  55.24 
 
 		 459 aa  483  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.866969  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  55.17 
 
 		 465 aa  479  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  51.3 
 
 		 464 aa  478  1e-133  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  55.94 
 
 		 463 aa  477  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  53.32 
 
 		 471 aa  472  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  55.19 
 
 		 465 aa  472  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  53.44 
 
 		 462 aa  471  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07330  fumarase  56.28 
 
 		 463 aa  472  1e-132  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.24875 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  50.98 
 
 		 465 aa  471  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  50.87 
 
 		 465 aa  472  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  54.78 
 
 		 469 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  48.35 
 
 		 459 aa  470  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  51.42 
 
 		 472 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  51.64 
 
 		 472 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1650  fumarate hydratase  51.97 
 
 		 462 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0853  fumarate lyase  50.43 
 
 		 474 aa  466  9.999999999999999e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104747  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  49.56 
 
 		 462 aa  465  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  52.79 
 
 		 463 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  50.76 
 
 		 464 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  48.13 
 
 		 459 aa  466  9.999999999999999e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1738  fumarate hydratase  52.51 
 
 		 456 aa  467  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2151  fumarate hydratase, class II  50.98 
 
 		 467 aa  468  9.999999999999999e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0733926 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0494  fumarate hydratase, class II  50.33 
 
 		 464 aa  464  1e-129  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2353  fumarate hydratase  52.17 
 
 		 469 aa  464  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.499046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 464 aa  461  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1384  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 464 aa  462  1e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05170  fumarate hydratase  53.02 
 
 		 473 aa  463  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  49.89 
 
 		 463 aa  463  1e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2334  fumarate hydratase  49.67 
 
 		 465 aa  462  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00667023  normal  0.148736 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  52.58 
 
 		 473 aa  461  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  51.43 
 
 		 463 aa  460  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 464 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 464 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 464 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 464 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27180  fumarate hydratase  53.83 
 
 		 458 aa  461  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00136432  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  49.02 
 
 		 467 aa  461  9.999999999999999e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 461 aa  460  9.999999999999999e-129  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  52.15 
 
 		 462 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 464 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  49.57 
 
 		 464 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  50.98 
 
 		 460 aa  460  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4521  fumarate hydratase, class II  50.99 
 
 		 469 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1894  fumarate hydratase  49.02 
 
 		 467 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0017878  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  49.57 
 
 		 464 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  53.88 
 
 		 464 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  49.57 
 
 		 464 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 464 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1576  fumarate hydratase  49.67 
 
 		 482 aa  458  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0866386  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  47.62 
 
 		 471 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 631 aa  458  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  48.6 
 
 		 466 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  49.67 
 
 		 469 aa  457  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  49.57 
 
 		 464 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  50.11 
 
 		 464 aa  457  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2689  aspartate ammonia-lyase  49.46 
 
 		 476 aa  455  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0392115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1177  fumarate hydratase  50.98 
 
 		 461 aa  456  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.661179  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  48.79 
 
 		 464 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  49.35 
 
 		 464 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  55.08 
 
 		 472 aa  455  1e-127  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0812  fumarate hydratase  50.33 
 
 		 464 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  48.79 
 
 		 464 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2786  fumarate hydratase, class II  51.2 
 
 		 472 aa  457  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.347801 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  49.67 
 
 		 461 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  49.67 
 
 		 461 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  50.55 
 
 		 463 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  49.23 
 
 		 467 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  50.98 
 
 		 470 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  49.23 
 
 		 467 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  48.71 
 
 		 464 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4762  fumarate lyase  49.03 
 
 		 473 aa  452  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  50.44 
 
 		 469 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  49.01 
 
 		 461 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  49.23 
 
 		 467 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2732  fumarate hydratase  51.54 
 
 		 471 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  52.25 
 
 		 475 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  52.7 
 
 		 472 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  52.9 
 
 		 473 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  50.33 
 
 		 462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1366  fumarate hydratase  46.42 
 
 		 463 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.862526  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  50.87 
 
 		 469 aa  451  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  49.68 
 
 		 475 aa  448  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0424  fumarate hydratase  46.42 
 
 		 463 aa  449  1e-125  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1556  fumarate hydratase  46.2 
 
 		 463 aa  451  1e-125  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.433937  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  48.35 
 
 		 464 aa  450  1e-125  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2394  fumarate hydratase  48.8 
 
 		 462 aa  448  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.344054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3271  fumarate hydratase  51.54 
 
 		 472 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.126919  normal  0.943861 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>