More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0491 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  100 
 
 		 276 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  82.85 
 
 		 286 aa  479  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  79.56 
 
 		 277 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  80.44 
 
 		 274 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  80.07 
 
 		 274 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  65.93 
 
 		 273 aa  376  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  62.22 
 
 		 271 aa  358  5e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  65.19 
 
 		 271 aa  346  3e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  60.84 
 
 		 273 aa  344  7e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  60.53 
 
 		 275 aa  340  2e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  59.26 
 
 		 277 aa  339  2.9999999999999998e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  61.48 
 
 		 271 aa  339  2.9999999999999998e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  60.45 
 
 		 272 aa  339  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  57.3 
 
 		 282 aa  327  1.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  60.97 
 
 		 273 aa  321  9.999999999999999e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  56.83 
 
 		 274 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  56.46 
 
 		 274 aa  319  3.9999999999999996e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  57.79 
 
 		 269 aa  317  1e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  53.6 
 
 		 286 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  54.81 
 
 		 281 aa  310  1e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  54.28 
 
 		 281 aa  311  1e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  58.71 
 
 		 279 aa  307  1.0000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  55.17 
 
 		 275 aa  298  5e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  54.31 
 
 		 272 aa  296  2e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  53.58 
 
 		 273 aa  296  3e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  54.41 
 
 		 275 aa  295  4e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  56.98 
 
 		 279 aa  295  6e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  53.75 
 
 		 284 aa  295  8e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  55.04 
 
 		 275 aa  295  8e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  58.87 
 
 		 278 aa  287  1e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  54.79 
 
 		 275 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  51.67 
 
 		 689 aa  284  9e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  52.49 
 
 		 275 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  51.65 
 
 		 297 aa  281  8.000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  50.36 
 
 		 303 aa  277  1e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  50.54 
 
 		 303 aa  269  4e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  52.14 
 
 		 309 aa  268  8e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  49.43 
 
 		 279 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  48.85 
 
 		 265 aa  262  4.999999999999999e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  50.71 
 
 		 303 aa  261  1e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  48.73 
 
 		 297 aa  259  4e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  48.85 
 
 		 273 aa  257  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1184  Transketolase domain protein  50.9 
 
 		 305 aa  256  2e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  47.29 
 
 		 280 aa  253  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  46.04 
 
 		 276 aa  251  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  47.1 
 
 		 301 aa  250  2e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  49.22 
 
 		 280 aa  248  8e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  45.56 
 
 		 277 aa  246  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  43.62 
 
 		 555 aa  246  3e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  45.15 
 
 		 274 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  49.25 
 
 		 606 aa  241  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  49 
 
 		 291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0874  Transketolase domain protein  46.72 
 
 		 281 aa  239  4e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  hitchhiker  0.00151524 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1017  transketolase subunit A  48.74 
 
 		 303 aa  236  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  44.72 
 
 		 297 aa  235  6e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  45.65 
 
 		 624 aa  234  8e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  46.01 
 
 		 278 aa  231  9e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  46.64 
 
 		 280 aa  231  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  43.18 
 
 		 288 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00870  transketolase, N-terminal subunit  46.04 
 
 		 293 aa  229  3e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  43.3 
 
 		 271 aa  226  2e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  43.14 
 
 		 289 aa  226  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  44.27 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  42.75 
 
 		 294 aa  225  7e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  45.35 
 
 		 263 aa  225  7e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  40.86 
 
 		 276 aa  225  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2843  transketolase subunit A  42.4 
 
 		 276 aa  223  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.140333  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2582  transketolase domain-containing protein  40.86 
 
 		 276 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  43.4 
 
 		 269 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2527  transketolase domain protein  40.86 
 
 		 276 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.336828 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  46.01 
 
 		 302 aa  222  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2482  transketolase domain protein  40.86 
 
 		 276 aa  221  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0861  Transketolase domain protein  43.75 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2570  transketolase domain protein  40.47 
 
 		 276 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.479984  normal  0.537174 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2936  Transketolase domain protein  44.24 
 
 		 285 aa  221  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2719  transketolase subunit A  43.7 
 
 		 282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1540  transketolase domain-containing protein  44.28 
 
 		 282 aa  219  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.220485  normal  0.477158 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  45.35 
 
 		 283 aa  218  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  43.56 
 
 		 280 aa  218  8.999999999999998e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  44.07 
 
 		 282 aa  217  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5276  transketolase domain-containing protein  43.82 
 
 		 282 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  43.02 
 
 		 270 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  43.07 
 
 		 276 aa  217  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  43.38 
 
 		 623 aa  217  2e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  42.48 
 
 		 281 aa  216  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3617  transketolase-like  42.16 
 
 		 281 aa  215  5e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.868014  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4274  transketolase domain-containing protein  42.96 
 
 		 287 aa  215  5.9999999999999996e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4931  transketolase domain-containing protein  44.15 
 
 		 281 aa  215  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  43.32 
 
 		 277 aa  214  9e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  42.26 
 
 		 278 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2614  transketolase domain-containing protein  43.01 
 
 		 285 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.336925  normal  0.70131 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3311  Transketolase domain protein  44.19 
 
 		 279 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  42.26 
 
 		 269 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4990  transketolase domain-containing protein  42.44 
 
 		 281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3642  transketolase domain-containing protein  42.16 
 
 		 281 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0863468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4382  Transketolase domain protein  42.32 
 
 		 285 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  43.2 
 
 		 276 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  41.5 
 
 		 281 aa  211  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4412  transketolase domain-containing protein  43.02 
 
 		 281 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0693677 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  43.2 
 
 		 276 aa  211  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>