More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0721 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001306  ANIA_09180  conserved hypothetical protein  59.62 
 
 
640 aa  781    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00040  transketolase, putative  59.78 
 
 
673 aa  785    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.214798  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4506  Transketolase domain protein  74.69 
 
 
637 aa  1021    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4061  Transketolase domain protein  79.09 
 
 
637 aa  1077    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0721  transketolase-like  100 
 
 
636 aa  1317    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953782  normal  0.877406 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1062  transketolase  28.19 
 
 
635 aa  187  5e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1050  transketolase  28.19 
 
 
635 aa  187  5e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1302  transketolase  26.97 
 
 
653 aa  173  9e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0226315  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  28.45 
 
 
623 aa  170  8e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  25.84 
 
 
640 aa  160  7e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1946  transketolase  26.27 
 
 
631 aa  157  8e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120337  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  27.95 
 
 
618 aa  155  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1130  Transketolase central region  27.65 
 
 
648 aa  155  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  26.31 
 
 
624 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  26.04 
 
 
621 aa  126  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  25.65 
 
 
629 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36720  transketolase  25.22 
 
 
614 aa  124  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148891  normal  0.641961 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  26.25 
 
 
630 aa  120  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  25.04 
 
 
606 aa  118  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  25.29 
 
 
689 aa  111  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  26.2 
 
 
592 aa  109  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0049  transketolase  25.14 
 
 
626 aa  109  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1278  transketolase  24.64 
 
 
624 aa  108  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  24.03 
 
 
662 aa  102  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  31.17 
 
 
276 aa  101  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  31.17 
 
 
276 aa  101  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3249  putative transketolase. N-terminal subunit  30.77 
 
 
276 aa  99  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  29.3 
 
 
276 aa  98.6  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  28.44 
 
 
310 aa  95.9  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0889  transketolase  23.35 
 
 
672 aa  94  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1933  transketolase  24.19 
 
 
656 aa  94  8e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3317  transketolase  24.18 
 
 
612 aa  94  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  26.44 
 
 
315 aa  93.6  9e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5275  transketolase, central region  28.21 
 
 
335 aa  93.6  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00940  conserved hypothetical protein  21.77 
 
 
687 aa  92.8  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.292242  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2448  transketolase  22.55 
 
 
680 aa  92.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.574393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4832  transketolase  24.04 
 
 
639 aa  92.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2123  transketolase  22.97 
 
 
627 aa  92.8  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  26.22 
 
 
312 aa  92  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  22.96 
 
 
666 aa  91.7  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  28.79 
 
 
278 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2718  transketolase subunit B  25.99 
 
 
340 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  27.84 
 
 
314 aa  89.4  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0444  Transketolase central region  24.91 
 
 
636 aa  89.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  26.23 
 
 
314 aa  87  8e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  31.17 
 
 
273 aa  86.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  24.26 
 
 
663 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0315  transketolase  33.62 
 
 
665 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0116  transketolase  28.46 
 
 
634 aa  85.5  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.984177  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1601  transketolase  23.19 
 
 
672 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0069  transketolase  28.8 
 
 
633 aa  85.9  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.317261  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2804  transketolase  23.07 
 
 
665 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1738  transketolase  22.22 
 
 
657 aa  85.5  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.516537  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14410  transketolase  23.13 
 
 
660 aa  84.7  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2744  transketolase central region  28.94 
 
 
342 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0728122  normal  0.0592981 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  26.71 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03290  transketolase  22.78 
 
 
661 aa  84  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15980  transketolase  23.75 
 
 
699 aa  84.3  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0310968  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0565  transketolase  22.53 
 
 
662 aa  84  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1587  transketolase, N-terminal subunit  30.54 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2005  transketolase  28.14 
 
 
632 aa  83.2  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3391  transketolase  21.98 
 
 
699 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0869549  hitchhiker  0.000451317 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4778  transketolase subunit B  25.34 
 
 
332 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  21.73 
 
 
661 aa  83.2  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2956  transketolase  23.03 
 
 
672 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  26.79 
 
 
322 aa  83.6  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0561  transketolase  23.73 
 
 
661 aa  82.4  0.00000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1700  transketolase  22.53 
 
 
671 aa  82.8  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.117388  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2903  transketolase  31.3 
 
 
711 aa  82  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000161618 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0202  transketolase  24.63 
 
 
636 aa  82  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3805  transketolase  22.26 
 
 
665 aa  81.6  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.496968 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0227  transketolase  21.51 
 
 
657 aa  82  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0338  transketolase  27.24 
 
 
639 aa  81.6  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.025251  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1462  transketolase subunit B  25.23 
 
 
332 aa  81.6  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0261  Transketolase central region  28.73 
 
 
339 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.885505 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  29.96 
 
 
280 aa  81.6  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2367  Transketolase central region  27.84 
 
 
339 aa  81.3  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  0.0327946 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0718  transketolase, central region  25.99 
 
 
334 aa  81.3  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  27.9 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1735  transketolase  28.06 
 
 
636 aa  81.3  0.00000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00492424  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2092  transketolase central region  27.84 
 
 
339 aa  81.3  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  21.7 
 
 
665 aa  80.9  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17580  transketolase  24.53 
 
 
622 aa  80.9  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.569597  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1817  transketolase  27.41 
 
 
632 aa  80.5  0.00000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1146  Transketolase domain protein  28.35 
 
 
319 aa  80.9  0.00000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4383  Transketolase central region  28.25 
 
 
342 aa  80.5  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0967269  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1636  transketolase  27.41 
 
 
632 aa  80.5  0.00000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  24.77 
 
 
317 aa  80.1  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  30.3 
 
 
277 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0278  transketolase  23.44 
 
 
661 aa  80.1  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  29.44 
 
 
276 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  22.01 
 
 
664 aa  79.7  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  30 
 
 
286 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  31.12 
 
 
273 aa  79.3  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2599  transketolase  22.67 
 
 
672 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000286494 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0069  transketolase  22.96 
 
 
636 aa  79  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.874951  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0249  transketolase  21.63 
 
 
664 aa  78.6  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0178  transketolase  23.8 
 
 
668 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  31.06 
 
 
274 aa  79  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1127  transketolase  22.91 
 
 
692 aa  78.6  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0296008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>