More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0162 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0162  aspartate ammonia-lyase  100 
 
 		 484 aa  973    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1240  aspartate ammonia-lyase  68.79 
 
 		 498 aa  655    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0519864  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0682  aspartate ammonia-lyase  59.06 
 
 		 472 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000328745  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0184  fumarate lyase  61.75 
 
 		 488 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1273  aspartate ammonia-lyase  61.42 
 
 		 476 aa  572  1.0000000000000001e-162  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000429353 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03150  aspartate ammonia-lyase  55.25 
 
 		 471 aa  546  1e-154  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000322515  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0474  aspartate ammonia-lyase  54.95 
 
 		 461 aa  518  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.180708  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4355  aspartate ammonia-lyase  53.65 
 
 		 474 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000233495  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2667  fumarase  50 
 
 		 479 aa  504  1e-141  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.284725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1665  aspartate ammonia-lyase  50.11 
 
 		 479 aa  486  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0526  aspartate ammonia-lyase  50.53 
 
 		 477 aa  483  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0181392  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1791  aspartate ammonia-lyase  55.34 
 
 		 475 aa  482  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2438  aspartate ammonia-lyase  50.85 
 
 		 466 aa  482  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.268607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1811  aspartate ammonia-lyase  49.68 
 
 		 479 aa  482  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0677  aspartate ammonia-lyase  49.68 
 
 		 477 aa  480  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0185443  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3455  aspartate ammonia-lyase  53.36 
 
 		 470 aa  481  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025134  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1667  aspartate ammonia-lyase  49.47 
 
 		 479 aa  481  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0778255  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0520  aspartate ammonia-lyase  49.68 
 
 		 477 aa  480  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.270873  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0520  aspartate ammonia-lyase  49.68 
 
 		 477 aa  479  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3530  aspartate ammonia-lyase  49.25 
 
 		 479 aa  479  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0523  aspartate ammonia-lyase  49.47 
 
 		 477 aa  479  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.442808  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1800  aspartate ammonia-lyase  49.47 
 
 		 479 aa  481  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3115  aspartate ammonia-lyase  48.94 
 
 		 476 aa  479  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1921  aspartate ammonia-lyase  49.47 
 
 		 479 aa  481  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0736  aspartate ammonia-lyase  49.68 
 
 		 477 aa  481  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0153519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0665  aspartate ammonia-lyase  49.68 
 
 		 477 aa  480  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0151100000000002e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0576  aspartate ammonia-lyase  49.68 
 
 		 477 aa  478  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0609  aspartate ammonia-lyase  49.68 
 
 		 477 aa  478  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.457701  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4691  aspartate ammonia-lyase  49.26 
 
 		 477 aa  477  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000148862  hitchhiker  1.50426e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0647  aspartate ammonia-lyase  49.47 
 
 		 477 aa  478  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00115494  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0481  aspartate ammonia-lyase  53.68 
 
 		 474 aa  474  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1389  aspartate ammonia-lyase  53.62 
 
 		 470 aa  473  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0123141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6431  aspartate ammonia-lyase  55.08 
 
 		 471 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2167  aspartate ammonia-lyase  50.76 
 
 		 480 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3758  fumarate lyase  52.19 
 
 		 471 aa  470  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1746  fumarate lyase  50.87 
 
 		 469 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2072  aspartate ammonia-lyase  54.78 
 
 		 471 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1630  aspartate ammonia-lyase  52.79 
 
 		 470 aa  468  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000961709  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24080  aspartate ammonia-lyase  51.39 
 
 		 505 aa  466  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5639  aspartate ammonia-lyase  50.75 
 
 		 479 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.611375  normal  0.502562 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0565  aspartate ammonia-lyase  53.33 
 
 		 521 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0355315 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1872  aspartate ammonia-lyase  49.68 
 
 		 479 aa  462  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2052  aspartate ammonia-lyase  47.79 
 
 		 485 aa  463  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0909745  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1649  aspartate ammonia-lyase  49.79 
 
 		 479 aa  462  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1614  aspartate ammonia-lyase  49.68 
 
 		 479 aa  462  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1905  fumarate lyase  50.33 
 
 		 475 aa  464  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3458  aspartate ammonia-lyase  52.72 
 
 		 468 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.882524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1847  aspartate ammonia-lyase  49.68 
 
 		 479 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000142722 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3135  aspartate ammonia-lyase  49.15 
 
 		 476 aa  462  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2915  aspartate ammonia-lyase  48.94 
 
 		 476 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1152  fumarate lyase  51.86 
 
 		 481 aa  459  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1663  aspartate ammonia-lyase  53.38 
 
 		 474 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.201173  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3136  aspartate ammonia-lyase  48.94 
 
 		 476 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4302  aspartate ammonia-lyase  52.51 
 
 		 468 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3544  fumarate lyase  51.42 
 
 		 471 aa  460  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4064  aspartate ammonia-lyase  52.51 
 
 		 468 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2883  aspartate ammonia-lyase  48.72 
 
 		 476 aa  458  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2845  aspartate ammonia-lyase  48.94 
 
 		 476 aa  457  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3158  aspartate ammonia-lyase  48.72 
 
 		 476 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3976  fumarate lyase  51.32 
 
 		 471 aa  455  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1643  aspartate ammonia-lyase  48.91 
 
 		 474 aa  458  1e-127  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1493  aspartate ammonia-lyase  53.06 
 
 		 471 aa  457  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2122  aspartate ammonia-lyase  48.51 
 
 		 476 aa  455  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0082  aspartate ammonia-lyase  48.07 
 
 		 468 aa  454  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0122  aspartate ammonia-lyase  48.07 
 
 		 468 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0094  aspartate ammonia-lyase  48.07 
 
 		 468 aa  453  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3082  aspartate ammonia-lyase  52.16 
 
 		 469 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0461  fumarate lyase  51.59 
 
 		 507 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1293  aspartate ammonia-lyase  54.25 
 
 		 468 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0277144  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1984  aspartate ammonia-lyase  53.15 
 
 		 468 aa  450  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3964  aspartate ammonia-lyase  53.16 
 
 		 468 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256806 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5752  aspartate ammonia-lyase  52.03 
 
 		 475 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555308  normal  0.129771 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3457  aspartate ammonia-lyase  52.72 
 
 		 468 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1299  fumarate lyase  54 
 
 		 479 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160462  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4435  fumarate lyase  50.76 
 
 		 560 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0391  thiamine biosynthesis protein ThiC  46.54 
 
 		 466 aa  445  1.0000000000000001e-124  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1415  aspartate ammonia-lyase  50.65 
 
 		 466 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.24959e-23 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0827  fumarate lyase  50.76 
 
 		 483 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1842  aspartate ammonia-lyase  51.8 
 
 		 470 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.470629  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0092  fumarate lyase  47.65 
 
 		 472 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2083  aspartate ammonia-lyase  50.98 
 
 		 475 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195347  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2177  aspartate ammonia-lyase  50.76 
 
 		 475 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0940  aspartate ammonia-lyase  50 
 
 		 467 aa  442  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0286202  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2795  aspartate ammonia-lyase  49.78 
 
 		 466 aa  444  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000791072  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0356  fumarate lyase  51.63 
 
 		 481 aa  444  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5338  aspartate ammonia-lyase  50.43 
 
 		 478 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486768 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5499  aspartate ammonia-lyase  50 
 
 		 474 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5247  aspartate ammonia-lyase  50.43 
 
 		 478 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0371805  normal  0.169068 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3958  fumarate lyase  49.67 
 
 		 571 aa  436  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2009  aspartate ammonia-lyase  47.61 
 
 		 476 aa  437  1e-121  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4326  fumarate lyase  49.89 
 
 		 568 aa  438  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705927  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0140  aspartate ammonia-lyase  46.78 
 
 		 470 aa  435  1e-121  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0135  aspartate ammonia-lyase  50.65 
 
 		 485 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0939  aspartate ammonia-lyase  52.61 
 
 		 468 aa  437  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5387  aspartate ammonia-lyase  50.22 
 
 		 485 aa  435  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_004310  BR1958  aspartate ammonia-lyase  50.45 
 
 		 483 aa  434  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.175554  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5051  aspartate ammonia-lyase  50 
 
 		 474 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1884  aspartate ammonia-lyase  50.45 
 
 		 483 aa  434  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0218686  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2124  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  46 
 
 		 471 aa  435  1e-120  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000051294  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6217  aspartate ammonia-lyase  50.11 
 
 		 474 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.946627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>