More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4412 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4412  transketolase domain-containing protein  100 
 
 		 281 aa  580  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0693677 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4931  transketolase domain-containing protein  97.86 
 
 		 281 aa  567  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6256  transketolase domain-containing protein  96.09 
 
 		 281 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6423  transketolase-like  95.37 
 
 		 281 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6658  transketolase domain-containing protein  95.37 
 
 		 281 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4990  transketolase domain-containing protein  90.75 
 
 		 281 aa  533  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4777  transketolase, N-terminal  85.41 
 
 		 281 aa  501  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5877  transketolase domain-containing protein  84.75 
 
 		 283 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6138  Transketolase domain protein  86.57 
 
 		 281 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2719  transketolase subunit A  74.07 
 
 		 282 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1540  transketolase domain-containing protein  75.46 
 
 		 282 aa  421  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.220485  normal  0.477158 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5276  transketolase domain-containing protein  73.13 
 
 		 282 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4382  Transketolase domain protein  74.07 
 
 		 285 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2366  Transketolase domain protein  74.44 
 
 		 286 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.95971  normal  0.0469073 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2091  transketolase domain-containing protein  74.44 
 
 		 286 aa  413  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3268  transketolase subunit A  75.44 
 
 		 282 aa  404  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.586745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0260  Transketolase domain protein  71.48 
 
 		 286 aa  403  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.509651 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3002  transketolase domain-containing protein  70.74 
 
 		 287 aa  394  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2745  transketolase domain-containing protein  73.7 
 
 		 286 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.498347  normal  0.112141 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0717  transketolase domain-containing protein  71.27 
 
 		 298 aa  385  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4274  transketolase domain-containing protein  68.95 
 
 		 287 aa  386  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1461  transketolase subunit A  69.37 
 
 		 279 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.297998 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0728  transketolase domain-containing protein  68.46 
 
 		 286 aa  378  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3311  Transketolase domain protein  69.08 
 
 		 279 aa  370  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3617  transketolase-like  65.3 
 
 		 281 aa  373  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.868014  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2614  transketolase domain-containing protein  68 
 
 		 285 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.336925  normal  0.70131 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3642  transketolase domain-containing protein  64.18 
 
 		 281 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0863468 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0407  Transketolase domain protein  62.26 
 
 		 307 aa  340  1e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3957  transketolase subunit A  63.4 
 
 		 302 aa  334  1e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132979  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1716  Transketolase domain protein  62.92 
 
 		 293 aa  324  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3348  Transketolase domain protein  62.22 
 
 		 284 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0304302  normal  0.0226218 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2507  Transketolase domain protein  61.98 
 
 		 291 aa  281  6.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1712  transketolase domain-containing protein  44.75 
 
 		 278 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.605917  normal  0.0338585 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  46.69 
 
 		 271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  43.02 
 
 		 276 aa  211  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  42.18 
 
 		 286 aa  209  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  40.6 
 
 		 273 aa  203  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  42.29 
 
 		 281 aa  203  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  43.24 
 
 		 272 aa  198  7e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  42.97 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  38.95 
 
 		 282 aa  193  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  40.53 
 
 		 274 aa  192  5e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  40 
 
 		 277 aa  192  7e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  40.53 
 
 		 274 aa  192  7e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  41.42 
 
 		 275 aa  191  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  39.43 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  41.64 
 
 		 273 aa  189  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  39.78 
 
 		 269 aa  189  5e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  45.45 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  41.77 
 
 		 284 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0900  transketolase domain-containing protein  43.28 
 
 		 296 aa  185  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  38.97 
 
 		 279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2288  transketolase domain-containing protein  39.92 
 
 		 268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  39.71 
 
 		 277 aa  183  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  41.09 
 
 		 275 aa  183  3e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  40.93 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  43.19 
 
 		 303 aa  179  4e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  39.39 
 
 		 279 aa  179  4.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  41.37 
 
 		 281 aa  179  5.999999999999999e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  35.87 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  40.32 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  40.32 
 
 		 274 aa  176  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  38.72 
 
 		 273 aa  175  6e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  40.41 
 
 		 301 aa  175  7e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  35.53 
 
 		 280 aa  175  8e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  40.39 
 
 		 297 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  37.69 
 
 		 273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  41.94 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  38.83 
 
 		 309 aa  172  3.9999999999999995e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  43.37 
 
 		 278 aa  172  5.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  40.82 
 
 		 279 aa  172  6.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  40.48 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  35.21 
 
 		 291 aa  169  5e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  36.55 
 
 		 277 aa  169  5e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  34.94 
 
 		 288 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  36.51 
 
 		 277 aa  168  7e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  37.69 
 
 		 280 aa  168  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  41.59 
 
 		 689 aa  168  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0874  Transketolase domain protein  35.51 
 
 		 281 aa  168  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  hitchhiker  0.00151524 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  36.47 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  36.8 
 
 		 276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  38.98 
 
 		 280 aa  165  6.9999999999999995e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  39.47 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  34.96 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  37 
 
 		 280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  37.97 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  37.04 
 
 		 302 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  35.38 
 
 		 263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0976  Transketolase domain protein  37.05 
 
 		 285 aa  162  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160297  normal  0.0621663 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  34.96 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  37.13 
 
 		 278 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  33.96 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  34.69 
 
 		 269 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  34.59 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  34.11 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  35.51 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0615  transketolase subunit A  33.21 
 
 		 268 aa  159  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2843  transketolase subunit A  36.98 
 
 		 276 aa  158  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.140333  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  34.24 
 
 		 281 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  34.59 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>