More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3074 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  100 
 
 		 313 aa  630  1e-180  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  75.64 
 
 		 313 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  68.87 
 
 		 306 aa  433  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  65.59 
 
 		 314 aa  425  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  65.59 
 
 		 314 aa  425  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2077  transketolase, central region  70.68 
 
 		 308 aa  424  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0470  Transketolase central region  71.57 
 
 		 318 aa  421  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4744  Transketolase central region  71.43 
 
 		 311 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  63.46 
 
 		 312 aa  402  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  64.74 
 
 		 321 aa  398  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  60.59 
 
 		 317 aa  391  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  59.68 
 
 		 311 aa  387  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  62.46 
 
 		 310 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  62.14 
 
 		 310 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2719  transketolase, C-terminal subunit  64.61 
 
 		 311 aa  378  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0552  transketolase subunit B  64.1 
 
 		 314 aa  374  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  57.23 
 
 		 313 aa  372  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2705  transketolase subunit B  62.94 
 
 		 311 aa  373  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194197  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  65.37 
 
 		 311 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  59.4 
 
 		 306 aa  363  1e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  58.17 
 
 		 305 aa  362  5.0000000000000005e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2918  transketolase, C-terminal subunit  62.94 
 
 		 314 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  54.18 
 
 		 327 aa  335  3.9999999999999995e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  53.9 
 
 		 313 aa  335  7e-91  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  55.1 
 
 		 315 aa  333  2e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0300  transketolase central region  51.44 
 
 		 324 aa  333  2e-90  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0477096 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  54.7 
 
 		 327 aa  329  4e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  54.36 
 
 		 326 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  54.36 
 
 		 327 aa  328  6e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  54.03 
 
 		 327 aa  328  8e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  55.41 
 
 		 312 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  50.8 
 
 		 318 aa  326  3e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  52.56 
 
 		 319 aa  325  7e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  53.53 
 
 		 315 aa  324  1e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  52.06 
 
 		 325 aa  324  1e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  51.62 
 
 		 322 aa  323  2e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  53.02 
 
 		 326 aa  322  5e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  53.69 
 
 		 327 aa  320  3e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2935  Transketolase central region  52.09 
 
 		 317 aa  319  3.9999999999999996e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  54.28 
 
 		 312 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  54.1 
 
 		 312 aa  318  6e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0860  Transketolase domain protein  52.24 
 
 		 310 aa  317  2e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.476833  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0975  Transketolase central region  50.32 
 
 		 317 aa  317  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.127122  normal  0.063318 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  51.15 
 
 		 317 aa  315  7e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  53.44 
 
 		 312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  48.21 
 
 		 320 aa  311  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  53.07 
 
 		 321 aa  310  2.9999999999999997e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2019  Transketolase central region  50 
 
 		 320 aa  308  9e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.6126  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  52.08 
 
 		 314 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1527  Transketolase central region  50.66 
 
 		 319 aa  293  3e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  50.16 
 
 		 317 aa  289  5.0000000000000004e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0338  Transketolase central region  50.33 
 
 		 319 aa  285  5.999999999999999e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  48.34 
 
 		 336 aa  280  2e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0334  Transketolase central region  53.38 
 
 		 308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  45.36 
 
 		 312 aa  273  2.0000000000000002e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  47.02 
 
 		 592 aa  270  2e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1468  Transketolase central region  43.91 
 
 		 314 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  46.56 
 
 		 318 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3878  transketolase, central region  46.1 
 
 		 342 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  47.49 
 
 		 322 aa  252  5.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  46.25 
 
 		 314 aa  250  2e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1277  Transketolase central region  44.22 
 
 		 313 aa  249  3e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  46.58 
 
 		 314 aa  249  4e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  45.7 
 
 		 322 aa  247  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  45.28 
 
 		 314 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1792  transketolase subunit B  44.48 
 
 		 310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  46.94 
 
 		 318 aa  242  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2842  transketolase subunit B  43.01 
 
 		 317 aa  239  4e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.837175  normal  0.299247 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  44.66 
 
 		 314 aa  238  8e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  39.94 
 
 		 313 aa  238  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2569  transketolase domain protein  43.86 
 
 		 317 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.126502  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2481  transketolase domain protein  43.86 
 
 		 317 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.120495  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  43.09 
 
 		 328 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6295  Transketolase central region  43.79 
 
 		 332 aa  236  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2613  transketolase central region  43.97 
 
 		 333 aa  235  7e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0875571  normal  0.474338 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2581  transketolase domain-containing protein  43.51 
 
 		 317 aa  235  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.230809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2689  transketolase domain-containing protein  43.51 
 
 		 317 aa  235  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2526  transketolase domain protein  43.51 
 
 		 317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3949  Transketolase domain protein  41.53 
 
 		 338 aa  233  3e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5275  transketolase, central region  45.27 
 
 		 335 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6255  transketolase central region  45.12 
 
 		 332 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.156319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4991  transketolase central region  43.38 
 
 		 332 aa  229  7e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3312  Transketolase central region  43.3 
 
 		 332 aa  228  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5637  transketolase subunit B  43.96 
 
 		 307 aa  228  9e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3269  transketolase subunit B  44.37 
 
 		 337 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1539  transketolase central region  44.59 
 
 		 348 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.844968  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3364  Transketolase domain protein  40.4 
 
 		 317 aa  227  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  41.37 
 
 		 323 aa  225  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2718  transketolase subunit B  44.93 
 
 		 340 aa  225  9e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1462  transketolase subunit B  43.38 
 
 		 332 aa  225  9e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.304967 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0486  Transketolase domain protein  39.81 
 
 		 313 aa  225  9e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2744  transketolase central region  43.42 
 
 		 342 aa  225  9e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0728122  normal  0.0592981 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6422  transketolase, central region  44.44 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6657  transketolase, central region  44.44 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4411  transketolase, central region  43.92 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0682016 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4930  transketolase central region  43.77 
 
 		 332 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4275  transketolase central region  43.3 
 
 		 338 aa  223  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4778  transketolase subunit B  43.75 
 
 		 332 aa  222  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2123  transketolase  42.36 
 
 		 627 aa  221  9e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1717  Transketolase central region  41.45 
 
 		 347 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>