More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1302 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1302  transketolase  100 
 
 		 653 aa  1353    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0226315  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  49.46 
 
 		 640 aa  619  1e-176  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1130  Transketolase central region  47.85 
 
 		 648 aa  521  1e-146  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  44.18 
 
 		 618 aa  511  1e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1062  transketolase  44.95 
 
 		 635 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1050  transketolase  44.95 
 
 		 635 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  43.67 
 
 		 623 aa  504  1e-141  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1946  transketolase  42.35 
 
 		 631 aa  498  1e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120337  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  32.59 
 
 		 689 aa  267  4e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  30.8 
 
 		 629 aa  260  7e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  31.18 
 
 		 630 aa  256  1.0000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  29.29 
 
 		 624 aa  254  3e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  31.01 
 
 		 606 aa  248  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0049  transketolase  31.9 
 
 		 626 aa  248  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  29.47 
 
 		 621 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3317  transketolase  32.4 
 
 		 612 aa  232  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1278  transketolase  29.38 
 
 		 624 aa  231  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36720  transketolase  31.61 
 
 		 614 aa  226  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148891  normal  0.641961 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2123  transketolase  28.97 
 
 		 627 aa  224  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  49.21 
 
 		 279 aa  223  7e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  30.95 
 
 		 592 aa  220  6e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  43.8 
 
 		 282 aa  219  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  47.35 
 
 		 272 aa  217  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  43.4 
 
 		 286 aa  213  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4832  transketolase  30.1 
 
 		 639 aa  211  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  44.49 
 
 		 281 aa  205  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  42.97 
 
 		 271 aa  204  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  42.31 
 
 		 271 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2919  transketolase, N-terminal subunit  45.04 
 
 		 277 aa  201  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0491  transketolase domain-containing protein  44.4 
 
 		 276 aa  200  7e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  42.01 
 
 		 277 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0264  Transketolase domain protein  44.27 
 
 		 274 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00137267 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0279  Transketolase domain protein  44.27 
 
 		 274 aa  198  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000402099  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  40.44 
 
 		 273 aa  196  9e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1503  transketolase domain-containing protein  40.37 
 
 		 272 aa  196  1e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0294001  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17580  transketolase  29.33 
 
 		 622 aa  192  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.569597  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2078  transketolase domain-containing protein  44.23 
 
 		 271 aa  192  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1552  transketolase domain-containing protein  40.7 
 
 		 275 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0367  transketolase domain-containing protein  40.31 
 
 		 275 aa  191  5e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0144552 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4061  Transketolase domain protein  28.75 
 
 		 637 aa  190  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  39.56 
 
 		 269 aa  190  7e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0469  transketolase subunit A  39.53 
 
 		 275 aa  190  9e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.125923  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  39.49 
 
 		 274 aa  189  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  39.49 
 
 		 274 aa  189  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1998  Transketolase domain protein  45.17 
 
 		 279 aa  187  4e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  hitchhiker  0.00336505 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0172  Transketolase domain protein  40.23 
 
 		 273 aa  186  1.0000000000000001e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.906394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0469  Transketolase domain protein  46.54 
 
 		 273 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.833145  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  44.4 
 
 		 273 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05480  transketolase subunit A  40.54 
 
 		 275 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4506  Transketolase domain protein  27.31 
 
 		 637 aa  183  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0440  transketolase  39.69 
 
 		 275 aa  182  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.707668  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00040  transketolase, putative  27.12 
 
 		 673 aa  182  2e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.214798  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  40.31 
 
 		 281 aa  182  2e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2307  transketolase  29.25 
 
 		 662 aa  180  5.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0505074 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0243  transketolase-like protein  40.77 
 
 		 275 aa  180  5.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3879  transketolase-like  38.68 
 
 		 279 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.521893  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1308  transketolase  30.66 
 
 		 675 aa  178  3e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0202  transketolase  30.93 
 
 		 636 aa  178  3e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0334  Transketolase domain protein  38.29 
 
 		 286 aa  177  4e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  37.06 
 
 		 306 aa  177  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  30.15 
 
 		 682 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1968  transketolase  27.71 
 
 		 655 aa  176  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09030  transketolase subunit A  40.54 
 
 		 278 aa  176  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.169995  normal  0.0273628 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  28.3 
 
 		 668 aa  176  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0946  transketolase  29.24 
 
 		 665 aa  176  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0259  transketolase  27.79 
 
 		 680 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.336202 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3415  transketolase  26.63 
 
 		 662 aa  175  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  35.24 
 
 		 315 aa  174  5e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  26.88 
 
 		 666 aa  174  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  26.88 
 
 		 666 aa  174  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0851  transketolase  30.89 
 
 		 660 aa  174  6.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0149061  normal  0.206532 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0721  transketolase-like  26.97 
 
 		 636 aa  173  9e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953782  normal  0.877406 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  26.32 
 
 		 666 aa  172  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  27.68 
 
 		 668 aa  172  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0338  transketolase  25.45 
 
 		 639 aa  172  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.025251  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0444  Transketolase central region  28.43 
 
 		 636 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_584  transketolase  26.88 
 
 		 666 aa  172  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1467  Transketolase domain protein  37.17 
 
 		 273 aa  171  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1933  transketolase  26.76 
 
 		 656 aa  171  3e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2804  transketolase  28.07 
 
 		 665 aa  170  8e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  29.62 
 
 		 664 aa  170  9e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3922  transketolase  29.93 
 
 		 695 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  32.49 
 
 		 314 aa  169  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4499  transketolase  29.92 
 
 		 688 aa  169  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2594  transketolase  27.55 
 
 		 681 aa  169  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0069  transketolase  28.92 
 
 		 636 aa  169  2e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.874951  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1735  transketolase  30.25 
 
 		 636 aa  168  2e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00492424  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14410  transketolase  26.73 
 
 		 660 aa  168  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2336  transketolase  27.42 
 
 		 666 aa  167  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000657537  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  33.64 
 
 		 317 aa  167  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0487  transketolase  27.69 
 
 		 667 aa  167  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03290  transketolase  26.76 
 
 		 661 aa  167  6.9999999999999995e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2430  transketolase  29.92 
 
 		 660 aa  166  9e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5124  transketolase  29.08 
 
 		 671 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  33.33 
 
 		 318 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0333  Transketolase domain protein  37.54 
 
 		 309 aa  165  2.0000000000000002e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4112  transketolase  27.35 
 
 		 693 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2443  transketolase subunit A  39.74 
 
 		 278 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0220  transketolase  26.55 
 
 		 681 aa  165  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103383 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3440  transketolase  32.03 
 
 		 686 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>