More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4382 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4382  Transketolase domain protein  100 
 
 		 285 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2745  transketolase domain-containing protein  94.76 
 
 		 286 aa  532  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.498347  normal  0.112141 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2091  transketolase domain-containing protein  89.05 
 
 		 286 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2366  Transketolase domain protein  89.05 
 
 		 286 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.95971  normal  0.0469073 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0260  Transketolase domain protein  86.12 
 
 		 286 aa  497  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.509651 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3002  transketolase domain-containing protein  85.92 
 
 		 287 aa  488  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2719  transketolase subunit A  73.8 
 
 		 282 aa  424  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4990  transketolase domain-containing protein  73.8 
 
 		 281 aa  418  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4931  transketolase domain-containing protein  74.44 
 
 		 281 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4412  transketolase domain-containing protein  74.07 
 
 		 281 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0693677 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1540  transketolase domain-containing protein  75.74 
 
 		 282 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.220485  normal  0.477158 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6423  transketolase-like  73.7 
 
 		 281 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6256  transketolase domain-containing protein  74.07 
 
 		 281 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6658  transketolase domain-containing protein  73.7 
 
 		 281 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5276  transketolase domain-containing protein  72.49 
 
 		 282 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4777  transketolase, N-terminal  72.96 
 
 		 281 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5877  transketolase domain-containing protein  73.03 
 
 		 283 aa  408  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0717  transketolase domain-containing protein  77.61 
 
 		 298 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4274  transketolase domain-containing protein  70.25 
 
 		 287 aa  403  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1461  transketolase subunit A  73.21 
 
 		 279 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6138  Transketolase domain protein  73.61 
 
 		 281 aa  394  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2614  transketolase domain-containing protein  70.18 
 
 		 285 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.336925  normal  0.70131 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3311  Transketolase domain protein  70.48 
 
 		 279 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3268  transketolase subunit A  74.35 
 
 		 282 aa  383  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.586745 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0728  transketolase domain-containing protein  71.59 
 
 		 286 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3617  transketolase-like  64.47 
 
 		 281 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.868014  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3642  transketolase domain-containing protein  65.93 
 
 		 281 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0863468 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1716  Transketolase domain protein  66.17 
 
 		 293 aa  343  1e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0407  Transketolase domain protein  60.28 
 
 		 307 aa  343  2e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3957  transketolase subunit A  62.41 
 
 		 302 aa  340  1e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132979  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3348  Transketolase domain protein  61.45 
 
 		 284 aa  310  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0304302  normal  0.0226218 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2507  Transketolase domain protein  62.36 
 
 		 291 aa  278  5e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1712  transketolase domain-containing protein  50.19 
 
 		 278 aa  255  5e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.605917  normal  0.0338585 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  43.77 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  42.32 
 
 		 276 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  43.98 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  45.53 
 
 		 273 aa  209  6e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  42.48 
 
 		 286 aa  207  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0900  transketolase domain-containing protein  45.79 
 
 		 296 aa  206  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  41.35 
 
 		 277 aa  199  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  42.8 
 
 		 271 aa  199  6e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  39.39 
 
 		 274 aa  198  7e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  39.77 
 
 		 274 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2288  transketolase domain-containing protein  41.98 
 
 		 268 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  39.71 
 
 		 279 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  40.5 
 
 		 281 aa  190  2e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  42.07 
 
 		 275 aa  190  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  41.27 
 
 		 284 aa  188  8e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  40 
 
 		 273 aa  188  9e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  36.4 
 
 		 291 aa  187  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  42.39 
 
 		 273 aa  186  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  39.85 
 
 		 277 aa  186  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  40.84 
 
 		 275 aa  186  5e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  39.47 
 
 		 282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  40.91 
 
 		 279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  36.6 
 
 		 272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  39.86 
 
 		 303 aa  180  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  39.64 
 
 		 297 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  41.85 
 
 		 283 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  38.7 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  39.55 
 
 		 277 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  37.75 
 
 		 280 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  37.28 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  41.94 
 
 		 297 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  42.34 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  36.19 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  38.31 
 
 		 274 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  38.41 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  40.85 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  39.46 
 
 		 302 aa  176  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  39.33 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  38.27 
 
 		 303 aa  176  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  39.42 
 
 		 301 aa  176  5e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  36.3 
 
 		 269 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  43.66 
 
 		 279 aa  175  6e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  35.16 
 
 		 275 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  42.11 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  36.8 
 
 		 269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  40.64 
 
 		 278 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  34.8 
 
 		 275 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0874  Transketolase domain protein  38.15 
 
 		 281 aa  172  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  hitchhiker  0.00151524 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  38.52 
 
 		 689 aa  170  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1587  transketolase, N-terminal subunit  38.78 
 
 		 252 aa  170  3e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  34.8 
 
 		 275 aa  169  4e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  36.4 
 
 		 289 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  36.9 
 
 		 280 aa  169  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  37.69 
 
 		 273 aa  169  6e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  39.59 
 
 		 269 aa  168  8e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  37.78 
 
 		 606 aa  167  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  37.02 
 
 		 281 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  37.86 
 
 		 281 aa  167  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0615  transketolase subunit A  34.46 
 
 		 268 aa  166  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  37.85 
 
 		 276 aa  166  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  35.93 
 
 		 276 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  39.43 
 
 		 276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  39.43 
 
 		 276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  40 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3249  putative transketolase. N-terminal subunit  39.43 
 
 		 276 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0976  Transketolase domain protein  37.55 
 
 		 285 aa  163  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160297  normal  0.0621663 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  35.85 
 
 		 288 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>