More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3075 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  100 
 
 		 271 aa  553  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  69.26 
 
 		 272 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  72.32 
 
 		 271 aa  396  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  70.72 
 
 		 273 aa  391  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  68.54 
 
 		 277 aa  387  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  62.96 
 
 		 274 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  66.42 
 
 		 271 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  62.59 
 
 		 274 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  70.3 
 
 		 273 aa  377  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  64.39 
 
 		 282 aa  362  4e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  65.4 
 
 		 275 aa  359  3e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  62.22 
 
 		 276 aa  358  5e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  63.81 
 
 		 286 aa  358  7e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  63.06 
 
 		 277 aa  356  1.9999999999999998e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  63.77 
 
 		 269 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  63.77 
 
 		 279 aa  352  4e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  61.11 
 
 		 274 aa  347  1e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  61.11 
 
 		 274 aa  345  3e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  58.96 
 
 		 281 aa  342  2.9999999999999997e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  58.11 
 
 		 273 aa  332  6e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  58.58 
 
 		 272 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  58.05 
 
 		 281 aa  327  2.0000000000000001e-88  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  61.75 
 
 		 284 aa  325  3e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  56.55 
 
 		 275 aa  325  6e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  56.93 
 
 		 275 aa  323  2e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  56.18 
 
 		 275 aa  323  2e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  57.14 
 
 		 275 aa  321  8e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  57.09 
 
 		 273 aa  317  1e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  56.63 
 
 		 286 aa  316  2e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  56.34 
 
 		 689 aa  312  3.9999999999999997e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  58.74 
 
 		 279 aa  311  4.999999999999999e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  61.94 
 
 		 278 aa  311  7.999999999999999e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  57.84 
 
 		 275 aa  310  2e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  50.75 
 
 		 279 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  52.12 
 
 		 265 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  51.82 
 
 		 309 aa  282  4.0000000000000003e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  52.01 
 
 		 297 aa  273  3e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.04 
 
 		 555 aa  271  8.000000000000001e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  48.73 
 
 		 303 aa  271  9e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  53.94 
 
 		 280 aa  269  4e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  50.37 
 
 		 273 aa  268  5.9999999999999995e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  48.38 
 
 		 303 aa  265  5e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  48.72 
 
 		 297 aa  265  7e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  49.44 
 
 		 303 aa  262  4e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  47.17 
 
 		 276 aa  259  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  49.08 
 
 		 301 aa  258  9e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  48.51 
 
 		 280 aa  257  1e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  48.09 
 
 		 270 aa  258  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0874  Transketolase domain protein  48.36 
 
 		 281 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  hitchhiker  0.00151524 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0976  Transketolase domain protein  48.91 
 
 		 285 aa  251  9.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160297  normal  0.0621663 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  48.88 
 
 		 280 aa  251  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1576  Transketolase domain protein  50.56 
 
 		 280 aa  251  1e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  46.79 
 
 		 277 aa  249  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  47.73 
 
 		 302 aa  249  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  45.15 
 
 		 311 aa  249  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  46.77 
 
 		 263 aa  249  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  44.07 
 
 		 289 aa  248  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  48.87 
 
 		 606 aa  247  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  46.42 
 
 		 269 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  45.49 
 
 		 274 aa  245  6e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  47.46 
 
 		 297 aa  244  8e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  46.84 
 
 		 280 aa  243  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  46.04 
 
 		 269 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1184  Transketolase domain protein  49.26 
 
 		 305 aa  242  5e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  45.39 
 
 		 277 aa  242  5e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  44.03 
 
 		 294 aa  242  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  46.99 
 
 		 271 aa  241  7e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  45.49 
 
 		 288 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  43.33 
 
 		 281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  43.61 
 
 		 278 aa  239  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  45.52 
 
 		 624 aa  237  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2936  Transketolase domain protein  46.74 
 
 		 285 aa  236  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00870  transketolase, N-terminal subunit  46.47 
 
 		 293 aa  235  5.0000000000000005e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  46.59 
 
 		 291 aa  235  6e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  46.74 
 
 		 278 aa  232  6e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  43.61 
 
 		 281 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0861  Transketolase domain protein  46.13 
 
 		 299 aa  230  2e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  44.24 
 
 		 629 aa  229  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1540  transketolase domain-containing protein  47.76 
 
 		 282 aa  228  6e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.220485  normal  0.477158 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1017  transketolase subunit A  49.26 
 
 		 303 aa  228  7e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  44.98 
 
 		 630 aa  228  8e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  44.4 
 
 		 276 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2843  transketolase subunit A  43.4 
 
 		 276 aa  226  4e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.140333  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2527  transketolase domain protein  44.4 
 
 		 276 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.336828 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2582  transketolase domain-containing protein  44.4 
 
 		 276 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  45.11 
 
 		 282 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2482  transketolase domain protein  44.4 
 
 		 276 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  41.57 
 
 		 276 aa  223  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2570  transketolase domain protein  44 
 
 		 276 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.479984  normal  0.537174 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  45.35 
 
 		 640 aa  223  3e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  43.54 
 
 		 621 aa  221  7e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  45.32 
 
 		 618 aa  221  7e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0728  transketolase domain-containing protein  43.87 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4931  transketolase domain-containing protein  47.52 
 
 		 281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0049  transketolase  45.35 
 
 		 626 aa  218  7.999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  46.43 
 
 		 283 aa  218  7.999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3642  transketolase domain-containing protein  44.76 
 
 		 281 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0863468 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2614  transketolase domain-containing protein  43.12 
 
 		 285 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.336925  normal  0.70131 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4274  transketolase domain-containing protein  43.45 
 
 		 287 aa  218  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6423  transketolase-like  47.52 
 
 		 281 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>