More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2689 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2689  aspartate ammonia-lyase  100 
 
 
476 aa  974    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0392115  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3082  aspartate ammonia-lyase  53.73 
 
 
469 aa  503  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2795  aspartate ammonia-lyase  54.35 
 
 
466 aa  500  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000791072  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1415  aspartate ammonia-lyase  54.78 
 
 
466 aa  501  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24959e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0940  aspartate ammonia-lyase  53.76 
 
 
467 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0286202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4355  aspartate ammonia-lyase  51.64 
 
 
474 aa  484  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000233495  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4762  fumarate lyase  52.74 
 
 
473 aa  484  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0479  aspartate ammonia-lyase  54.64 
 
 
463 aa  476  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3341  fumarate lyase  52.13 
 
 
484 aa  477  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.611164  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2695  fumarate lyase  50.88 
 
 
468 aa  472  1e-132  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0925  fumarate lyase  51.92 
 
 
484 aa  474  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.751355  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1665  aspartate ammonia-lyase  50.11 
 
 
479 aa  472  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0550  aspartate ammonia-lyase  52.48 
 
 
467 aa  474  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1667  aspartate ammonia-lyase  50.11 
 
 
479 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0778255  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0520  aspartate ammonia-lyase  49.67 
 
 
477 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3556  aspartate ammonia-lyase  51.54 
 
 
471 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1800  aspartate ammonia-lyase  50.11 
 
 
479 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3115  aspartate ammonia-lyase  50.22 
 
 
476 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03150  aspartate ammonia-lyase  47.83 
 
 
471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000322515  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1921  aspartate ammonia-lyase  50.11 
 
 
479 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1811  aspartate ammonia-lyase  50.33 
 
 
479 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0526  aspartate ammonia-lyase  49.89 
 
 
477 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0181392  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3530  aspartate ammonia-lyase  49.89 
 
 
479 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0523  aspartate ammonia-lyase  49.67 
 
 
477 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442808  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0677  aspartate ammonia-lyase  49.67 
 
 
477 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0185443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0576  aspartate ammonia-lyase  49.67 
 
 
477 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0520  aspartate ammonia-lyase  49.67 
 
 
477 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0736  aspartate ammonia-lyase  49.67 
 
 
477 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0153519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0609  aspartate ammonia-lyase  49.67 
 
 
477 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4691  aspartate ammonia-lyase  48.94 
 
 
477 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000148862  hitchhiker  1.50426e-18 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0665  aspartate ammonia-lyase  49.67 
 
 
477 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0151100000000002e-47 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0647  aspartate ammonia-lyase  49.67 
 
 
477 aa  464  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00115494  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3135  aspartate ammonia-lyase  50.77 
 
 
476 aa  458  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1872  aspartate ammonia-lyase  50.11 
 
 
479 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2915  aspartate ammonia-lyase  50.33 
 
 
476 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1649  aspartate ammonia-lyase  50.33 
 
 
479 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2883  aspartate ammonia-lyase  50.22 
 
 
476 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1614  aspartate ammonia-lyase  50.33 
 
 
479 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2845  aspartate ammonia-lyase  50.22 
 
 
476 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1847  aspartate ammonia-lyase  50.33 
 
 
479 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142722 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3136  aspartate ammonia-lyase  50.33 
 
 
476 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1905  fumarate lyase  50.22 
 
 
475 aa  455  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1346  aspartate ammonia-lyase  51.65 
 
 
475 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2500  fumarate lyase  51.2 
 
 
472 aa  449  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2122  aspartate ammonia-lyase  49.89 
 
 
476 aa  449  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2602  aspartate ammonia-lyase  51.21 
 
 
475 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  50 
 
 
472 aa  449  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1643  aspartate ammonia-lyase  46.85 
 
 
474 aa  451  1e-125  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3158  aspartate ammonia-lyase  50.11 
 
 
476 aa  451  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0082  aspartate ammonia-lyase  47.63 
 
 
468 aa  446  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  47.96 
 
 
468 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1245  aspartate ammonia-lyase  51.43 
 
 
475 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.431098  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3455  aspartate ammonia-lyase  47.84 
 
 
470 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025134  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2438  aspartate ammonia-lyase  48.91 
 
 
466 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.268607  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2667  fumarase  46.25 
 
 
479 aa  447  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.284725  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0481  aspartate ammonia-lyase  49.02 
 
 
474 aa  442  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0094  aspartate ammonia-lyase  46.9 
 
 
468 aa  442  1e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2083  aspartate ammonia-lyase  48.16 
 
 
475 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195347  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0122  aspartate ammonia-lyase  47.41 
 
 
468 aa  445  1e-123  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2177  aspartate ammonia-lyase  48.16 
 
 
475 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5338  aspartate ammonia-lyase  49.89 
 
 
478 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486768 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0682  aspartate ammonia-lyase  48.6 
 
 
472 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000328745  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5247  aspartate ammonia-lyase  50.11 
 
 
478 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0371805  normal  0.169068 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0135  aspartate ammonia-lyase  50.32 
 
 
485 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5387  aspartate ammonia-lyase  50.11 
 
 
485 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1993  aspartate ammonia-lyase  46.52 
 
 
463 aa  436  1e-121  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1958  aspartate ammonia-lyase  48.91 
 
 
483 aa  436  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.175554  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  49.57 
 
 
469 aa  436  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  49.45 
 
 
475 aa  435  1e-121  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  49.23 
 
 
459 aa  437  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1884  aspartate ammonia-lyase  48.91 
 
 
483 aa  436  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218686  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2052  aspartate ammonia-lyase  45.87 
 
 
485 aa  434  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0909745  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5499  aspartate ammonia-lyase  48.49 
 
 
474 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5051  aspartate ammonia-lyase  48.49 
 
 
474 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1791  aspartate ammonia-lyase  49.24 
 
 
475 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1395  fumarate lyase  47.48 
 
 
478 aa  433  1e-120  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6217  aspartate ammonia-lyase  49.35 
 
 
474 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.946627  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1258  aspartate ammonia-lyase  50.22 
 
 
481 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.963292  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1757  aspartate ammonia-lyase  48.33 
 
 
482 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  48.36 
 
 
468 aa  433  1e-120  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  49.46 
 
 
463 aa  432  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2167  aspartate ammonia-lyase  46.82 
 
 
480 aa  434  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0565  aspartate ammonia-lyase  48.81 
 
 
521 aa  434  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0355315 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  47.92 
 
 
480 aa  431  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5625  aspartate ammonia-lyase  49.14 
 
 
478 aa  431  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149238  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2072  aspartate ammonia-lyase  48.6 
 
 
471 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71650  aspartate ammonia-lyase  49.14 
 
 
474 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0128  aspartate ammonia-lyase  48.28 
 
 
474 aa  429  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.266622  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1746  fumarate lyase  46.57 
 
 
469 aa  426  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24080  aspartate ammonia-lyase  45.34 
 
 
505 aa  426  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  49.57 
 
 
467 aa  427  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  48.14 
 
 
469 aa  425  1e-118  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5639  aspartate ammonia-lyase  46.3 
 
 
479 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.611375  normal  0.502562 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3758  fumarate lyase  46.05 
 
 
471 aa  423  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1293  aspartate ammonia-lyase  48.38 
 
 
468 aa  423  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0277144  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6431  aspartate ammonia-lyase  47.94 
 
 
471 aa  418  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1545  aspartate ammonia-lyase  43.59 
 
 
470 aa  419  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000011141  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0193  aspartate ammonia-lyase  45.39 
 
 
463 aa  419  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3544  fumarate lyase  46.61 
 
 
471 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3976  fumarate lyase  46.72 
 
 
471 aa  418  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>