More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2443 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  100 
 
 		 278 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1924  transketolase domain-containing protein  49.25 
 
 		 281 aa  243  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  46.92 
 
 		 271 aa  237  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  46.92 
 
 		 275 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0245  Transketolase domain protein  46.48 
 
 		 265 aa  233  3e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.411817  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  46.99 
 
 		 277 aa  233  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  46.92 
 
 		 275 aa  233  3e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  47.78 
 
 		 279 aa  232  6e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  46.74 
 
 		 271 aa  232  6e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  46.01 
 
 		 276 aa  231  9e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  46.48 
 
 		 281 aa  231  1e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  47.81 
 
 		 269 aa  229  3e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  46.15 
 
 		 275 aa  229  3e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2127  Transketolase domain protein  44.75 
 
 		 276 aa  229  5e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.359071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  46.69 
 
 		 272 aa  228  7e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  45.7 
 
 		 274 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  45.7 
 
 		 274 aa  226  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  43.56 
 
 		 273 aa  226  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  45.95 
 
 		 277 aa  226  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2799  Transketolase domain protein  44.44 
 
 		 274 aa  226  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  45.16 
 
 		 282 aa  226  4e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1131  transketolase domain-containing protein  44.89 
 
 		 280 aa  225  7e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  44.7 
 
 		 286 aa  224  9e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2401  transketolase, N-terminal subunit  49.15 
 
 		 278 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.488371  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0406  transketolase domain-containing protein  44.4 
 
 		 302 aa  222  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.186012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  45.11 
 
 		 273 aa  221  8e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  42.65 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  46.37 
 
 		 281 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  44.57 
 
 		 274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  45.49 
 
 		 275 aa  219  3e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  44.19 
 
 		 274 aa  219  5e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  41.09 
 
 		 279 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  45.77 
 
 		 275 aa  219  6e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2255  Transketolase domain protein  44.79 
 
 		 269 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.158936  normal  0.0249782 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  45 
 
 		 272 aa  216  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2033  Transketolase domain protein  44.02 
 
 		 269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3128  transketolase domain-containing protein  44.8 
 
 		 281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1059  transketolase subunit A  45.1 
 
 		 277 aa  210  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579948 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3643  Transketolase domain protein  45.19 
 
 		 267 aa  209  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2647  Transketolase domain protein  46.81 
 
 		 276 aa  209  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.142698  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  43.68 
 
 		 271 aa  209  5e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3249  putative transketolase. N-terminal subunit  45.34 
 
 		 276 aa  206  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0911  putative transketolase. N-terminal subunit  45.34 
 
 		 276 aa  206  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3383  transketolase domain-containing protein  45.34 
 
 		 276 aa  206  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  43.46 
 
 		 273 aa  205  7e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  44.14 
 
 		 279 aa  205  8e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  44.02 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3529  Transketolase domain protein  44.24 
 
 		 267 aa  203  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  43.66 
 
 		 278 aa  202  5e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  41.26 
 
 		 275 aa  201  8e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  44.86 
 
 		 273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2214  transketolase subunit A  41.67 
 
 		 284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000519395  hitchhiker  0.000381558 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3398  Transketolase domain protein  42.4 
 
 		 263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14541  N-terminal subunit of transketolase  40.44 
 
 		 288 aa  195  7e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2482  transketolase domain protein  42.62 
 
 		 276 aa  195  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0790989  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2527  transketolase domain protein  42.21 
 
 		 276 aa  194  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.336828 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2582  transketolase domain-containing protein  42.21 
 
 		 276 aa  194  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2570  transketolase domain protein  42.21 
 
 		 276 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.479984  normal  0.537174 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  39.33 
 
 		 689 aa  192  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2690  transketolase domain-containing protein  42.21 
 
 		 276 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.277704 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3365  Transketolase domain protein  43.5 
 
 		 277 aa  188  7e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3950  Transketolase domain protein  39.04 
 
 		 291 aa  188  7e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804929  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1528  Transketolase domain protein  40.3 
 
 		 297 aa  188  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1147  Transketolase domain protein  40.15 
 
 		 271 aa  186  3e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  37.59 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4222  transketolase subunit A  39.53 
 
 		 270 aa  186  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2042  transketolase domain-containing protein  39.31 
 
 		 311 aa  185  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.71288 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2843  transketolase subunit A  40.57 
 
 		 276 aa  185  9e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.140333  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6294  Transketolase domain protein  43.95 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0299  ribulose-phosphate 3-epimerase  38.91 
 
 		 555 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0242597 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4664  transketolase domain-containing protein  38.52 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2288  transketolase domain-containing protein  36.33 
 
 		 268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0339  Transketolase domain protein  39.83 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5636  transketolase subunit A  40 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  37.78 
 
 		 623 aa  176  3e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0181  transketolase subunit A  40.93 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0615  transketolase subunit A  36.58 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0199  transketolase, N-terminal subunit  37.83 
 
 		 285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1373  Transketolase domain protein  37.36 
 
 		 303 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.160442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0391  Transketolase domain protein  38.52 
 
 		 280 aa  171  9e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0504613 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  39.77 
 
 		 618 aa  171  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  39.7 
 
 		 621 aa  171  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1587  transketolase, N-terminal subunit  37.15 
 
 		 252 aa  170  3e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1437  transketolase-like  36.78 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0795  Transketolase domain protein  37.39 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5660  Transketolase domain protein  34.87 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1190  Transketolase domain protein  36.43 
 
 		 303 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00778844  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1302  transketolase  39.74 
 
 		 653 aa  165  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0226315  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1793  transketolase subunit A  37.91 
 
 		 297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0143837  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1776  transketolase domain-containing protein  39.56 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1817  transketolase  38.4 
 
 		 632 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0874  Transketolase domain protein  38.28 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  hitchhiker  0.00151524 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0341  Transketolase domain protein  37.45 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1636  transketolase  38.4 
 
 		 632 aa  163  3e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1933  transketolase  37.96 
 
 		 656 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2005  transketolase  38.02 
 
 		 632 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0069  transketolase  38.93 
 
 		 633 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.317261  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  39.84 
 
 		 624 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1576  Transketolase domain protein  37.74 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0861  Transketolase domain protein  38.68 
 
 		 299 aa  160  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>