More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2123 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_3317  transketolase  58.42 
 
 		 612 aa  637    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0415  Transketolase central region  63.49 
 
 		 624 aa  793    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1655  transketolase  61.5 
 
 		 629 aa  755    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4832  transketolase  62.18 
 
 		 639 aa  722    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36720  transketolase  59.52 
 
 		 614 aa  689    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148891  normal  0.641961 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1278  transketolase  84.87 
 
 		 624 aa  1045    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0419  transketolase central region  58.87 
 
 		 630 aa  726    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218492  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2123  transketolase  100 
 
 		 627 aa  1248    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0049  transketolase  61.1 
 
 		 626 aa  729    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17580  transketolase  67.53 
 
 		 622 aa  764    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.569597  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2381  transketolase  44.02 
 
 		 621 aa  520  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.652214  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0268  transketolase  45.69 
 
 		 606 aa  501  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2307  transketolase  40.06 
 
 		 662 aa  360  4e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0505074 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0183  transketolase  29.83 
 
 		 640 aa  279  1e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  32.25 
 
 		 592 aa  258  2e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2237  transketolase  31.28 
 
 		 689 aa  257  5e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1753  transketolase  30.08 
 
 		 618 aa  256  8e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.599828  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1946  transketolase  28.82 
 
 		 631 aa  244  1.9999999999999999e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120337  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1680  transketolase  29.65 
 
 		 623 aa  243  1e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1302  transketolase  29.13 
 
 		 653 aa  234  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0226315  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1062  transketolase  30.05 
 
 		 635 aa  233  6e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1050  transketolase  30.05 
 
 		 635 aa  233  6e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1130  Transketolase central region  31.01 
 
 		 648 aa  220  6e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0202  transketolase  27.77 
 
 		 636 aa  211  2e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0069  transketolase  27.88 
 
 		 633 aa  210  5e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.317261  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0069  transketolase  27.14 
 
 		 636 aa  208  3e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.874951  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  37.42 
 
 		 317 aa  205  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0444  Transketolase central region  30.31 
 
 		 636 aa  203  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0968  transketolase domain-containing protein  42.07 
 
 		 273 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1817  transketolase  26.35 
 
 		 632 aa  200  5e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1636  transketolase  25.89 
 
 		 632 aa  200  6e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  36.86 
 
 		 306 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3125  transketolase  30.12 
 
 		 664 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0116  transketolase  27.53 
 
 		 634 aa  199  1.0000000000000001e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.984177  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  37.46 
 
 		 311 aa  199  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2102  transketolase  30.86 
 
 		 668 aa  198  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000131444  normal  0.204144 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2005  transketolase  26.1 
 
 		 632 aa  198  3e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  38.1 
 
 		 313 aa  196  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2060  Transketolase domain protein  39.86 
 
 		 282 aa  196  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  37.14 
 
 		 314 aa  196  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  37.14 
 
 		 314 aa  196  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1904  transketolase  28.42 
 
 		 668 aa  195  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0236  transketolase subunit A  44.81 
 
 		 271 aa  194  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0287  transketolase  40.07 
 
 		 274 aa  193  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  39.81 
 
 		 313 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  41.96 
 
 		 313 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0292  putative transketolase, N-terminal subunit  40.07 
 
 		 274 aa  192  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  40.38 
 
 		 318 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  37.97 
 
 		 311 aa  191  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3805  transketolase  30.36 
 
 		 665 aa  191  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.496968 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1735  transketolase  26.83 
 
 		 636 aa  190  8e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00492424  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0712  Transketolase domain protein  41.76 
 
 		 281 aa  190  8e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0142999  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  40.76 
 
 		 319 aa  190  9e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3753  transketolase  29.3 
 
 		 675 aa  189  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  37.9 
 
 		 312 aa  188  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1933  transketolase  27.68 
 
 		 656 aa  186  8e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5124  transketolase  31.26 
 
 		 671 aa  186  9e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  39.49 
 
 		 321 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2902  transketolase  29.53 
 
 		 666 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0472  transketolase  32.02 
 
 		 682 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3968  Transketolase domain protein  42.01 
 
 		 272 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000279469  unclonable  0.000000000126614 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  35.37 
 
 		 305 aa  184  3e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3075  transketolase domain-containing protein  39.93 
 
 		 271 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0025975  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  40.89 
 
 		 314 aa  184  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  27.26 
 
 		 697 aa  184  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4745  Transketolase domain protein  40.3 
 
 		 277 aa  184  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1015  transketolase  30.07 
 
 		 661 aa  183  7e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  37.26 
 
 		 327 aa  183  8.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  29.51 
 
 		 663 aa  182  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2430  transketolase  29.03 
 
 		 660 aa  182  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1382  Transketolase domain protein  39.25 
 
 		 269 aa  182  2e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2720  transketolase, N-terminal subunit  40.48 
 
 		 273 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2704  transketolase subunit A  39.93 
 
 		 281 aa  181  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000372386  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  28.16 
 
 		 694 aa  181  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1861  Transketolase domain protein  43.49 
 
 		 279 aa  181  4.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1220  transketolase  29.44 
 
 		 677 aa  180  7e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0949  transketolase  30.66 
 
 		 671 aa  180  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2108  transketolase  28.98 
 
 		 684 aa  180  7e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159274 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  39.62 
 
 		 311 aa  180  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  38.96 
 
 		 325 aa  180  8e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14410  transketolase  27.32 
 
 		 660 aa  179  9e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  37.06 
 
 		 310 aa  179  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03290  transketolase  27.73 
 
 		 661 aa  179  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  33.75 
 
 		 318 aa  179  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3228  transketolase  28.89 
 
 		 665 aa  179  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0851  transketolase  28.39 
 
 		 660 aa  179  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0149061  normal  0.206532 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1052  transketolase  29.44 
 
 		 671 aa  179  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.25792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1513  transketolase  30.86 
 
 		 684 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00869632  decreased coverage  0.000119249 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3074  transketolase  30.43 
 
 		 663 aa  179  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.851073  normal  0.318861 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3922  transketolase  27.86 
 
 		 695 aa  178  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0551  transketolase subunit A  40.14 
 
 		 286 aa  178  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  40.44 
 
 		 308 aa  178  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2897  transketolase  29.77 
 
 		 673 aa  178  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.715416  normal  0.0202712 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0103  transketolase  28.74 
 
 		 662 aa  178  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  36.74 
 
 		 310 aa  177  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0841  transketolase  28.41 
 
 		 679 aa  177  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1275  transketolase  30.07 
 
 		 672 aa  177  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.11718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0465  transketolase  26 
 
 		 663 aa  177  5e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  40.92 
 
 		 311 aa  177  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  27.82 
 
 		 680 aa  177  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>