More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0633 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  100 
 
 		 469 aa  951    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  54.7 
 
 		 472 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  56.33 
 
 		 467 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  55.68 
 
 		 468 aa  503  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  54.15 
 
 		 468 aa  491  1e-137  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  54.08 
 
 		 459 aa  491  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  53.28 
 
 		 480 aa  489  1e-137  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  53.83 
 
 		 469 aa  481  1e-134  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  52.84 
 
 		 469 aa  476  1e-133  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  53.68 
 
 		 463 aa  472  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  53.28 
 
 		 475 aa  474  1e-132  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  55.94 
 
 		 463 aa  474  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  52.92 
 
 		 462 aa  473  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  55.97 
 
 		 464 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  51.31 
 
 		 469 aa  462  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0853  fumarate lyase  51.49 
 
 		 474 aa  461  9.999999999999999e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104747  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  52.59 
 
 		 472 aa  461  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  51.84 
 
 		 463 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  51.51 
 
 		 464 aa  456  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  50.33 
 
 		 471 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4243  fumarate hydratase  54 
 
 		 466 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0560645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6106  fumarate hydratase  51.97 
 
 		 474 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  48.03 
 
 		 459 aa  451  1e-125  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  52.37 
 
 		 473 aa  448  1e-125  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  52.71 
 
 		 465 aa  451  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2353  fumarate hydratase  51.75 
 
 		 469 aa  451  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.499046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  49.36 
 
 		 469 aa  450  1e-125  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  51.52 
 
 		 475 aa  449  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  50 
 
 		 463 aa  451  1e-125  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  47.81 
 
 		 459 aa  447  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  48.79 
 
 		 464 aa  445  1.0000000000000001e-124  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07330  fumarase  53.45 
 
 		 463 aa  445  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.24875 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  49.45 
 
 		 469 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0935  fumarate lyase  54.31 
 
 		 476 aa  448  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  53.68 
 
 		 464 aa  448  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2030  fumarate hydratase  52.62 
 
 		 472 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3271  fumarate hydratase  52.4 
 
 		 472 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.126919  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3360  fumarate hydratase  53.49 
 
 		 472 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0876882  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2732  fumarate hydratase  52.84 
 
 		 471 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  53.45 
 
 		 471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  52.59 
 
 		 473 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2151  fumarate hydratase, class II  49.78 
 
 		 467 aa  446  1.0000000000000001e-124  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0733926 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  52.48 
 
 		 473 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05170  fumarate hydratase  52.8 
 
 		 473 aa  443  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11119  fumarate hydratase  53.68 
 
 		 474 aa  445  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.954044 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  49.78 
 
 		 464 aa  445  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  51.11 
 
 		 465 aa  442  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  49.57 
 
 		 465 aa  443  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  49.56 
 
 		 464 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  52.7 
 
 		 466 aa  441  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  52.03 
 
 		 475 aa  440  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3882  fumarate hydratase  52.37 
 
 		 463 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.475519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2394  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 462 aa  439  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.344054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4014  fumarate hydratase  52.07 
 
 		 475 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0812  fumarate hydratase  49.56 
 
 		 464 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  52.65 
 
 		 456 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1576  fumarate hydratase  50.44 
 
 		 482 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0866386  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0844  fumarate hydratase  52.69 
 
 		 463 aa  437  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0355  fumarate hydratase  50.87 
 
 		 463 aa  436  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0771995  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2065  fumarate hydratase  52.38 
 
 		 469 aa  436  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0865781 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  52.59 
 
 		 465 aa  435  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  53.48 
 
 		 466 aa  438  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4649  fumarate hydratase  52.6 
 
 		 471 aa  437  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456115 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1636  fumarate hydratase  48.47 
 
 		 462 aa  432  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0545327  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  48.58 
 
 		 464 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  49.89 
 
 		 461 aa  433  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1587  fumarate hydratase  48.25 
 
 		 462 aa  433  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  47.49 
 
 		 461 aa  434  1e-120  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  51.72 
 
 		 465 aa  434  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1627  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 468 aa  433  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  48.58 
 
 		 464 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2129  fumarate hydratase  51.17 
 
 		 487 aa  434  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000218779  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  49.45 
 
 		 461 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  49.45 
 
 		 461 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  48.69 
 
 		 465 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1819  fumarate hydratase  47.94 
 
 		 462 aa  428  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1637  fumarate hydratase  48.25 
 
 		 462 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.156374  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1617  fumarate hydratase  48.03 
 
 		 462 aa  431  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2673  fumarate hydratase, class II  50.44 
 
 		 457 aa  428  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3367  fumarate hydratase  50 
 
 		 463 aa  431  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.328502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3561  fumarate hydratase  48.03 
 
 		 462 aa  429  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  50.65 
 
 		 471 aa  431  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2298  fumarate hydratase, class II  50.44 
 
 		 457 aa  428  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.25517 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1415  fumarate hydratase  48.25 
 
 		 462 aa  431  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.566531  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1767  fumarate hydratase  48.25 
 
 		 462 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2016  fumarate hydratase  50.22 
 
 		 463 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1650  fumarate hydratase  47.82 
 
 		 462 aa  429  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1895  fumarate hydratase  48.25 
 
 		 462 aa  430  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0261938  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0959  fumarate lyase  53.13 
 
 		 473 aa  431  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  hitchhiker  0.000463461 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  49.78 
 
 		 462 aa  431  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  50.98 
 
 		 462 aa  429  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36139  fumarate hydratase  49.12 
 
 		 462 aa  429  1e-119  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1783  fumarate hydratase  48.03 
 
 		 462 aa  431  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1841  fumarate hydratase  48.03 
 
 		 462 aa  428  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194885  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2881  fumarate hydratase  50.65 
 
 		 468 aa  427  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  49.34 
 
 		 462 aa  425  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  47.06 
 
 		 461 aa  427  1e-118  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2365  fumarate hydratase  49.13 
 
 		 470 aa  426  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  49.23 
 
 		 474 aa  427  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4197  fumarate hydratase  52.38 
 
 		 473 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309456  normal  0.68716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>