More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0795 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0795  Transketolase domain protein  100 
 
 		 273 aa  559  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0615  transketolase subunit A  54.1 
 
 		 268 aa  284  1.0000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  43.87 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  42.37 
 
 		 291 aa  210  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  38.91 
 
 		 289 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  39.93 
 
 		 286 aa  202  5e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  38.75 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  39.03 
 
 		 276 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  43.64 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  39.47 
 
 		 311 aa  192  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  38.81 
 
 		 277 aa  191  9e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  38.66 
 
 		 274 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  40.08 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  36.98 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  37.92 
 
 		 274 aa  186  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  38.87 
 
 		 272 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  37.22 
 
 		 281 aa  185  8e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  36.06 
 
 		 271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  40.59 
 
 		 273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  38.11 
 
 		 275 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  35.54 
 
 		 286 aa  181  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  41.13 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  37.74 
 
 		 275 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  36.51 
 
 		 281 aa  178  8e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  39.02 
 
 		 270 aa  178  9e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  37.36 
 
 		 275 aa  178  9e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  37.59 
 
 		 277 aa  177  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  39.16 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  40.07 
 
 		 278 aa  177  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  37.74 
 
 		 273 aa  176  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  42.04 
 
 		 282 aa  175  6e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  35.71 
 
 		 275 aa  175  8e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  39.83 
 
 		 275 aa  170  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  35.85 
 
 		 273 aa  170  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  38.49 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1540  transketolase domain-containing protein  38.34 
 
 		 282 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.220485  normal  0.477158 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  38.31 
 
 		 263 aa  169  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0407  Transketolase domain protein  37.26 
 
 		 307 aa  170  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  39.41 
 
 		 271 aa  170  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  34.57 
 
 		 274 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  34.57 
 
 		 274 aa  169  7e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  38.49 
 
 		 284 aa  168  8e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  39.57 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  37.39 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  38.56 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  36.63 
 
 		 280 aa  166  5e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  31.72 
 
 		 288 aa  165  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2288  transketolase domain-containing protein  35.34 
 
 		 268 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1192  transketolase-like  36.03 
 
 		 301 aa  163  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.437056 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  36.09 
 
 		 275 aa  163  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  35.58 
 
 		 273 aa  162  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  37.5 
 
 		 273 aa  162  6e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4274  transketolase domain-containing protein  37.08 
 
 		 287 aa  162  6e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  37.28 
 
 		 297 aa  161  9e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2719  transketolase subunit A  36.5 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  42.02 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  37.83 
 
 		 279 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  37.66 
 
 		 277 aa  159  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  35.32 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4382  Transketolase domain protein  35.19 
 
 		 285 aa  159  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2482  transketolase domain protein  37.45 
 
 		 276 aa  158  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  37.45 
 
 		 276 aa  158  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  37.55 
 
 		 303 aa  158  9e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2582  transketolase domain-containing protein  37.45 
 
 		 276 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2527  transketolase domain protein  37.45 
 
 		 276 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.336828 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  35.98 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5276  transketolase domain-containing protein  35.96 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2843  transketolase subunit A  36.47 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.140333  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3311  Transketolase domain protein  35.79 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  36.2 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3957  transketolase subunit A  35.71 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.132979  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  39.31 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  35.46 
 
 		 276 aa  155  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  33.71 
 
 		 280 aa  155  9e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2570  transketolase domain protein  37.07 
 
 		 276 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.479984  normal  0.537174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0260  Transketolase domain protein  35.45 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.509651 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  34.54 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5877  transketolase domain-containing protein  35.38 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4990  transketolase domain-containing protein  35.14 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  37.71 
 
 		 689 aa  153  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6423  transketolase-like  35.55 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6658  transketolase domain-containing protein  35.55 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6256  transketolase domain-containing protein  35.16 
 
 		 281 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4777  transketolase, N-terminal  35.32 
 
 		 281 aa  152  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  34.96 
 
 		 269 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0341  Transketolase domain protein  37.84 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2745  transketolase domain-containing protein  34.83 
 
 		 286 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.498347  normal  0.112141 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1276  Transketolase domain protein  33.97 
 
 		 274 aa  150  3e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1716  Transketolase domain protein  39.33 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1879  transketolase subunit A  36.95 
 
 		 273 aa  149  3e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  37.72 
 
 		 281 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4931  transketolase domain-containing protein  35.41 
 
 		 281 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2366  Transketolase domain protein  35.14 
 
 		 286 aa  149  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.95971  normal  0.0469073 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0717  transketolase domain-containing protein  35.74 
 
 		 298 aa  149  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  32.33 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4412  transketolase domain-containing protein  34.77 
 
 		 281 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0693677 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  35.89 
 
 		 297 aa  149  5e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3642  transketolase domain-containing protein  33.58 
 
 		 281 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0863468 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1107  Transketolase domain protein  35.57 
 
 		 303 aa  149  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  34.88 
 
 		 309 aa  148  8e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>