More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0324 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  100 
 
 		 468 aa  948    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  62.09 
 
 		 472 aa  566  1e-160  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  61.61 
 
 		 467 aa  555  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  57.05 
 
 		 468 aa  541  1e-153  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  58.66 
 
 		 475 aa  543  1e-153  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  62.5 
 
 		 463 aa  542  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  58.68 
 
 		 459 aa  541  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  56.93 
 
 		 480 aa  540  9.999999999999999e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  58.79 
 
 		 469 aa  541  9.999999999999999e-153  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  57.36 
 
 		 469 aa  536  1e-151  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  55.68 
 
 		 469 aa  503  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  56.46 
 
 		 631 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  56.33 
 
 		 464 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  56.33 
 
 		 464 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  56.33 
 
 		 464 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  52.84 
 
 		 461 aa  491  9.999999999999999e-139  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  56.33 
 
 		 464 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  56.33 
 
 		 464 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  56.33 
 
 		 464 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0853  fumarate lyase  50.42 
 
 		 474 aa  488  1e-137  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104747  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  55.8 
 
 		 464 aa  489  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2947  fumarate hydratase  56.7 
 
 		 466 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.271381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  53.28 
 
 		 471 aa  485  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  54.37 
 
 		 462 aa  487  1e-136  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  52.09 
 
 		 459 aa  482  1e-135  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  52.83 
 
 		 463 aa  483  1e-135  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  52.4 
 
 		 461 aa  483  1e-135  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1038  fumarate hydratase  56.26 
 
 		 466 aa  482  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  54.51 
 
 		 466 aa  481  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  54.92 
 
 		 464 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  54.29 
 
 		 463 aa  478  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  54.7 
 
 		 464 aa  481  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  51.65 
 
 		 459 aa  478  1e-134  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  52.17 
 
 		 462 aa  478  1e-134  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  54.05 
 
 		 464 aa  478  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2394  fumarate hydratase  53.46 
 
 		 462 aa  478  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.344054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  54.49 
 
 		 464 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  54.49 
 
 		 464 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  54.49 
 
 		 464 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2270  fumarate hydratase  53.16 
 
 		 465 aa  476  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  53.59 
 
 		 465 aa  478  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6106  fumarate hydratase  54.13 
 
 		 474 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2334  fumarate hydratase  54.19 
 
 		 465 aa  478  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00667023  normal  0.148736 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1985  fumarate hydratase  53.16 
 
 		 465 aa  475  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  53.59 
 
 		 465 aa  476  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1873  fumarate hydratase  53.16 
 
 		 465 aa  474  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0104019  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  52.94 
 
 		 466 aa  472  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  54.23 
 
 		 462 aa  474  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1686  fumarate hydratase  52.94 
 
 		 467 aa  474  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.569967  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  54.03 
 
 		 470 aa  471  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  53.03 
 
 		 465 aa  474  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  53.81 
 
 		 472 aa  472  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01580  fumarate hydratase  52.94 
 
 		 467 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74587  Fumarase converts fumaric acid to L-malic acid in the TCA cycle  53.36 
 
 		 492 aa  471  1.0000000000000001e-131  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.595402 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2019  fumarate hydratase  52.94 
 
 		 467 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3022  fumarate hydratase  53.25 
 
 		 463 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4521  fumarate hydratase, class II  54.23 
 
 		 469 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  53.25 
 
 		 463 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1576  fumarate hydratase  53.03 
 
 		 482 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0866386  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1637  fumarate hydratase  51.82 
 
 		 467 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.799774 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  52.38 
 
 		 464 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  52.81 
 
 		 464 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01570  hypothetical protein  52.94 
 
 		 467 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24852  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2030  fumarate hydratase  54 
 
 		 472 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2365  fumarate hydratase  53.9 
 
 		 470 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2137  fumarate hydratase  52.72 
 
 		 465 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1578  fumarate hydratase  51.82 
 
 		 467 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.952 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  53.59 
 
 		 472 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1568  fumarate hydratase  51.82 
 
 		 467 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.366448  normal  0.0865298 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1705  fumarate hydratase  51.82 
 
 		 467 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0627343  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1874  fumarate hydratase  51.82 
 
 		 467 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0300838  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  52.94 
 
 		 467 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  52.07 
 
 		 464 aa  466  9.999999999999999e-131  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  52.94 
 
 		 467 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1796  fumarate hydratase  52.94 
 
 		 467 aa  467  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.114122  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3367  fumarate hydratase  53.56 
 
 		 463 aa  467  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.328502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1657  fumarate hydratase  51.52 
 
 		 467 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000112707  normal  0.675256 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  53.02 
 
 		 463 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2151  fumarate hydratase, class II  53.04 
 
 		 467 aa  466  9.999999999999999e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0733926 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2320  fumarate hydratase  52.94 
 
 		 467 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  53.25 
 
 		 478 aa  468  9.999999999999999e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2213  fumarate hydratase  54.92 
 
 		 464 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.620267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1894  fumarate hydratase  51.52 
 
 		 467 aa  467  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0017878  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  52.07 
 
 		 465 aa  464  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0812  fumarate hydratase  53.25 
 
 		 464 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2786  fumarate hydratase, class II  53.38 
 
 		 472 aa  462  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.347801 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  50.87 
 
 		 464 aa  464  1e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  50.87 
 
 		 463 aa  464  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  55.87 
 
 		 464 aa  462  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  52.07 
 
 		 465 aa  464  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  54.13 
 
 		 469 aa  463  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  54.07 
 
 		 474 aa  462  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2108  fumarate hydratase  52.26 
 
 		 459 aa  464  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.866969  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1589  fumarate hydratase  52.72 
 
 		 467 aa  463  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.194502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1819  fumarate hydratase  50.33 
 
 		 462 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07330  fumarase  55.58 
 
 		 463 aa  460  9.999999999999999e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.24875 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1587  fumarate hydratase  50.33 
 
 		 462 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1767  fumarate hydratase  50.11 
 
 		 462 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0940  aspartate ammonia-lyase  50.97 
 
 		 467 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0286202  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1832  fumarate hydratase  51.63 
 
 		 464 aa  460  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.87946  hitchhiker  0.00222416 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>