More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5660 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  100 
 
 		 294 aa  599  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  76.49 
 
 		 311 aa  454  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  74.47 
 
 		 289 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  54.65 
 
 		 291 aa  313  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  47.58 
 
 		 277 aa  261  8e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  45.35 
 
 		 271 aa  255  5e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  44.73 
 
 		 279 aa  253  3e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  44.03 
 
 		 272 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  43.61 
 
 		 273 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  47.21 
 
 		 273 aa  245  6e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  47.39 
 
 		 271 aa  242  3.9999999999999997e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  44.03 
 
 		 271 aa  242  6e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  44.49 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  39.93 
 
 		 282 aa  232  4.0000000000000004e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  39.78 
 
 		 274 aa  231  8.000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  43.12 
 
 		 275 aa  231  9e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  39.78 
 
 		 274 aa  231  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  42.64 
 
 		 281 aa  230  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  41.47 
 
 		 284 aa  226  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  39.33 
 
 		 269 aa  225  6e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  42.75 
 
 		 276 aa  225  8e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  42.59 
 
 		 277 aa  224  9e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  43.64 
 
 		 278 aa  221  9.999999999999999e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  38.87 
 
 		 286 aa  218  7e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  43.63 
 
 		 275 aa  218  7e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  40.68 
 
 		 274 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  39.92 
 
 		 274 aa  215  7e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  38.89 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  41.6 
 
 		 270 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  39.63 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  38.66 
 
 		 273 aa  211  1e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  42.22 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  41.37 
 
 		 277 aa  209  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  39.05 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  39.33 
 
 		 275 aa  206  3e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  38.41 
 
 		 281 aa  206  4e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  39.12 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  43.91 
 
 		 279 aa  204  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  38.95 
 
 		 275 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  37.31 
 
 		 272 aa  204  2e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  37.09 
 
 		 281 aa  203  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  38.95 
 
 		 275 aa  202  5e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  44.44 
 
 		 283 aa  202  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0795  Transketolase domain protein  38.75 
 
 		 273 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  36.36 
 
 		 275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  38.52 
 
 		 274 aa  198  7e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  39.47 
 
 		 302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  37.24 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  39.63 
 
 		 282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  39.78 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  36.68 
 
 		 265 aa  195  8.000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  39.54 
 
 		 263 aa  193  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  37.59 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  39.15 
 
 		 297 aa  189  5e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  41.92 
 
 		 309 aa  189  5.999999999999999e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  38.49 
 
 		 689 aa  189  7e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  36.15 
 
 		 288 aa  189  7e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  35.79 
 
 		 273 aa  186  4e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  36.16 
 
 		 555 aa  186  5e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1587  transketolase, N-terminal subunit  36.43 
 
 		 252 aa  186  5e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  35.07 
 
 		 269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  37.78 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1017  transketolase subunit A  39.78 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  38.34 
 
 		 276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  37.04 
 
 		 303 aa  182  8.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2482  transketolase domain protein  37.94 
 
 		 276 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0615  transketolase subunit A  36.43 
 
 		 268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2527  transketolase domain protein  37.55 
 
 		 276 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.336828 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2582  transketolase domain-containing protein  37.55 
 
 		 276 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  35.56 
 
 		 277 aa  179  4.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  33.83 
 
 		 269 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2288  transketolase domain-containing protein  38.87 
 
 		 268 aa  178  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  34.91 
 
 		 271 aa  178  7e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2570  transketolase domain protein  37.55 
 
 		 276 aa  178  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.479984  normal  0.537174 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  33.58 
 
 		 278 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1184  Transketolase domain protein  39.64 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2843  transketolase subunit A  38.74 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.140333  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1716  Transketolase domain protein  38.1 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3529  Transketolase domain protein  36.76 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  37.4 
 
 		 280 aa  175  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  35.47 
 
 		 640 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1894  transketolase  34.81 
 
 		 280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737367 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3643  Transketolase domain protein  36.5 
 
 		 267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  35.27 
 
 		 276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0861  Transketolase domain protein  37.17 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  36.36 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  36.36 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3249  putative transketolase. N-terminal subunit  36.36 
 
 		 276 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3311  Transketolase domain protein  33.94 
 
 		 279 aa  168  9e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  36.6 
 
 		 606 aa  168  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  33.33 
 
 		 281 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4274  transketolase domain-containing protein  34.46 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  34.87 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0976  Transketolase domain protein  34.87 
 
 		 285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160297  normal  0.0621663 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2514  transketolase subunit A  36.15 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  34.08 
 
 		 280 aa  166  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0407  Transketolase domain protein  34.43 
 
 		 307 aa  165  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3957  transketolase subunit A  35.77 
 
 		 302 aa  165  8e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132979  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00870  transketolase, N-terminal subunit  33.81 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1540  transketolase domain-containing protein  35.06 
 
 		 282 aa  163  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.220485  normal  0.477158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>