More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4264 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0944  fumarate hydratase  73.46 
 
 		 459 aa  647    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4461  fumarate hydratase, class II  73.03 
 
 		 458 aa  642    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4264  fumarate hydratase  100 
 
 		 458 aa  926    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27180  fumarate hydratase  71.87 
 
 		 458 aa  636    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00136432  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0703  fumarate hydratase  87.77 
 
 		 458 aa  765    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00794329 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3686  fumarate lyase  67.82 
 
 		 463 aa  638    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0951  fumarate hydratase  72.15 
 
 		 459 aa  636    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0984  fumarate hydratase  73.68 
 
 		 459 aa  649    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58030  fumarate hydratase  73.03 
 
 		 458 aa  641    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5084  fumarate hydratase  72.81 
 
 		 458 aa  637    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209589  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0849  fumarate hydratase  72.83 
 
 		 448 aa  630  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4271  fumarate hydratase  71.27 
 
 		 458 aa  628  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01603  Fumarase  66.15 
 
 		 457 aa  624  1e-177  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00674477  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2108  fumarate hydratase  65.57 
 
 		 459 aa  597  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.866969  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0822  fumarate hydratase  65.2 
 
 		 457 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1738  fumarate hydratase  65.49 
 
 		 456 aa  580  1e-164  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1177  fumarate hydratase  63.96 
 
 		 461 aa  576  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.661179  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1650  fumarate hydratase  62.72 
 
 		 462 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  63.52 
 
 		 469 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002204  fumarate hydratase class II  63.52 
 
 		 461 aa  565  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  61.4 
 
 		 465 aa  561  1e-158  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00163  fumarate hydratase  63.26 
 
 		 461 aa  560  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  61.62 
 
 		 462 aa  546  1e-154  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0068  fumarate lyase  62.45 
 
 		 459 aa  542  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  59.42 
 
 		 469 aa  531  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1384  fumarate hydratase  57.71 
 
 		 464 aa  528  1e-149  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  59.69 
 
 		 475 aa  524  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  60.98 
 
 		 456 aa  519  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  58.24 
 
 		 469 aa  514  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  58.98 
 
 		 469 aa  517  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  57.17 
 
 		 460 aa  504  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1272  fumarate lyase  58.24 
 
 		 462 aa  498  1e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3405  fumarate hydratase  56.48 
 
 		 458 aa  497  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1441  fumarate lyase  54.01 
 
 		 461 aa  468  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2056  fumarate hydratase  54.95 
 
 		 469 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  53.29 
 
 		 463 aa  458  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0229  fumarate lyase  52 
 
 		 457 aa  451  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  51.64 
 
 		 464 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  51.66 
 
 		 463 aa  435  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  49.24 
 
 		 468 aa  433  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  49.46 
 
 		 472 aa  430  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  50 
 
 		 467 aa  426  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  48.9 
 
 		 462 aa  422  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  50.65 
 
 		 463 aa  420  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  49.12 
 
 		 459 aa  419  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  47.37 
 
 		 475 aa  414  1e-114  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  51.22 
 
 		 465 aa  414  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  47.15 
 
 		 469 aa  414  1e-114  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  47.37 
 
 		 468 aa  414  1e-114  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  51.89 
 
 		 464 aa  408  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  49.78 
 
 		 473 aa  409  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  47.92 
 
 		 469 aa  405  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  44.78 
 
 		 480 aa  404  1e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  49.89 
 
 		 472 aa  404  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  45.08 
 
 		 471 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  50.55 
 
 		 466 aa  402  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  50.56 
 
 		 465 aa  402  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  45.43 
 
 		 469 aa  404  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  48.25 
 
 		 473 aa  401  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  47.15 
 
 		 471 aa  399  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  48.9 
 
 		 464 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4649  fumarate hydratase  51.77 
 
 		 471 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456115 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  45.08 
 
 		 464 aa  397  1e-109  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2065  fumarate hydratase  50.55 
 
 		 469 aa  395  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0865781 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  49.45 
 
 		 466 aa  397  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  50 
 
 		 472 aa  395  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  45.39 
 
 		 459 aa  395  1e-108  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  49.24 
 
 		 475 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11119  fumarate hydratase  50.78 
 
 		 474 aa  392  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.954044 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05170  fumarate hydratase  49.02 
 
 		 473 aa  393  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3120  fumarate lyase  48.9 
 
 		 472 aa  392  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000941956  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4243  fumarate hydratase  49.78 
 
 		 466 aa  394  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0560645 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5854  fumarate lyase  49.2 
 
 		 440 aa  390  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2279  fumarate hydratase  46.27 
 
 		 465 aa  391  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  47.81 
 
 		 471 aa  390  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  44.81 
 
 		 464 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  45.03 
 
 		 464 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  45.18 
 
 		 459 aa  391  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0720  fumarate hydratase  49.56 
 
 		 464 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0935  fumarate lyase  49.67 
 
 		 476 aa  388  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  49.44 
 
 		 465 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01580  fumarate hydratase  46.29 
 
 		 467 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191338  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2032  fumarate hydratase, class II  46.29 
 
 		 467 aa  385  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000761073  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  48.48 
 
 		 464 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2320  fumarate hydratase  46.29 
 
 		 467 aa  386  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  46.51 
 
 		 467 aa  388  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  48.48 
 
 		 464 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  45.59 
 
 		 472 aa  388  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  48.48 
 
 		 464 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  45.18 
 
 		 461 aa  388  1e-106  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  48.48 
 
 		 464 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  48.48 
 
 		 464 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  45.59 
 
 		 472 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  48.48 
 
 		 631 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  48.48 
 
 		 464 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  46.05 
 
 		 474 aa  386  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01570  hypothetical protein  46.29 
 
 		 467 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.24852  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1985  fumarate hydratase  48.26 
 
 		 465 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1796  fumarate hydratase  46.29 
 
 		 467 aa  386  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.114122  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1832  fumarate hydratase  47.33 
 
 		 464 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.87946  hitchhiker  0.00222416 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>