More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0339 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  100 
 
 		 280 aa  581  1.0000000000000001e-165  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  58.58 
 
 		 271 aa  276  3e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  52.4 
 
 		 272 aa  275  7e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  50.92 
 
 		 271 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  52.21 
 
 		 271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  51.48 
 
 		 273 aa  257  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  50.19 
 
 		 274 aa  257  2e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  50.19 
 
 		 274 aa  257  2e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  48.33 
 
 		 276 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  49.81 
 
 		 275 aa  253  3e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  45.56 
 
 		 281 aa  249  4e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  47.57 
 
 		 273 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  47.39 
 
 		 282 aa  245  6e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  48.09 
 
 		 275 aa  244  9.999999999999999e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  47.78 
 
 		 286 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  46.64 
 
 		 277 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  46.35 
 
 		 272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  50 
 
 		 279 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  45.09 
 
 		 275 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  45.96 
 
 		 277 aa  239  4e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  45.09 
 
 		 275 aa  239  4e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  47.15 
 
 		 274 aa  239  5e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  46.77 
 
 		 274 aa  239  5e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  45.04 
 
 		 286 aa  236  4e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  46.69 
 
 		 279 aa  236  4e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  44 
 
 		 275 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  44.78 
 
 		 279 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  48.35 
 
 		 278 aa  231  7.000000000000001e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  45.72 
 
 		 269 aa  229  4e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  44.65 
 
 		 273 aa  228  7e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  42.29 
 
 		 275 aa  224  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  43.57 
 
 		 297 aa  223  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  45.96 
 
 		 606 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  43.51 
 
 		 281 aa  218  6e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  46.06 
 
 		 284 aa  214  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  43.12 
 
 		 297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  43.37 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  43.12 
 
 		 273 aa  209  3e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  41.97 
 
 		 269 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  40.65 
 
 		 303 aa  208  7e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  42.29 
 
 		 301 aa  206  5e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  43.31 
 
 		 309 aa  205  6e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  43.89 
 
 		 629 aa  205  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0976  Transketolase domain protein  40.22 
 
 		 285 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160297  normal  0.0621663 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  41.98 
 
 		 555 aa  204  2e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  40.37 
 
 		 265 aa  202  4e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  41.73 
 
 		 281 aa  202  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  41.76 
 
 		 630 aa  201  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  42.65 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  44.21 
 
 		 297 aa  200  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  41.11 
 
 		 269 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3317  transketolase  45.04 
 
 		 612 aa  198  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  39.02 
 
 		 689 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1184  Transketolase domain protein  41.9 
 
 		 305 aa  196  3e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  40.88 
 
 		 621 aa  196  5.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  42.15 
 
 		 624 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0874  Transketolase domain protein  40 
 
 		 281 aa  191  9e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  hitchhiker  0.00151524 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  41.18 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  40.83 
 
 		 291 aa  190  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  40.91 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1017  transketolase subunit A  42.45 
 
 		 303 aa  189  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  40.4 
 
 		 311 aa  188  7e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0049  transketolase  38.91 
 
 		 626 aa  188  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  41.24 
 
 		 623 aa  186  3e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  39.34 
 
 		 288 aa  186  4e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2843  transketolase subunit A  38.27 
 
 		 276 aa  182  6e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.140333  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  37.64 
 
 		 270 aa  182  6e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  41.67 
 
 		 277 aa  181  8.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  39.83 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  37.59 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  39.64 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1278  transketolase  39.93 
 
 		 624 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00870  transketolase, N-terminal subunit  41.38 
 
 		 293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0615  transketolase subunit A  39.17 
 
 		 268 aa  179  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  36.63 
 
 		 294 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  37.7 
 
 		 289 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2482  transketolase domain protein  37.45 
 
 		 276 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2936  Transketolase domain protein  38.79 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1576  Transketolase domain protein  39.05 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  37.45 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  39.69 
 
 		 618 aa  176  3e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36720  transketolase  41.06 
 
 		 614 aa  176  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148891  normal  0.641961 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1946  transketolase  40.51 
 
 		 631 aa  176  5e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120337  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2307  transketolase  39.07 
 
 		 662 aa  176  5e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0505074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  38.46 
 
 		 276 aa  176  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2582  transketolase domain-containing protein  37.04 
 
 		 276 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  40.15 
 
 		 280 aa  175  8e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2527  transketolase domain protein  37.04 
 
 		 276 aa  175  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.336828 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5877  transketolase domain-containing protein  39.41 
 
 		 283 aa  175  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1050  transketolase  39.05 
 
 		 635 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  40.69 
 
 		 302 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1062  transketolase  39.05 
 
 		 635 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  36.19 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2570  transketolase domain protein  37.04 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.479984  normal  0.537174 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  38.04 
 
 		 280 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2569  transketolase domain-containing protein  42.21 
 
 		 274 aa  171  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.818868  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1629  transketolase, N-terminal subunit  42.21 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.788603  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1405  transketolase, N-terminal subunit  42.21 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0485519  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2131  transketolase, N-terminal subunit  42.21 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.805825  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3183  transketolase, N-terminal subunit  42.21 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>