More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1346 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2602  aspartate ammonia-lyase  98.32 
 
 
475 aa  916    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1258  aspartate ammonia-lyase  85.03 
 
 
481 aa  726    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.963292  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1245  aspartate ammonia-lyase  97.82 
 
 
475 aa  860    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.431098  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1346  aspartate ammonia-lyase  100 
 
 
475 aa  928    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1415  aspartate ammonia-lyase  56.43 
 
 
466 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24959e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2795  aspartate ammonia-lyase  55.77 
 
 
466 aa  491  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000791072  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3082  aspartate ammonia-lyase  57.21 
 
 
469 aa  479  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3556  aspartate ammonia-lyase  51.96 
 
 
471 aa  478  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0550  aspartate ammonia-lyase  56.33 
 
 
467 aa  473  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2695  fumarate lyase  49.12 
 
 
468 aa  462  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2689  aspartate ammonia-lyase  51.75 
 
 
476 aa  464  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0392115  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0940  aspartate ammonia-lyase  52.51 
 
 
467 aa  457  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0286202  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0479  aspartate ammonia-lyase  56.33 
 
 
463 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3341  fumarate lyase  51.71 
 
 
484 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.611164  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4762  fumarate lyase  50 
 
 
473 aa  445  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2500  fumarate lyase  54.45 
 
 
472 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  51.2 
 
 
467 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0925  fumarate lyase  51.28 
 
 
484 aa  438  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.751355  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  50.43 
 
 
472 aa  430  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4355  aspartate ammonia-lyase  48.25 
 
 
474 aa  429  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000233495  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03150  aspartate ammonia-lyase  45.32 
 
 
471 aa  427  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000322515  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  49.35 
 
 
468 aa  421  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0520  aspartate ammonia-lyase  43.54 
 
 
477 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270873  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0520  aspartate ammonia-lyase  43.54 
 
 
477 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1665  aspartate ammonia-lyase  43.89 
 
 
479 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0523  aspartate ammonia-lyase  43.54 
 
 
477 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442808  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2119  aspartate ammonia-lyase  52.25 
 
 
466 aa  417  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0665  aspartate ammonia-lyase  43.54 
 
 
477 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0151100000000002e-47 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0526  aspartate ammonia-lyase  44.64 
 
 
477 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0181392  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2667  fumarase  42.7 
 
 
479 aa  417  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.284725  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0677  aspartate ammonia-lyase  43.54 
 
 
477 aa  413  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0185443  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4691  aspartate ammonia-lyase  43.33 
 
 
477 aa  412  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000148862  hitchhiker  1.50426e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0576  aspartate ammonia-lyase  43.54 
 
 
477 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3530  aspartate ammonia-lyase  43.89 
 
 
479 aa  412  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0609  aspartate ammonia-lyase  43.54 
 
 
477 aa  413  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0736  aspartate ammonia-lyase  43.54 
 
 
477 aa  414  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0153519  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  49.13 
 
 
463 aa  409  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1667  aspartate ammonia-lyase  43.89 
 
 
479 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0778255  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0647  aspartate ammonia-lyase  43.11 
 
 
477 aa  408  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00115494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1800  aspartate ammonia-lyase  43.89 
 
 
479 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1921  aspartate ammonia-lyase  43.89 
 
 
479 aa  411  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1811  aspartate ammonia-lyase  43.89 
 
 
479 aa  410  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  49.13 
 
 
463 aa  409  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  47.98 
 
 
463 aa  411  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  49.13 
 
 
469 aa  410  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  49.1 
 
 
463 aa  408  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  48.65 
 
 
461 aa  402  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1872  aspartate ammonia-lyase  43.89 
 
 
479 aa  402  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1649  aspartate ammonia-lyase  43.89 
 
 
479 aa  402  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1614  aspartate ammonia-lyase  43.89 
 
 
479 aa  402  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1847  aspartate ammonia-lyase  43.89 
 
 
479 aa  402  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142722 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3115  aspartate ammonia-lyase  42.8 
 
 
476 aa  404  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  48.21 
 
 
461 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3135  aspartate ammonia-lyase  43.45 
 
 
476 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  47.43 
 
 
465 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  48.39 
 
 
463 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  47.76 
 
 
461 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  47.76 
 
 
461 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3215  fumarate hydratase, class II  48.99 
 
 
468 aa  396  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587959  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2883  aspartate ammonia-lyase  42.8 
 
 
476 aa  397  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2341  fumarate hydratase  46.65 
 
 
465 aa  396  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3158  aspartate ammonia-lyase  42.8 
 
 
476 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3455  aspartate ammonia-lyase  45.32 
 
 
470 aa  395  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025134  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  47.54 
 
 
474 aa  395  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  48.21 
 
 
470 aa  395  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2040  fumarate hydratase  46.88 
 
 
465 aa  396  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.938947  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2122  aspartate ammonia-lyase  42.8 
 
 
476 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2915  aspartate ammonia-lyase  42.58 
 
 
476 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2845  aspartate ammonia-lyase  43.04 
 
 
476 aa  394  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  47.64 
 
 
464 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  47.64 
 
 
464 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  47.64 
 
 
464 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  47.87 
 
 
631 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3136  aspartate ammonia-lyase  42.58 
 
 
476 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  47.64 
 
 
464 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  47.64 
 
 
464 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0162  aspartate ammonia-lyase  47.49 
 
 
484 aa  392  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  47.64 
 
 
464 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3758  fumarate lyase  46.49 
 
 
471 aa  389  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1958  aspartate ammonia-lyase  47.6 
 
 
483 aa  390  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.175554  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4326  fumarate lyase  45.76 
 
 
568 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705927  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0424  fumarate hydratase  41.74 
 
 
463 aa  389  1e-107  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1884  aspartate ammonia-lyase  47.6 
 
 
483 aa  390  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218686  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  47.26 
 
 
468 aa  391  1e-107  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  46.51 
 
 
462 aa  391  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  49.34 
 
 
463 aa  389  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3332  fumarase  47.71 
 
 
469 aa  389  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2137  fumarate hydratase  47.53 
 
 
465 aa  391  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  47.64 
 
 
464 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3958  fumarate lyase  45.89 
 
 
571 aa  391  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  47.28 
 
 
469 aa  385  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1152  fumarate lyase  45.08 
 
 
481 aa  388  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265028  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0149  fumarate hydratase  50 
 
 
460 aa  386  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2019  fumarate hydratase  46.29 
 
 
467 aa  385  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1818  fumarate hydratase  46.29 
 
 
467 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0435049  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1796  fumarate hydratase  46.29 
 
 
467 aa  386  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.114122  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  46.97 
 
 
464 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2320  fumarate hydratase  46.29 
 
 
467 aa  386  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109369  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  45.84 
 
 
466 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2438  aspartate ammonia-lyase  44.88 
 
 
466 aa  388  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.268607  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>