More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0299 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  100 
 
 		 555 aa  1146    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  49.64 
 
 		 277 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  51.84 
 
 		 273 aa  274  3e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  50.19 
 
 		 281 aa  273  8.000000000000001e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  48.04 
 
 		 271 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  48.88 
 
 		 271 aa  268  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  51.52 
 
 		 274 aa  268  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  51.52 
 
 		 274 aa  268  2e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  50.19 
 
 		 284 aa  266  8e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  49.24 
 
 		 275 aa  266  1e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  49.12 
 
 		 273 aa  263  4.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  47.75 
 
 		 282 aa  262  1e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  46.91 
 
 		 272 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  48.47 
 
 		 269 aa  260  4e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  50.75 
 
 		 271 aa  259  8e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  46.91 
 
 		 279 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  45.79 
 
 		 281 aa  251  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  46.1 
 
 		 274 aa  250  5e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  44.2 
 
 		 277 aa  249  7e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  44.2 
 
 		 286 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  44.98 
 
 		 274 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  43.62 
 
 		 276 aa  246  8e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  48.5 
 
 		 272 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  45.36 
 
 		 273 aa  243  6e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  44.4 
 
 		 275 aa  239  1e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  45.58 
 
 		 286 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  44.04 
 
 		 275 aa  236  9e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  45.83 
 
 		 275 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  43.68 
 
 		 275 aa  233  6e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  44.03 
 
 		 297 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  41.9 
 
 		 273 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  42.55 
 
 		 279 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  43.66 
 
 		 281 aa  224  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  43 
 
 		 279 aa  223  6e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  43.53 
 
 		 689 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  43.35 
 
 		 275 aa  216  9e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  45.52 
 
 		 278 aa  214  2.9999999999999995e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  42.42 
 
 		 265 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  40.97 
 
 		 297 aa  213  7.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  41.88 
 
 		 630 aa  212  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  42.01 
 
 		 624 aa  211  4e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  42.8 
 
 		 629 aa  207  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  39.01 
 
 		 276 aa  206  8e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  39.23 
 
 		 277 aa  206  9e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  41.22 
 
 		 280 aa  205  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  40.14 
 
 		 274 aa  204  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  39.3 
 
 		 309 aa  204  5e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  41.98 
 
 		 280 aa  203  7e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  38.76 
 
 		 291 aa  197  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  39.62 
 
 		 273 aa  196  7e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  38.25 
 
 		 303 aa  196  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  42.12 
 
 		 623 aa  196  1e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  39.93 
 
 		 621 aa  195  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  38.57 
 
 		 303 aa  195  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  37.54 
 
 		 297 aa  193  6e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0861  Transketolase domain protein  39.78 
 
 		 299 aa  193  7e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  37.85 
 
 		 288 aa  193  8e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  40.21 
 
 		 278 aa  192  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  39.77 
 
 		 277 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  38.57 
 
 		 301 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  42.59 
 
 		 271 aa  191  4e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  40.61 
 
 		 618 aa  189  1e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  36.19 
 
 		 289 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1576  Transketolase domain protein  39.36 
 
 		 280 aa  189  1e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  37.79 
 
 		 311 aa  187  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0049  transketolase  42.08 
 
 		 626 aa  187  5e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  37.41 
 
 		 303 aa  186  8e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  36.16 
 
 		 294 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  37.41 
 
 		 280 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  37.74 
 
 		 276 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3317  transketolase  38.82 
 
 		 612 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  39.77 
 
 		 302 aa  184  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  35.77 
 
 		 263 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  39.1 
 
 		 640 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2527  transketolase domain protein  37.74 
 
 		 276 aa  183  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.336828 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2582  transketolase domain-containing protein  37.74 
 
 		 276 aa  183  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  38.91 
 
 		 278 aa  183  6e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  39.35 
 
 		 280 aa  183  7e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2482  transketolase domain protein  37.74 
 
 		 276 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0976  Transketolase domain protein  38.08 
 
 		 285 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160297  normal  0.0621663 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1017  transketolase subunit A  38.43 
 
 		 303 aa  182  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2570  transketolase domain protein  37.36 
 
 		 276 aa  181  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.479984  normal  0.537174 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  37.63 
 
 		 281 aa  180  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00870  transketolase, N-terminal subunit  36.46 
 
 		 293 aa  180  5.999999999999999e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  35.99 
 
 		 269 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1946  transketolase  39.48 
 
 		 631 aa  179  8e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120337  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  37.99 
 
 		 269 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  38.21 
 
 		 606 aa  179  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  38.32 
 
 		 282 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2843  transketolase subunit A  35.61 
 
 		 276 aa  177  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.140333  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  33.45 
 
 		 270 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1184  Transketolase domain protein  38.49 
 
 		 305 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36720  transketolase  38.55 
 
 		 614 aa  173  6.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148891  normal  0.641961 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0048  transketolase domain-containing protein  37.06 
 
 		 282 aa  172  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0199  transketolase, N-terminal subunit  35.13 
 
 		 285 aa  171  3e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2569  transketolase domain-containing protein  37.12 
 
 		 274 aa  170  7e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.818868  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1405  transketolase, N-terminal subunit  36.74 
 
 		 274 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0485519  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2516  transketolase domain-containing protein  36.74 
 
 		 274 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.499575  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2131  transketolase, N-terminal subunit  36.74 
 
 		 274 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.805825  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3183  transketolase, N-terminal subunit  36.74 
 
 		 274 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>